More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1997 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_1997  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
263 aa  514  1.0000000000000001e-145  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0721  2-hydroxycyclohexanecarboxyl-CoA dehydrogenase  44.74 
 
 
255 aa  198  7e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1032  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.36 
 
 
255 aa  198  9e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1211  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.06 
 
 
250 aa  196  2.0000000000000003e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.663428  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1541  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.11 
 
 
255 aa  194  8.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.111492  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0877  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.27 
 
 
251 aa  192  5e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.795083  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1769  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.21 
 
 
253 aa  190  2e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.145372 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4297  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.64 
 
 
246 aa  190  2e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.408574  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2123  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.74 
 
 
255 aa  186  2e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.000297813  normal  0.0786529 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6108  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.91 
 
 
255 aa  185  5e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1185  2-hydroxycyclohexanecarboxyl-CoA dehydrogenase  44.78 
 
 
255 aa  183  3e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.938573 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4104  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.15 
 
 
255 aa  182  4.0000000000000006e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.90531 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3915  NAD-dependent epimerase/dehydratase:Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.36 
 
 
255 aa  181  1e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04660  2-hydroxycyclohexane-1-carbonyl-CoA dehydrogenase  43.58 
 
 
261 aa  181  1e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6840  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.3 
 
 
254 aa  180  2e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0833  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.52 
 
 
263 aa  175  6e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1407  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.02 
 
 
256 aa  169  6e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0911  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.6 
 
 
256 aa  168  9e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0935429  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0856  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.4 
 
 
252 aa  164  1.0000000000000001e-39  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3123  acetoacetyl-CoA reductase  37.84 
 
 
246 aa  161  1e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3663  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.54 
 
 
246 aa  158  7e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1654  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.69 
 
 
246 aa  157  1e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0676994 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3570  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.4 
 
 
246 aa  157  1e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3215  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.39 
 
 
257 aa  157  1e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1400  short chain dehydrogenase  36.57 
 
 
264 aa  157  2e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.473326  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05365  acetoacetyl-CoA reductase  33.08 
 
 
268 aa  157  2e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3580  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.69 
 
 
246 aa  157  2e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4185  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.4 
 
 
248 aa  156  3e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3264  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.69 
 
 
246 aa  156  4e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3314  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.31 
 
 
246 aa  155  7e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3449  acetoacetyl-CoA reductase  37.16 
 
 
248 aa  155  7e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0871838  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3563  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.31 
 
 
246 aa  155  7e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0125613 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1871  short chain dehydrogenase  36.57 
 
 
264 aa  155  7e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1817  short chain dehydrogenase  36.57 
 
 
264 aa  155  8e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.568851  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3711  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.74 
 
 
247 aa  155  9e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3784  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.74 
 
 
247 aa  155  9e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.513657  normal  0.265032 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3865  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  38.2 
 
 
277 aa  154  1e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6917  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.32 
 
 
251 aa  154  1e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.780011 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3258  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.15 
 
 
246 aa  154  1e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.266771  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2625  acetoacetyl-CoA reductase  35.79 
 
 
248 aa  153  2e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8088  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  39.11 
 
 
277 aa  154  2e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000520  acetoacetyl-CoA reductase  32.82 
 
 
246 aa  154  2e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3724  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.04 
 
 
247 aa  154  2e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1609  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  36.15 
 
 
246 aa  153  2.9999999999999998e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.481338 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1671  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.22 
 
 
246 aa  152  4e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0631  acetoacetyl-CoA reductase  35.27 
 
 
246 aa  152  4e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0544  acetoacetyl-CoA reductase  38.93 
 
 
247 aa  152  4e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2157  acetoacetyl-CoA reductase  38.93 
 
 
264 aa  152  4e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.722529  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2771  acetoacetyl-CoA reductase  38.93 
 
 
264 aa  152  4e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3305  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.08 
 
 
268 aa  152  5.9999999999999996e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.552464 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2469  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.98 
 
