More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_C7165 on replicon NC_007509
Organism: Burkholderia sp. 383



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Alignment on homolog gene
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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007509  Bcep18194_C7165  major facilitator transporter  100 
 
 		 430 aa  833    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0262  major facilitator transporter  65.7 
 
 		 398 aa  447  1.0000000000000001e-124  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0989253  normal  0.0321857 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1312  major facilitator transporter  36.89 
 
 		 388 aa  211  3e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0844  major facilitator transporter  34.08 
 
 		 393 aa  191  2e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3852  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  30.2 
 
 		 407 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.64308  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1682  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.27 
 
 		 414 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0153282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2067  multidrug resistance protein D  26.89 
 
 		 409 aa  115  1.0000000000000001e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0252383  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25390  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  31.82 
 
 		 414 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.721605  normal  0.383381 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0115  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.61 
 
 		 391 aa  114  4.0000000000000004e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000395955  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2434  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.97 
 
 		 405 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.71242  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1958  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  30.06 
 
 		 437 aa  112  9e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00219492  hitchhiker  0.00000496056 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4067  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.12 
 
 		 405 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.23672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0485  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.97 
 
 		 458 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0925  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.97 
 
 		 405 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.805462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0964  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.97 
 
 		 405 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0833  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.97 
 
 		 405 aa  111  3e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0954  MFS family transporter  32.93 
 
 		 414 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.456329  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2425  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.92 
 
 		 402 aa  109  8.000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2379  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.92 
 
 		 402 aa  109  8.000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0966987  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1045  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  30.59 
 
 		 461 aa  108  1e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1948  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.11 
 
 		 393 aa  108  1e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0211544  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0824  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.12 
 
 		 434 aa  109  1e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20220  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  30.03 
 
 		 415 aa  108  2e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.179817 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32370  Drug resistance transporter Bcr/CflA subfamily protein  27.72 
 
 		 426 aa  108  2e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0216  transport transmembrane protein  31.5 
 
 		 409 aa  107  3e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2159  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.27 
 
 		 410 aa  107  3e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.832459 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1102  major facilitator superfamily permease  28.64 
 
 		 420 aa  107  4e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.441898  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0264  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.41 
 
 		 411 aa  106  8e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0855  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  30.29 
 
 		 435 aa  105  1e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.0000185611  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001431  multidrug resistance protein D  25.99 
 
 		 397 aa  105  1e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000114311  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1947  tcaB protein  26.9 
 
 		 403 aa  103  8e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0057  multidrug resistance protein D  27.35 
 
 		 403 aa  102  9e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0307213  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1728  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.9 
 
 		 440 aa  102  1e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1546  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.05 
 
 		 411 aa  102  1e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3036  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.39 
 
 		 414 aa  102  1e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.340151 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6143  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  30.89 
 
 		 420 aa  102  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10470  putative MFS transporter  30.65 
 
 		 402 aa  101  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3348  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  23.8 
 
 		 411 aa  100  4e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.241483 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8150  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  30 
 
 		 412 aa  100  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0184  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.7 
 
 		 398 aa  99.4  1e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1452  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  26.8 
 
 		 418 aa  99  1e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.266521  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4936  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.17 
 
 		 409 aa  99  1e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.380942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1841  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  28.08 
 
 		 418 aa  99.4  1e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13380  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  28.4 
 
 		 424 aa  99.4  1e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.223533  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6000  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  29.85 
 
 		 399 aa  99.4  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.923433  normal  0.331381 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2019  bicyclomycin/multidrug efflux system  26.37 
 
 		 401 aa  99  1e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.11668  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0843  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.57 
 
 		 424 aa  98.6  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7148  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  28.61 
 
 		 399 aa  98.2  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2160  hypothetical protein  30.38 
 
 		 407 aa  97.4  4e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_003909  BCE_0202  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.25 
 
 		 419 aa  97.1  5e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3892  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  31.06 
 
 		 412 aa  97.1  5e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0543814  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4430  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  29.74 
 
