More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1114 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_1114  peptidase S26A, signal peptidase I  100 
 
 		 269 aa  555  1e-157  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.747736  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0844  signal peptidase I  52.47 
 
 		 276 aa  279  3e-74  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0800  signal peptidase I  47.37 
 
 		 286 aa  258  7e-68  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1173  signal peptidase I  47.4 
 
 		 285 aa  249  4e-65  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.478468  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0582  signal peptidase I  46.62 
 
 		 282 aa  242  5e-63  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.359862  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0872  signal peptidase I  46.1 
 
 		 282 aa  238  9e-62  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0423773  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1005  signal peptidase I  47.58 
 
 		 283 aa  237  2e-61  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.155968  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0943  signal peptidase I  45.72 
 
 		 282 aa  235  6e-61  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.416981  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1037  signal peptidase I  48.52 
 
 		 278 aa  226  2e-58  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0831  signal peptidase I  41.33 
 
 		 301 aa  226  4e-58  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0438453  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3501  signal peptidase I  33.77 
 
 		 216 aa  138  8.999999999999999e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00001185  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2460  peptidase S26A, signal peptidase I  35.86 
 
 		 270 aa  137  2e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1621  signal peptidase I  34.57 
 
 		 216 aa  135  8e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.617556  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2718  signal peptidase I  35.29 
 
 		 198 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1767  signal peptidase I  37.56 
 
 		 226 aa  132  7.999999999999999e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000654084  normal  0.0637155 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2260  signal peptidase I  32.76 
 
 		 199 aa  131  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1465  signal peptidase I  31.03 
 
 		 262 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1119  signal peptidase I  36.84 
 
 		 240 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.606635  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1398  signal peptidase I  34.47 
 
 		 263 aa  129  7.000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1119  signal peptidase I  34.47 
 
 		 263 aa  129  7.000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0733  peptidase S26A, signal peptidase I  33.48 
 
 		 255 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000686529  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2249  signal peptidase I  33.33 
 
 		 199 aa  126  3e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0016  signal peptidase I  33.91 
 
 		 324 aa  127  3e-28  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.237487  normal  0.297255 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3169  signal peptidase I  33.04 
 
 		 200 aa  126  4.0000000000000003e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.559115  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1053  signal peptidase I  35.74 
 
 		 305 aa  126  4.0000000000000003e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0413438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1853  signal peptidase I  37.13 
 
 		 245 aa  125  6e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.687147  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0879  Signal peptidase I  34.98 
 
 		 305 aa  124  2e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.510509  normal  0.115217 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0282  signal peptidase I  35.98 
 
 		 206 aa  123  4e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0690316  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1882  signal peptidase I  35.06 
 
 		 225 aa  122  5e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1267  signal peptidase I  33.8 
 
 		 222 aa  122  8e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00305059  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2252  peptidase S26A, signal peptidase I  35.32 
 
 		 252 aa  122  8e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.12561  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3240  signal peptidase I  33.76 
 
 		 342 aa  122  8e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.80129  normal  0.013129 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1147  Signal peptidase I  35.65 
 
 		 305 aa  122  8e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000185511  normal  0.576512 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3880  signal peptidase I  35.74 
 
 		 250 aa  121  9.999999999999999e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.954449  normal  0.162563 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1194  signal peptidase I  33.19 
 
 		 324 aa  121  9.999999999999999e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.992009  decreased coverage  0.00558378 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1158  signal peptidase I  35.24 
 
 		 305 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0066351  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5263  signal peptidase I  35.65 
 
 		 325 aa  121  9.999999999999999e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2504  signal peptidase I  33.33 
 
 		 219 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000062636  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0598  signal peptidase I  32.76 
 
 		 214 aa  121  9.999999999999999e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0906  signal peptidase I  35.34 
 
 		 288 aa  120  1.9999999999999998e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.798817  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2328  signal peptidase I  34.63 
 
 		 225 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2330  signal peptidase I  33.04 
 
 		 221 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000787918  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2027  signal peptidase I  32.34 
 
 		 262 aa  119  4.9999999999999996e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0626675  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1630  signal peptidase I  33.18 
 
 		 267 aa  119  4.9999999999999996e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0207153  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3269  signal peptidase I  32.91 
 
 		 322 aa  119  6e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0671154 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3637  signal peptidase I  34.35 
 
 		 325 aa  119  6e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.034698  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0536  signal peptidase I  33.62 
 
 		 221 aa  118  7.999999999999999e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.844954  normal  0.883395 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1061  signal peptidase I  31.62 
 
 		 305 aa  118  9.999999999999999e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.582864  normal  0.298061 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1949  signal peptidase I  31.06 
 
