More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_1037 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009714  CHAB381_1037  signal peptidase I  100 
 
 
278 aa  569  1e-161  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0800  signal peptidase I  66.18 
 
 
286 aa  374  1e-103  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1005  signal peptidase I  63.7 
 
 
283 aa  368  1e-101  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.155968  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0872  signal peptidase I  62.99 
 
 
282 aa  363  1e-99  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0423773  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0943  signal peptidase I  62.63 
 
 
282 aa  360  1e-98  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.416981  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0582  signal peptidase I  59.35 
 
 
282 aa  350  2e-95  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.359862  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1173  signal peptidase I  60.35 
 
 
285 aa  349  3e-95  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.478468  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0844  signal peptidase I  60.07 
 
 
276 aa  340  1e-92  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0831  signal peptidase I  56.55 
 
 
301 aa  331  6e-90  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0438453  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1114  peptidase S26A, signal peptidase I  48.52 
 
 
269 aa  245  4.9999999999999997e-64  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.747736  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1119  signal peptidase I  33.33 
 
 
240 aa  119  3.9999999999999996e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.606635  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1119  signal peptidase I  30.62 
 
 
263 aa  117  3e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1398  signal peptidase I  30.62 
 
 
263 aa  117  3e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0480  signal peptidase I  30.98 
 
 
256 aa  114  1.0000000000000001e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1687  signal peptidase I  30.98 
 
 
256 aa  114  2.0000000000000002e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0639  signal peptidase I  31.45 
 
 
301 aa  114  2.0000000000000002e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.602306  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1465  signal peptidase I  28.24 
 
 
262 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0733  peptidase S26A, signal peptidase I  29.12 
 
 
255 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000686529  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0282  signal peptidase I  30 
 
 
311 aa  112  6e-24  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1061  signal peptidase I  28.9 
 
 
305 aa  112  7.000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.582864  normal  0.298061 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1067  signal peptidase I  29.71 
 
 
322 aa  112  7.000000000000001e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.78026  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2460  peptidase S26A, signal peptidase I  31.78 
 
 
270 aa  112  8.000000000000001e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1147  Signal peptidase I  29.37 
 
 
305 aa  112  9e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000185511  normal  0.576512 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2088  signal peptidase I  30.4 
 
 
269 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0879  Signal peptidase I  30.62 
 
 
305 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.510509  normal  0.115217 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02462  leader peptidase (signal peptidase I)  30 
 
 
324 aa  110  3e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3805  signal peptidase I  30 
 
 
324 aa  110  3e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0594788  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2854  signal peptidase I  30 
 
 
324 aa  110  3e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0168812  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2786  signal peptidase I  29.12 
 
 
322 aa  110  3e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0394004  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2721  signal peptidase I  30 
 
 
324 aa  110  3e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.010044  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2933  signal peptidase I  30 
 
 
324 aa  110  3e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.173201  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1242  signal peptidase I  28.68 
 
 
305 aa  110  3e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000742839  unclonable  0.0000000149917 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1100  signal peptidase I  30 
 
 
324 aa  109  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00559358  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3501  signal peptidase I  29.06 
 
 
216 aa  109  4.0000000000000004e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00001185  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1109  signal peptidase I  30 
 
 
324 aa  109  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.700104  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1630  signal peptidase I  28.1 
 
 
267 aa  109  5e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0207153  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1833  Signal peptidase I  29.77 
 
 
251 aa  108  9.000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2260  signal peptidase I  29.8 
 
 
199 aa  108  9.000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0926  signal peptidase I  29.03 
 
 
297 aa  108  1e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.592083  normal  0.151017 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1053  signal peptidase I  29.41 
 
 
305 aa  108  1e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0413438  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2723  signal peptidase I  29.64 
 
 
324 aa  107  2e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0835548  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0991  signal peptidase I  28.63 
 
 
297 aa  107  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.0050867  normal  0.048804 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3670  signal peptidase I  29.1 
 
 
325 aa  107  2e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2826  signal peptidase I  28.78 
 
 
324 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2849  signal peptidase I  28.78 
 
 
324 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.420216  normal  0.967172 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2745  signal peptidase I  28.78 
 
 
324 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00124919  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2786  signal peptidase I  28.78 
 
 
324 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2961  signal peptidase I  28.78 
 
 
324 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0697266  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3169  signal peptidase I  30.5 
 
 
200 aa  107  3e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.559115  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02999  signal peptidase I  29.43 
 
