More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4818 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_4818  integrase catalytic subunit  100 
 
 
207 aa  416  9.999999999999999e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.235242  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4705  integrase catalytic subunit  75.53 
 
 
296 aa  276  2e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0616  integrase catalytic subunit  56.8 
 
 
232 aa  173  1.9999999999999998e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.243414  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7355  integrase catalytic region  54.49 
 
 
319 aa  157  1e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.149793 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2949  Integrase catalytic region  43.29 
 
 
270 aa  150  1e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1484  Integrase catalytic region  43.29 
 
 
270 aa  150  1e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.370825  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2011  Integrase catalytic region  43.29 
 
 
270 aa  150  1e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.130464  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1829  Integrase catalytic region  43.29 
 
 
270 aa  150  1e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2199  Integrase catalytic region  43.29 
 
 
270 aa  150  1e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1727  integrase  48.19 
 
 
281 aa  147  9e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0647864 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0514  integrase catalytic subunit  49.41 
 
 
285 aa  147  1.0000000000000001e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0519  integrase catalytic subunit  49.41 
 
 
285 aa  147  1.0000000000000001e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0693  integrase catalytic subunit  49.41 
 
 
285 aa  147  1.0000000000000001e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0702  integrase catalytic subunit  49.41 
 
 
285 aa  147  1.0000000000000001e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0706  integrase catalytic subunit  49.41 
 
 
285 aa  147  1.0000000000000001e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.760858  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0708  integrase catalytic subunit  49.41 
 
 
285 aa  147  1.0000000000000001e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2398  integrase catalytic subunit  49.41 
 
 
285 aa  147  1.0000000000000001e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.466088  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2400  integrase catalytic subunit  49.41 
 
 
285 aa  147  1.0000000000000001e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.14015  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3189  integrase catalytic subunit  49.41 
 
 
285 aa  147  1.0000000000000001e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3353  integrase catalytic subunit  49.41 
 
 
285 aa  147  1.0000000000000001e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.746992  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4118  integrase catalytic subunit  49.41 
 
 
285 aa  147  1.0000000000000001e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000189778 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1823  Integrase catalytic region  41.67 
 
 
270 aa  145  4.0000000000000006e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.484824  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1559  Integrase catalytic region  41.67 
 
 
270 aa  145  4.0000000000000006e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0801  Integrase catalytic region  49.2 
 
 
291 aa  144  1e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13740  Integrase catalytic region  39.41 
 
 
277 aa  139  3e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000154434  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0402  Integrase catalytic region  44.58 
 
 
281 aa  134  9e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.992853 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00290  Integrase catalytic region  36.9 
 
 
291 aa  130  2.0000000000000002e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6260  integrase catalytic region  44.51 
 
 
291 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6485  integrase catalytic region  43.33 
 
 
286 aa  128  6e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6050  integrase catalytic region  43.33 
 
 
286 aa  128  6e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6112  integrase catalytic region  43.33 
 
 
286 aa  128  6e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.116632  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0378  integrase catalytic region  43.33 
 
 
286 aa  128  6e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2570  integrase catalytic region  43.33 
 
 
286 aa  128  6e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0561673  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3664  Integrase catalytic region  46.39 
 
 
294 aa  127  1.0000000000000001e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.11217  normal  0.13781 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3730  integrase catalytic region  41.94 
 
 
286 aa  126  2.0000000000000002e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0452  integrase catalytic region  41.94 
 
 
286 aa  127  2.0000000000000002e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6034  transposase InsF for insertion sequence IS3A/B/C/D/E/fA  41.4 
 
 
288 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0340  integrase catalytic region  41.94 
 
 
286 aa  127  2.0000000000000002e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0840  integrase catalytic region  41.94 
 
 
286 aa  127  2.0000000000000002e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.249045 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0552  integrase catalytic region  41.94 
 
 
286 aa  127  2.0000000000000002e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.602741  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09750  Integrase, catalytic domain-containing protein  37.62 
 
 
286 aa  125  3e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16550  Integrase, catalytic domain-containing protein  37.62 
 
 
286 aa  125  3e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20540  Integrase, catalytic domain-containing protein  37.62 
 
 
286 aa  125  3e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41860  Integrase, catalytic domain-containing protein  37.62 
 
 
286 aa  125  3e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40520  Integrase, catalytic domain-containing protein  37.62 
 
 
286 aa  125  3e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1510  integrase catalytic subunit  42.59 
 
 
271 aa  125  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1533  integrase catalytic subunit  42.59 
 
 
271 aa  125  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.522585  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2153  integrase catalytic subunit  42.59 
 
 
271 aa  125  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00525672 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4972  integrase catalytic region  41.4 
 