 		 256 aa  118  9.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1242  signal peptidase I  35.22 
 
 		 305 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000742839  unclonable  0.0000000149917 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1036  signal peptidase I  34.76 
 
 		 305 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00141491  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0639  signal peptidase I  35.08 
 
 		 301 aa  118  9.999999999999999e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.602306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0648  signal peptidase I  33.91 
 
 		 322 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0465019  normal  0.157314 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1836  Signal peptidase I  33.62 
 
 		 251 aa  117  1.9999999999999998e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1833  Signal peptidase I  33.19 
 
 		 251 aa  117  1.9999999999999998e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2254  signal peptidase I  32.03 
 
 		 299 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.479389  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1919  peptidase S26A, signal peptidase I  34.89 
 
 		 252 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.455712 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1090  signal peptidase I  33.02 
 
 		 267 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.21498  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1400  signal peptidase I  33.91 
 
 		 321 aa  117  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3063  signal peptidase I  33.48 
 
 		 325 aa  117  1.9999999999999998e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0636923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2873  signal peptidase I  34.45 
 
 		 259 aa  117  1.9999999999999998e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0125628 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1617  signal peptidase I  33.91 
 
 		 219 aa  116  3e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00286894  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0412  signal peptidase I  32.77 
 
 		 268 aa  116  3.9999999999999997e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2622  signal peptidase I  32.05 
 
 		 322 aa  116  3.9999999999999997e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0991  signal peptidase I  30.77 
 
 		 297 aa  116  3.9999999999999997e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.0050867  normal  0.048804 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2816  signal peptidase I  32.62 
 
 		 220 aa  116  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2767  peptidase S26A, signal peptidase I  32.11 
 
 		 304 aa  116  3.9999999999999997e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000572836  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1347  signal peptidase I  32.4 
 
 		 305 aa  116  5e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0926  signal peptidase I  30.34 
 
 		 297 aa  116  5e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.592083  normal  0.151017 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1244  signal peptidase I  34.06 
 
 		 305 aa  116  5e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000321734  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1200  signal peptidase I  34.06 
 
 		 305 aa  116  5e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00231216  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1277  signal peptidase I  34.06 
 
 		 305 aa  116  5e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0693352  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3113  signal peptidase I  34.06 
 
 		 305 aa  116  5e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00010376  normal  0.0138648 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4684  Signal peptidase I  34.01 
 
 		 253 aa  115  6e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.205257  normal  0.726789 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0600  signal peptidase I  35.47 
 
 		 322 aa  115  6.9999999999999995e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000224318 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0035  signal peptidase I  33.04 
 
 		 253 aa  115  8.999999999999998e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0997  signal peptidase I  34.32 
 
 		 247 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.611874  normal  0.481629 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1741  peptidase S26A, signal peptidase I  34.65 
 
 		 321 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0212318  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0861  signal peptidase I  33.03 
 
 		 248 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0146841 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1005  signal peptidase I  33.03 
 
 		 248 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0514766 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1150  signal peptidase I  34.71 
 
 		 247 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0681  signal peptidase I  35.9 
 
 		 247 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2930  signal peptidase I  32.93 
 
 		 304 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.242953  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1245  signal peptidase I  33.04 
 
 		 274 aa  114  2.0000000000000002e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.181866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2040  signal peptidase I  34.21 
 
 		 298 aa  114  2.0000000000000002e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0825162  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2088  signal peptidase I  32.14 
 
 		 269 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2971  signal peptidase I  36 
 
 		 252 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3027  signal peptidase I  34.36 
 
 		 305 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000684552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3855  signal peptidase I  34.78 
 
 		 275 aa  114  2.0000000000000002e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2849  signal peptidase I  34.36 
 
 		 305 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0206128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2931  signal peptidase I  34.36 
 
 		 305 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0311128  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1674  signal peptidase I  36.73 
 
 		 279 aa  113  3e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2611  peptidase S26A, signal peptidase I  35.32 
 
 		 252 aa  113  3e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.438077  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2462  peptidase S26A, signal peptidase I  31.97 
 
 		 304 aa  113  3e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2650  peptidase S26A, signal peptidase I  34.89 
 
 		 252 aa  113  3e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.12852  normal  0.0288033 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0513  signal peptidase I  35.59 
 
 		 216 aa  113  4.0000000000000004e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.124665  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0307  signal peptidase I  36.73 
 
 		 262 aa  112  5e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2420  signal peptidase I  29.44 
 
 		 299 aa  112  6e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.133024  normal  0.287096 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2639  peptidase S26A, signal peptidase I  34.32 
 
 		 252 aa  112  7.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.89967 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2442  signal peptidase I  32 
 
 		 268 aa  112  8.000000000000001e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>