 
300 aa  107  3e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.406201  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1836  Signal peptidase I  29.39 
 
 
251 aa  106  4e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2767  peptidase S26A, signal peptidase I  29.34 
 
 
304 aa  106  4e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000572836  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1036  signal peptidase I  30.99 
 
 
305 aa  106  5e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00141491  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1158  signal peptidase I  29.18 
 
 
305 aa  105  6e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0066351  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1200  signal peptidase I  29.18 
 
 
305 aa  105  8e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00231216  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1277  signal peptidase I  29.18 
 
 
305 aa  105  8e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0693352  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3113  signal peptidase I  29.18 
 
 
305 aa  105  8e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00010376  normal  0.0138648 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1244  signal peptidase I  29.18 
 
 
305 aa  105  8e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000321734  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4245  signal peptidase I  27.2 
 
 
297 aa  104  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.990616  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1390  signal peptidase I  31.68 
 
 
266 aa  105  1e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2462  peptidase S26A, signal peptidase I  27.24 
 
 
304 aa  105  1e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2171  signal peptidase I  27.59 
 
 
297 aa  104  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.534378 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3072  signal peptidase I  30.26 
 
 
321 aa  105  1e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0190476  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1009  signal peptidase I  27.59 
 
 
297 aa  104  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.225972  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1013  signal peptidase I  27.59 
 
 
297 aa  104  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1949  signal peptidase I  28.12 
 
 
256 aa  104  2e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1203  signal peptidase I  29.89 
 
 
321 aa  104  2e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.292281  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2027  signal peptidase I  28.91 
 
 
262 aa  104  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0626675  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1091  signal peptidase I  27.2 
 
 
297 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.5937  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0653  peptidase S26A, signal peptidase I  27.2 
 
 
297 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.932075  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1133  signal peptidase I  27.2 
 
 
297 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1090  signal peptidase I  30.17 
 
 
267 aa  104  2e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.21498  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1188  signal peptidase I  27.7 
 
 
332 aa  103  3e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.234081  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2040  signal peptidase I  27.56 
 
 
298 aa  103  3e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0825162  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1241  signal peptidase I  30.37 
 
 
343 aa  103  3e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.824327  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1135  signal peptidase I  27.34 
 
 
332 aa  103  4e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0055929  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1347  signal peptidase I  28.79 
 
 
305 aa  103  4e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1473  signal peptidase I  28.79 
 
 
284 aa  103  4e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.199887  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2718  signal peptidase I  27.59 
 
 
198 aa  103  4e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2849  signal peptidase I  29.17 
 
 
305 aa  102  8e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0206128  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2931  signal peptidase I  29.17 
 
 
305 aa  102  8e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0311128  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3610  signal peptidase I  27.7 
 
 
332 aa  102  9e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0291882  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1470  peptidase S26A, signal peptidase I  27.8 
 
 
268 aa  101  1e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.123301  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1245  signal peptidase I  29.37 
 
 
274 aa  101  1e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.181866  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3063  signal peptidase I  28.85 
 
 
325 aa  101  1e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0636923  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3637  signal peptidase I  29.57 
 
 
325 aa  101  1e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.034698  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0412  signal peptidase I  30 
 
 
268 aa  101  1e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1194  signal peptidase I  31.69 
 
 
324 aa  102  1e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.992009  decreased coverage  0.00558378 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54350  signal peptidase I  31.91 
 
 
284 aa  101  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4751  signal peptidase I  31.52 
 
 
284 aa  100  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0616225  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03537  signal peptidase  29.31 
 
 
299 aa  100  2e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3055  signal peptidase I  29.18 
 
 
324 aa  100  2e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.394235  normal  0.0107141 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1741  peptidase S26A, signal peptidase I  31.13 
 
 
321 aa  100  2e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0212318  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2526  signal peptidase I (leader peptidase I)  32.19 
 
 
300 aa  100  2e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0283141  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1345  signal peptidase I  28.24 
 
 
257 aa  101  2e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.150454  normal  0.782452 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3027  signal peptidase I  29.18 
 
 
305 aa  100  2e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000684552  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0600  signal peptidase I  28.68 
 
 
322 aa  100  3e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000224318 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0648  signal peptidase I  27.67 
 
 
322 aa  100  4e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0465019  normal  0.157314 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5263  signal peptidase I  28.28 
 
 
325 aa  99.8  5e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0282  signal peptidase I  29.71 
 
 
206 aa  99.4  5e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0690316  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>