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for query gene Spro_0262 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



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Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_0262  major facilitator transporter  100 
 
 
398 aa  780    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0989253  normal  0.0321857 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7165  major facilitator transporter  65.7 
 
 
430 aa  434  1e-120  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0844  major facilitator transporter  35.47 
 
 
393 aa  201  3e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1312  major facilitator transporter  35.16 
 
 
388 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001431  multidrug resistance protein D  27.87 
 
 
397 aa  137  3.0000000000000003e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000114311  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06295  hypothetical protein  27.27 
 
 
387 aa  129  7.000000000000001e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1682  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.95 
 
 
414 aa  125  2e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0153282  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1045  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  30.34 
 
 
461 aa  122  9.999999999999999e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25390  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  31.9 
 
 
414 aa  122  1.9999999999999998e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.721605  normal  0.383381 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3852  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  29.71 
 
 
407 aa  121  3e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.64308  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20220  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  31.72 
 
 
415 aa  118  1.9999999999999998e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.179817 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2187  hypothetical protein  26.9 
 
 
407 aa  116  6e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2379  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.59 
 
 
402 aa  116  6e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0966987  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2425  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.59 
 
 
402 aa  116  6e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2067  multidrug resistance protein D  27.04 
 
 
409 aa  116  7.999999999999999e-25  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0252383  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2160  hypothetical protein  26.17 
 
 
407 aa  115  2.0000000000000002e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0115  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.9 
 
 
391 aa  115  2.0000000000000002e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000395955  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0264  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.57 
 
 
411 aa  114  4.0000000000000004e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1089  multidrug resistance transporter, Bcr family  25.87 
 
 
409 aa  111  2.0000000000000002e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0057  multidrug resistance protein D  26.65 
 
 
403 aa  111  2.0000000000000002e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0307213  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1947  tcaB protein  30.25 
 
 
403 aa  110  5e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0881  drug resistance translocator protein  24.74 
 
 
394 aa  109  7.000000000000001e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0515514  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32370  Drug resistance transporter Bcr/CflA subfamily protein  30.29 
 
 
426 aa  108  1e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1948  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.17 
 
 
393 aa  108  1e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0211544  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0954  MFS family transporter  31.77 
 
 
414 aa  107  3e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.456329  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1958  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  29.8 
 
 
437 aa  107  3e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00219492  hitchhiker  0.00000496056 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6000  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  27.95 
 
 
399 aa  106  7e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.923433  normal  0.331381 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0685  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  24.4 
 
 
386 aa  106  8e-22  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0211006  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4515  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.94 
 
 
396 aa  106  8e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1728  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.33 
 
 
440 aa  105  1e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5119  drug resistance transporter, Bcr/CflA family  28.53 
 
 
416 aa  105  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0167  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.13 
 
 
398 aa  105  1e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7148  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  28.65 
 
 
399 aa  104  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10470  putative MFS transporter  32.47 
 
 
402 aa  105  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0184  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.99 
 
 
398 aa  103  4e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0206  drug resistance transporter, Bcr/CflA family  30.11 
 
 
416 aa  103  5e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.993392  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13380  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  28.4 
 
 
424 aa  103  6e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.223533  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0183  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.31 
 
 
416 aa  102  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000244367  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0170  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.31 
 
 
419 aa  102  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000813415  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0173  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.31 
 
 
416 aa  102  1e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0181141  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3892  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  30.25 
 
 
412 aa  102  1e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0543814  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4889  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  31.48 
 
 
419 aa  102  1e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0049  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29 
 
 
400 aa  102  1e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.414965 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0202  drug resistance transporter, Bcr/CflA family  29.31 
 
 
416 aa  102  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0181  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.31 
 
 
416 aa  102  1e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1904  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  31.94 
 
 
425 aa  102  1e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0216  transport transmembrane protein  33.46 
 
 
409 aa  101  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1734  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.97 
 
 
435 aa  101  2e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0226  drug resistance transporter, Bcr/CflA family  29.74 
 
 
416 aa  102  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2375  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  28.94 
 
 
394 aa  102  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.525477 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0843  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.95 
 
 
424 aa  100  3e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001081  multidrug resistance protein D  28.47 
 
