More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3350 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_1887  ABC transporter-like protein  74.53 
 
 		 423 aa  645    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.165528 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3350  ABC-type sugar transport systems ATPase components-like protein  100 
 
 		 428 aa  862    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00388587 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1737  ABC transporter related protein  56.07 
 
 		 423 aa  452  1.0000000000000001e-126  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0191585  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0435  ABC transporter related  51.27 
 
 		 453 aa  402  1e-111  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2289  ABC transporter related protein  44.29 
 
 		 391 aa  356  5.999999999999999e-97  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3611  ABC transporter related  46.4 
 
 		 370 aa  316  5e-85  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06520  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  42.28 
 
 		 393 aa  312  9e-84  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1862  ABC transporter related protein  50.85 
 
 		 370 aa  310  2.9999999999999997e-83  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2909  ABC transporter related  46.93 
 
 		 372 aa  309  5.9999999999999995e-83  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2654  putative maltose/maltodextrin ABC transporter, ATP-binding protein  45.07 
 
 		 369 aa  308  1.0000000000000001e-82  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0142  ABC transporter related  45.34 
 
 		 363 aa  306  5.0000000000000004e-82  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3980  ABC transporter related  49.84 
 
 		 405 aa  304  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2340  ABC transporter  44.48 
 
 		 369 aa  304  2.0000000000000002e-81  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0409  putative maltose ABC transportor  45.06 
 
 		 365 aa  304  2.0000000000000002e-81  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4054  ABC transporter related  49.84 
 
 		 405 aa  304  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.955986 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3994  ABC transporter related  49.84 
 
 		 405 aa  304  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.73747  normal  0.280943 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2950  ABC transporter related protein  53.02 
 
 		 371 aa  304  2.0000000000000002e-81  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0663076  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31720  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  50 
 
 		 376 aa  303  3.0000000000000004e-81  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3931  ABC transporter related protein  47.29 
 
 		 425 aa  303  4.0000000000000003e-81  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.423842  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06399  hypothetical protein  57.49 
 
 		 385 aa  303  4.0000000000000003e-81  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1803  ABC transporter related  50.51 
 
 		 370 aa  303  5.000000000000001e-81  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000191731  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1869  ABC transporter related protein  47.32 
 
 		 389 aa  303  6.000000000000001e-81  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1763  ABC-type sugar transport systems ATPase components  51.89 
 
 		 410 aa  302  7.000000000000001e-81  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0592656  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1044  ABC transporter related  45.66 
 
 		 374 aa  302  8.000000000000001e-81  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000322193  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0955  ABC transporter related  47.51 
 
 		 365 aa  302  9e-81  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.370442  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2096  ABC transporter ATP-binding protein  48.31 
 
 		 373 aa  301  1e-80  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.425612 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1165  ABC transporter related  47.55 
 
 		 363 aa  300  3e-80  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.191612  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2065  ABC transporter related  53.54 
 
 		 366 aa  300  3e-80  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.424295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4614  ABC transporter related  43.38 
 
 		 398 aa  300  4e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0894  ABC transporter related  47.31 
 
 		 370 aa  300  4e-80  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1495  ABC transporter related  46.87 
 
 		 367 aa  298  1e-79  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.407646  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1543  ABC transporter related  46.87 
 
 		 367 aa  298  1e-79  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4710  ABC transporter related  41.63 
 
 		 380 aa  298  1e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1327  ABC transporter related  41.25 
 
 		 388 aa  298  2e-79  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0366  ABC transporter related protein  44.92 
 
 		 364 aa  298  2e-79  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.173433  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0785  ABC transporter related  49.23 
 
 		 375 aa  297  2e-79  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0425622  normal  0.0557352 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0692  ABC transporter related protein  44.92 
 
 		 364 aa  298  2e-79  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5484  ABC transporter related  48.63 
 
 		 382 aa  298  2e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.211283  normal  0.256732 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0810  ABC transporter related  48.34 
 
 		 396 aa  297  2e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1532  ABC transporter related protein  50.86 
 
 		 404 aa  297  2e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.427318  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0674  ABC transporter related protein  50 
 
 		 374 aa  297  3e-79  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.290322  hitchhiker  0.000952795 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4055  ABC transporter related protein  44.62 
 
 		 364 aa  297  3e-79  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1769  ABC transporter related  49.04 
 
 		 366 aa  296  4e-79  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1522  ABC transporter related protein  44.62 
 
 		 364 aa  296  6e-79  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000622253  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5221  ABC transporter related  48.02 
 
 		 381 aa  295  8e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.533287  normal  0.501993 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5747  ABC transporter related  41.22 
 
 		 380 aa  295  1e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.605905 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1202  ABC transporter related protein  45.56 
 
 		 393 aa  295  1e-78  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8165  ABC transporter related  48.48 
 
 		 364 aa  294  2e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1992  ABC transporter related  47.32 
 
 		 426 aa  294  2e-78  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.394996  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4647  ABC transporter related protein  46.81 
 
 		 388 aa  293  5e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000745064 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11263  sugar-transport ATP-binding protein ABC transporter sugC  56.73 
 
