68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_2195 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010803  Clim_2195  protein of unknown function DUF77  100 
 
 
101 aa  204  3e-52  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0323  protein of unknown function DUF77  69.39 
 
 
106 aa  144  6e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2389  hypothetical protein  69.39 
 
 
104 aa  141  3e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0214  hypothetical protein  64.65 
 
 
103 aa  133  9.999999999999999e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2030  protein of unknown function DUF77  62.11 
 
 
102 aa  124  6e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.022758 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2261  protein of unknown function DUF77  58.95 
 
 
119 aa  115  1.9999999999999998e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.154166 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2507  hypothetical protein  39.39 
 
 
109 aa  77.8  0.00000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1310  hypothetical protein  37.76 
 
 
99 aa  76.6  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3266  protein of unknown function DUF77  37.37 
 
 
108 aa  75.5  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.794281  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0386  protein of unknown function DUF77  31.63 
 
 
98 aa  75.1  0.0000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000000321713  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2497  hypothetical protein  37.25 
 
 
104 aa  74.3  0.0000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000925165  normal  0.170628 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4983  protein of unknown function DUF77  40.21 
 
 
103 aa  73.2  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.839266  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3604  hypothetical protein  35 
 
 
100 aa  72.8  0.000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2434  hypothetical protein  35.35 
 
 
101 aa  73.2  0.000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.580109  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03360  conserved hypothetical protein TIGR00106  37.37 
 
 
99 aa  72.4  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2552  hypothetical protein  37.37 
 
 
100 aa  70.9  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.405728  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1111  hypothetical protein  38 
 
 
108 aa  70.9  0.000000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2810  protein of unknown function DUF77  39 
 
 
108 aa  70.5  0.000000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.507444  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1297  protein of unknown function DUF77  36.36 
 
 
100 aa  69.7  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0603535  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5150  hypothetical protein  34 
 
 
100 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1183  hypothetical protein  39.8 
 
 
101 aa  68.9  0.00000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0575551  normal  0.068094 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0152  protein of unknown function DUF77  33.33 
 
 
103 aa  68.6  0.00000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.921573  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1638  hypothetical protein  37.37 
 
 
109 aa  68.6  0.00000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0562388  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1604  hypothetical protein  37.37 
 
 
109 aa  68.6  0.00000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0298232  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1398  protein of unknown function DUF77  36.36 
 
 
100 aa  68.6  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0176887  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5161  conserved hypothetical protein TIGR00106  33 
 
 
100 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5155  conserved hypothetical protein TIGR00106  33 
 
 
100 aa  67.8  0.00000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0089  hypothetical protein  33 
 
 
100 aa  67.8  0.00000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5123  conserved hypothetical protein TIGR00106  33 
 
 
100 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5255  hypothetical protein  33 
 
 
100 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.225957  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4840  hypothetical protein  33 
 
 
100 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4738  hypothetical protein  33 
 
 
100 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4723  hypothetical protein  33 
 
 
100 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4881  hypothetical protein  33 
 
 
100 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2264  protein of unknown function DUF77  38.14 
 
 
99 aa  67.8  0.00000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0373  protein of unknown function DUF77  37.5 
 
 
98 aa  67  0.00000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0022  hypothetical protein  36.14 
 
 
101 aa  65.5  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0601173  normal  0.292337 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0353  protein of unknown function DUF77  35.05 
 
 
98 aa  65.5  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000139882 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1933  hypothetical protein  34.38 
 
 
100 aa  65.1  0.0000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.815785  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1562  hypothetical protein  34.02 
 
 
99 aa  62.4  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00729437  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2069  hypothetical protein  37.76 
 
 
101 aa  61.6  0.000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0733  hypothetical protein  30.53 
 
 
100 aa  60.8  0.000000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.144478  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1578  protein of unknown function DUF77  35.35 
 
 
101 aa  60.1  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3001  protein of unknown function DUF77  31.31 
 
 
107 aa  57  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.33139  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_35218  predicted protein  31.96 
 
 
107 aa  54.3  0.0000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.740234  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1804  hypothetical protein  31.33 
 
 
103 aa  53.9  0.0000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0323483  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5148  hypothetical protein  31.11 
 
 
95 aa  53.5  0.0000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11231  hypothetical protein  30.77 
 
 
106 aa  53.9  0.0000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.482567  normal  0.765306 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10243  cell wall biogenesis protein Ecm15, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G09900)  32.97 
 
 
108 aa  53.5  0.0000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.408419  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0207  protein of unknown function DUF77  41.67 
 
 
104 aa  52.8  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11261  hypothetical protein  29.35 
 
 
97 aa  52  0.000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.138665  normal  0.0126539 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1592  hypothetical protein  29 
 
 
98 aa  50.8  0.000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.667986  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3112  protein of unknown function DUF77  33.33 
 
 
100 aa  50.4  0.000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00105544 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0426  hypothetical protein  28.26 
 
 
97 aa  49.7  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.706739  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2182  hypothetical protein  29 
 
 
103 aa  48.9  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000001374  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3164  hypothetical protein  34 
 
 
102 aa  48.1  0.00004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0043943 
 
 
-
 
NC_006691  CNF03500  cell wall organization and biogenesis-related protein, putative  31.25 
 
 
164 aa  47  0.00008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.556439  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2026  protein of unknown function DUF77  36.73 
 
 
103 aa  46.2  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.457632 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2211  protein of unknown function DUF77  36.14 
 
 
108 aa  46.2  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0699  hypothetical protein  26.74 
 
 
95 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.352736  normal  0.0498418 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0743  hypothetical protein  25.81 
 
 
101 aa  44.7  0.0004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.469068 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0429  protein of unknown function DUF77  31.65 
 
 
99 aa  44.3  0.0005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.012919  normal  0.254857 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2334  protein of unknown function DUF77  25.56 
 
 
95 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1327  hypothetical protein  29.79 
 
 
100 aa  42.4  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.758975  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0962  protein of unknown function DUF77  27 
 
 
104 aa  42  0.003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0301197  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0453  protein of unknown function DUF77  33.33 
 
 
97 aa  41.6  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0405628 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1818  protein of unknown function DUF77  35.23 
 
 
104 aa  41.2  0.005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.830639 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0711  hypothetical protein  25.25 
 
 
104 aa  40  0.01  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000813715 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>