 		 454 aa  96.7  7e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0528088  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2187  hypothetical protein  30.03 
 
 		 407 aa  96.7  8e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1734  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.33 
 
 		 435 aa  96.7  8e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0657  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.47 
 
 		 398 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.327939  normal  1 
 
 
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NC_011313  VSAL_II0881  drug resistance translocator protein  25.57 
 
 		 394 aa  95.9  1e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0515514  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1458  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  27.1 
 
 		 399 aa  96.3  1e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00531988  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2780  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  29.36 
 
 		 399 aa  96.3  1e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.118826 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06295  hypothetical protein  22.63 
 
 		 387 aa  95.1  2e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0183  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.8 
 
 		 416 aa  95.1  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000244367  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0173  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.8 
 
 		 416 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0181141  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0167  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.36 
 
 		 398 aa  95.1  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0226  drug resistance transporter, Bcr/CflA family  30.8 
 
 		 416 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0202  drug resistance transporter, Bcr/CflA family  30.8 
 
 		 416 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5119  drug resistance transporter, Bcr/CflA family  30.8 
 
 		 416 aa  95.5  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0181  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.8 
 
 		 416 aa  95.1  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2788  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.04 
 
 		 389 aa  95.1  2e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0332558  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3262  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.03 
 
 		 414 aa  95.1  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.35835  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0170  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.8 
 
 		 419 aa  94.7  3e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000813415  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2852  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  23.68 
 
 		 409 aa  94.4  3e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1904  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  33.85 
 
 		 425 aa  94.7  3e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1982  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  24.58 
 
 		 416 aa  94  4e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0012  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  26.78 
 
 		 395 aa  94  5e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.502887  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4515  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.33 
 
 		 396 aa  94  5e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3171  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.18 
 
 		 387 aa  93.6  6e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.229989  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3432  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  30.05 
 
 		 438 aa  93.2  7e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00363219  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1599  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  27.93 
 
 		 384 aa  93.6  7e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0206  drug resistance transporter, Bcr/CflA family  30.8 
 
 		 416 aa  93.6  7e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.993392  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2139  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.52 
 
 		 400 aa  93.2  8e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.935322  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2008  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.52 
 
 		 400 aa  93.2  8e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.365941  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3096  major facilitator transporter  28.52 
 
 		 411 aa  93.2  8e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2605  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.52 
 
 		 400 aa  93.2  8e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0772  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.52 
 
 		 400 aa  93.2  8e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18090  major facilitator subfamily transporter protein  28.97 
 
 		 392 aa  93.2  8e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3008  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.52 
 
 		 411 aa  92.8  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3061  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.52 
 
 		 411 aa  92.8  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.195129  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3315  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.54 
 
 		 387 aa  92.8  1e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.444608 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2792  bicyclomycin/multidrug efflux system  23.63 
 
 		 401 aa  92  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2437  bicyclomycin/multidrug efflux system  23.76 
 
 		 393 aa  92  2e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.413789  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1571  MFS family transporter  28.97 
 
 		 392 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3562  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  29.21 
 
 		 392 aa  92  2e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.424378  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3830  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  30.16 
 
 		 413 aa  92  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.423466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15670  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  27.22 
 
 		 396 aa  92  2e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.789382  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1491  bicyclomycin/multidrug efflux system  23.63 
 
 		 399 aa  91.3  3e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.646257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2717  bicyclomycin/multidrug efflux system  23.63 
 
 		 399 aa  91.3  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0392308  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2657  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.04 
 
 		 425 aa  90.9  4e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3172  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.91 
 
 		 387 aa  90.1  6e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008321  Shewmr4_1936  multidrug resistance protein D  25.59 
 
 		 414 aa  90.1  7e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000117708 
 
 
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NC_011663  Sbal223_1199  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  26.91 
 
 		 387 aa  89.7  8e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008322  Shewmr7_2040  multidrug resistance protein D  25.06 
 
 		 414 aa  89.7  9e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.399526  normal  0.139954 
 
 
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