 		 393 aa  293  5e-78  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00178586 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0068  ABC transporter, ATP-binding protein  47.63 
 
 		 375 aa  293  6e-78  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0372334 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0621  ABC transporter related  45.54 
 
 		 370 aa  292  8e-78  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0838339  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1278  ABC transporter related  48.18 
 
 		 367 aa  291  1e-77  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.288826  normal  0.201338 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2935  ABC transporter related protein  49.5 
 
 		 406 aa  291  1e-77  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.311715 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1177  ABC transporter related  49.23 
 
 		 356 aa  291  1e-77  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.675733  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0525  ABC transporter related  47.88 
 
 		 367 aa  291  1e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159781 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0259  ABC transporter related protein  44.62 
 
 		 366 aa  290  2e-77  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0120  ABC transporter related protein  44.62 
 
 		 366 aa  290  2e-77  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2164  ABC transporter related  44.8 
 
 		 392 aa  291  2e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2324  ABC transporter related protein  49.66 
 
 		 409 aa  291  2e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0104165  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1424  ABC transporter related protein  47.02 
 
 		 370 aa  290  2e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1466  sugar ABC transporter ATPase  48.5 
 
 		 375 aa  290  3e-77  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6516  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  50.34 
 
 		 406 aa  290  3e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.268585 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2198  ABC transporter-like protein  50.34 
 
 		 405 aa  290  4e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.829082  normal  0.643805 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2541  ABC transporter-related protein  47.72 
 
 		 399 aa  290  4e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0163  ABC transporter related  48.04 
 
 		 369 aa  289  5.0000000000000004e-77  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0867  ABC transporter related  51.34 
 
 		 360 aa  289  6e-77  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00450  ABC transporter related  46.2 
 
 		 372 aa  289  7e-77  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1098  ABC transporter related  48.48 
 
 		 421 aa  288  9e-77  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.894921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20460  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  46.55 
 
 		 436 aa  288  1e-76  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.511444  normal  0.216317 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0607  ABC transporter related  48.76 
 
 		 355 aa  288  1e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000630486 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2331  ABC transporter related protein  48.8 
 
 		 404 aa  288  1e-76  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.048634  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2099  sn-glycerol-3-phosphate import ATP-binding protein UgpC  47.83 
 
 		 367 aa  287  2e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0157125  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0658  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  55.92 
 
 		 351 aa  287  2e-76  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.143884  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3987  ABC transporter related protein  56.68 
 
 		 368 aa  287  2.9999999999999996e-76  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.125928  normal  0.808718 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3753  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  55.82 
 
 		 351 aa  286  2.9999999999999996e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0620  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  55.92 
 
 		 351 aa  286  4e-76  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1044  ABC transporter related protein  46.93 
 
 		 387 aa  286  4e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00270129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3854  ABC transporter related  47.11 
 
 		 409 aa  286  5e-76  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.110244 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04610  ATPase component of ABC-type sugar transporter  38.84 
 
 		 430 aa  286  7e-76  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.78848  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1632  multiple sugar-binding transport, ATP-binding protein  46.46 
 
 		 367 aa  285  8e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1897  multiple sugar-binding transport ATP-binding protein  46.46 
 
 		 367 aa  285  9e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.105891  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3206  ABC transporter related  47.27 
 
 		 364 aa  285  1.0000000000000001e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0268123  normal  0.0421878 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0963  ABC transporter related protein  41.41 
 
 		 431 aa  285  1.0000000000000001e-75  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.507852  hitchhiker  0.00012031 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1116  ABC transporter related  47.88 
 
 		 418 aa  285  1.0000000000000001e-75  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.375111  normal  0.570799 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2522  ABC transporter-related protein  45.05 
 
 		 391 aa  285  1.0000000000000001e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1671  ABC transporter related  42.59 
 
 		 366 aa  284  2.0000000000000002e-75  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0631  ABC transporter related  48.97 
 
 		 371 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4019  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  46.75 
 
 		 349 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00570  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  52.05 
 
 		 379 aa  285  2.0000000000000002e-75  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2199  ABC transporter related protein  49.83 
 
 		 380 aa  284  2.0000000000000002e-75  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0474  ABC-type sugar transport system, ATPase component  42.86 
 
 		 378 aa  283  3.0000000000000004e-75  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2849  ABC transporter-related protein  45.99 
 
 		 377 aa  284  3.0000000000000004e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0912709 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0973  ABC transporter related protein  45.71 
 
 		 364 aa  283  4.0000000000000003e-75  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0377  ABC transporter related protein  55.24 
 
 		 375 aa  283  5.000000000000001e-75  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.101699  normal  0.0235705 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0916  ABC transporter related  56.45 
 
 		 358 aa  283  5.000000000000001e-75  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0452434 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1161  ABC transporter related  48.14 
 
 		 367 aa  283  5.000000000000001e-75  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0242  ABC transporter related  43.53 
 
 		 377 aa  283  6.000000000000001e-75  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3141  sugar ABC transporter  46.32 
 
 		 352 aa  283  6.000000000000001e-75  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.204703  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>