 
249 aa  152  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3349  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.92 
 
 
246 aa  152  8e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.06131  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3610  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.92 
 
 
246 aa  152  8e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.767339  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1097  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.76 
 
 
247 aa  151  1e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000264481  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0287  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.64 
 
 
253 aa  150  2e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.129193  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4937  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.15 
 
 
247 aa  150  2e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5025  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.15 
 
 
247 aa  150  2e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0178  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.4 
 
 
247 aa  149  3e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000108862  hitchhiker  0.000102827 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1877  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.4 
 
 
246 aa  150  3e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.627616  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2929  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.88 
 
 
249 aa  149  3e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5895  acetoacetyl-CoA reductase  38.46 
 
 
248 aa  149  4e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.210588 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1526  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.47 
 
 
249 aa  149  5e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1258  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.02 
 
 
248 aa  148  7e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000465819 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7331  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  36.72 
 
 
249 aa  148  8e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.753901  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2823  acetoacetyl-CoA reductase  37.64 
 
 
247 aa  148  8e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1744  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.61 
 
 
245 aa  148  8e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000000109109  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4522  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.61 
 
 
255 aa  148  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.556744  normal  0.320404 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0994  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.02 
 
 
247 aa  148  1.0000000000000001e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0983572  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1259  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.16 
 
 
245 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2031  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.73 
 
 
245 aa  147  2.0000000000000003e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6555  acetoacetyl-CoA reductase  37.79 
 
 
247 aa  146  3e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.660753 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0748  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.62 
 
 
251 aa  147  3e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00177526  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4724  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.8 
 
 
273 aa  146  4.0000000000000006e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1007  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  34.59 
 
 
247 aa  146  4.0000000000000006e-34  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0235176 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5123  acetoacetyl-CoA reductase  37.84 
 
 
248 aa  146  4.0000000000000006e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.753936  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2554  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.62 
 
 
244 aa  145  5e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  9.3114e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2034  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.62 
 
 
244 aa  145  5e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000773418  decreased coverage  0.000000561813 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2450  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.31 
 
 
249 aa  145  5e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2241  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.28 
 
 
240 aa  145  5e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2508  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.62 
 
 
244 aa  145  5e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000339194  hitchhiker  0.00000190522 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1768  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase NodG  36.78 
 
 
245 aa  145  5e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.323162  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1215  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.62 
 
 
244 aa  145  5e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  7.480399999999999e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1214  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.62 
 
 
244 aa  145  5e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000193485  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2231  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.62 
 
 
244 aa  145  5e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.00000000000000399569  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1541  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.08 
 
 
282 aa  145  6e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.458273  normal  0.643271 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1472  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.62 
 
 
244 aa  145  6e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000346671  hitchhiker  0.00000000000000508287 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2343  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  36.43 
 
 
262 aa  145  6e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3819  acetoacetyl-CoA reductase  38.08 
 
 
248 aa  145  6e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.430779  normal  0.774133 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2690  acetoacetyl-CoA reductase  37.31 
 
 
247 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0685514  normal  0.204101 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0684  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35 
 
 
245 aa  145  8.000000000000001e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.015461  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4287  acetoacetyl-CoA reductase  37.69 
 
 
248 aa  144  1e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.250358  normal  0.289691 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7115  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.16 
 
 
253 aa  144  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.963222 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3406  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.49 
 
 
249 aa  144  1e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6140  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.82 
 
 
254 aa  144  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.601598  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2085  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.86 
 
 
245 aa  144  1e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.514176 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3704  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.15 
 
 
247 aa  144  1e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2255  acetoacetyl-CoA reductase  36.29 
 
 
240 aa  144  1e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2308  putative 3-oxoacyl-ACP reductase  38.43 
 
 
252 aa  143  2e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2895  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.68 
 
 
259 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.405915 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3602  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.76 
 
 
245 aa  144  2e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0780439  normal  0.144025 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>