 
394 aa  100  4e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4226  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.76 
 
 
465 aa  100  4e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.693691  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4430  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  28.3 
 
 
454 aa  100  4e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0528088  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3211  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.82 
 
 
424 aa  100  4e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0202  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.37 
 
 
419 aa  100  5e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0833  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.8 
 
 
421 aa  100  6e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3177  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  24.04 
 
 
399 aa  100  6e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000683833  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3535  major facilitator superfamily MFS_1  26.92 
 
 
406 aa  100  6e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.156699  normal  0.255134 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2172  drug transport transmembrane protein  29.96 
 
 
407 aa  99.8  7e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.309598  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2399  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  30.03 
 
 
457 aa  100  7e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.35739 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2040  multidrug resistance protein D  27.75 
 
 
414 aa  99  1e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.399526  normal  0.139954 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4936  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.22 
 
 
409 aa  99.4  1e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.380942  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1975  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  27.25 
 
 
394 aa  98.2  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2434  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.23 
 
 
405 aa  97.8  3e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.71242  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0826  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.51 
 
 
421 aa  97.8  3e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3263  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  24.04 
 
 
399 aa  97.1  4e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00113776  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3518  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  24.04 
 
 
399 aa  97.1  4e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0261106  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2780  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  29.32 
 
 
399 aa  97.4  4e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.118826 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3491  drug resistance transporter, Bcr/CflA family  24.33 
 
 
399 aa  97.4  4e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00320112  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3081  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  24.93 
 
 
409 aa  97.1  4e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.707115 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3478  drug resistance transporter, Bcr/CflA family  23.74 
 
 
399 aa  97.1  5e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1936  multidrug resistance protein D  27.47 
 
 
414 aa  97.1  5e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000117708 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0318  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  22.66 
 
 
402 aa  96.7  6e-19  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0437  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.6 
 
 
398 aa  96.7  6e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0855  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  28.78 
 
 
435 aa  96.3  7e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.0000185611  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1102  major facilitator superfamily permease  28.93 
 
 
420 aa  96.3  8e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.441898  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04810  Xaa-His dipeptidase  25.46 
 
 
394 aa  96.3  9e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3460  drug resistance transporter, Bcr/CflA family  24.04 
 
 
399 aa  96.3  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0137927  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2001  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  27.51 
 
 
412 aa  95.5  1e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0443671  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2030  multidrug resistance protein D  27.04 
 
 
422 aa  95.5  2e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2085  multidrug resistance protein D  25.77 
 
 
410 aa  94.7  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.88065  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0383  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  25.71 
 
 
419 aa  95.1  2e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0372929 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3830  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  28.41 
 
 
413 aa  95.5  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.423466  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3808  major facilitator transporter  28.67 
 
 
415 aa  94.7  3e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.150016  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4560  major facilitator transporter  28.67 
 
 
415 aa  94.7  3e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2768  major facilitator transporter  25.6 
 
 
399 aa  94.4  3e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5744  major facilitator transporter  28.67 
 
 
415 aa  94.7  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.310357  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3222  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  25 
 
 
417 aa  94  4e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3110  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.47 
 
 
418 aa  93.6  5e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1458  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  27.76 
 
 
399 aa  94  5e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00531988  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3595  putative membrane transport protein  27.64 
 
 
404 aa  94  5e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2078  multidrug resistance protein D  25.49 
 
 
410 aa  93.6  5e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.1442  hitchhiker  0.00000857713 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3172  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.16 
 
 
387 aa  93.2  6e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2384  multidrug resistance protein D  26.59 
 
 
410 aa  93.6  6e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.214025  hitchhiker  0.000132803 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0485  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.77 
 
 
458 aa  93.6  6e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2159  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.55 
 
 
410 aa  93.6  6e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.832459 
 
 
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NC_008542  Bcen2424_0964  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.42 
 
 
405 aa  93.6  6e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_007510  Bcep18194_A4067  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.82 
 
 
405 aa  93.2  7e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.23672  normal 
 
 
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NC_010508  Bcenmc03_0925  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.42 
 
 
405 aa  93.2  7e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.805462  normal 
 
 
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