 
286 aa  125  5e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.422508  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4250  integrase catalytic region  41.4 
 
 
286 aa  125  5e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1105  integrase catalytic region  41.4 
 
 
286 aa  125  5e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.361745 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1032  integrase catalytic region  41.4 
 
 
286 aa  125  5e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3599  integrase catalytic region  41.4 
 
 
286 aa  125  5e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3274  integrase catalytic region  41.4 
 
 
286 aa  125  5e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4229  integrase catalytic region  41.4 
 
 
286 aa  125  5e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1072  IS3 family transposase orfB  38.71 
 
 
302 aa  124  9e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.48838  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1116  IS3 family transposase orfB  38.71 
 
 
293 aa  124  9e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1089  Integrase catalytic region  41.4 
 
 
286 aa  124  1e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1010  IS3 family transposase orfB  38.71 
 
 
302 aa  124  1e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1015  IS3 family transposase orfB  38.71 
 
 
293 aa  124  1e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2753  transposase  39.66 
 
 
286 aa  123  2e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.403453  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5539  transposase  39.47 
 
 
203 aa  123  2e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.233578  normal  0.0199842 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2002  integrase catalytic region  40.86 
 
 
286 aa  122  3e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.709933  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1943  integrase catalytic region  40.86 
 
 
286 aa  122  3e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1569  transposase InsF for insertion sequence IS3A/B/C/D/E/fA  37.3 
 
 
285 aa  122  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.422355  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1347  IS3 putative transposase  38.38 
 
 
290 aa  122  5e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1614  integrase catalytic region  37.31 
 
 
293 aa  121  6e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.670062 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1456  integrase catalytic region  42.11 
 
 
237 aa  121  6e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0392097 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3806  integrase catalytic region  37.31 
 
 
293 aa  121  6e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2971  integrase catalytic region  37.31 
 
 
293 aa  121  6e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.43279 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0268  Integrase catalytic region  42.62 
 
 
302 aa  120  9.999999999999999e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.154929  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0272  Integrase catalytic region  42.62 
 
 
302 aa  120  9.999999999999999e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.443922  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0279  Integrase catalytic region  42.62 
 
 
302 aa  120  9.999999999999999e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0302  Integrase catalytic region  42.62 
 
 
303 aa  120  9.999999999999999e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1666  Integrase catalytic region  42.62 
 
 
302 aa  120  9.999999999999999e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.138107  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1648  Integrase catalytic region  42.62 
 
 
302 aa  120  9.999999999999999e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2606  Integrase catalytic region  42.62 
 
 
302 aa  120  9.999999999999999e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2473  Integrase catalytic region  42.62 
 
 
302 aa  120  9.999999999999999e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3218  Integrase catalytic region  42.62 
 
 
302 aa  120  9.999999999999999e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1289  ISCps2, transposase orfB  37.28 
 
 
272 aa  120  1.9999999999999998e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.188636  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5314  integrase catalytic subunit  45.28 
 
 
279 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.389747 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4830  integrase catalytic subunit  40.54 
 
 
299 aa  119  3e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.798983 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2154  integrase catalytic subunit  40.54 
 
 
299 aa  119  3e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2905  integrase catalytic region  39.66 
 
 
286 aa  119  3e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1432  integrase catalytic subunit  38.46 
 
 
280 aa  119  3.9999999999999996e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.161592  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0930  integrase catalytic subunit  47.68 
 
 
279 aa  119  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2594  integrase catalytic subunit  47.68 
 
 
279 aa  119  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0806255  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5606  integrase catalytic subunit  43.17 
 
 
299 aa  119  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.398983  normal  0.604241 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5824  integrase catalytic subunit  43.17 
 
 
299 aa  119  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.360076 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0947  integrase catalytic subunit  47.68 
 
 
279 aa  119  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1484  integrase catalytic subunit  47.68 
 
 
279 aa  119  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0324114  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2638  integrase catalytic subunit  47.68 
 
 
279 aa  119  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.220037  normal  0.89202 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1091  integrase catalytic subunit  40.22 
 
 
297 aa  119  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1692  integrase catalytic subunit  40.22 
 
 
297 aa  119  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1955  integrase catalytic subunit  40.22 
 
 
297 aa  119  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3659  integrase catalytic subunit  40.22 
 
 
297 aa  119  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3720  integrase catalytic subunit  40.22 
 
 
297 aa  119  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.424054  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3740  integrase catalytic subunit  40.22 
 
 
297 aa  119  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.553095  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5060  integrase catalytic subunit  40.22 
 
 
297 aa  119  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.690854  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0545  integrase catalytic subunit  38.46 
 
 
289 aa  118  4.9999999999999996e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.435067  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>