More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_3339 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_3339  coproporphyrinogen III oxidase  100 
 
 
479 aa  994    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1750  coproporphyrinogen III oxidase  40.98 
 
 
440 aa  324  2e-87  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0716204  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05245  coproporphyrinogen III oxidase  41.87 
 
 
456 aa  316  5e-85  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001356  coproporphyrinogen III oxidase, oxygen-independent  41.83 
 
 
456 aa  310  5e-83  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.134261  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0328  coproporphyrinogen III oxidase  39.39 
 
 
455 aa  298  1e-79  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000349479  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2750  coproporphyrinogen III oxidase  36.26 
 
 
437 aa  269  8e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.892772  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1519  coproporphyrinogen III oxidase  36.04 
 
 
437 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.313435  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0384  coproporphyrinogen III oxidase  34.32 
 
 
452 aa  263  6.999999999999999e-69  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4862  coproporphyrinogen III oxidase  33.8 
 
 
445 aa  250  3e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.29137 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3797  coproporphyrinogen III oxidase  34.22 
 
 
437 aa  249  6e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0786791  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3885  coproporphyrinogen III oxidase  34 
 
 
437 aa  249  8e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0654  coproporphyrinogen III oxidase  34.67 
 
 
414 aa  248  2e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.044324  normal  0.350944 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3805  coproporphyrinogen III oxidase  33.33 
 
 
445 aa  247  4e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0536703 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2413  coproporphyrinogen III oxidase  34.3 
 
 
486 aa  219  7e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2352  coproporphyrinogen III oxidase  34.75 
 
 
480 aa  216  5.9999999999999996e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.830506  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1971  coproporphyrinogen III oxidase  32.19 
 
 
471 aa  214  3.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.794108  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0164  coproporphyrinogen III oxidase  33.26 
 
 
474 aa  210  4e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2500  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  31.12 
 
 
378 aa  132  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000623828  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1176  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase, putative  25.29 
 
 
422 aa  130  5.0000000000000004e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.238058  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1304  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  31.17 
 
 
381 aa  124  5e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2366  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  32.02 
 
 
410 aa  123  6e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3043  coproporphyrinogen III oxidase  28.25 
 
 
378 aa  123  8e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000458873  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0588  Coproporphyrinogen dehydrogenase  25.42 
 
 
415 aa  122  1.9999999999999998e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3320  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  27.92 
 
 
357 aa  120  3.9999999999999996e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00918826  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1363  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  32.14 
 
 
389 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4462  coproporphyrinogen III oxidase  32.09 
 
 
435 aa  120  6e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0691  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  28.42 
 
 
380 aa  119  1.9999999999999998e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1108  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  25.14 
 
 
360 aa  118  1.9999999999999998e-25  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4168  coproporphyrinogen III oxidase  26.97 
 
 
379 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0038285  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4064  coproporphyrinogen III oxidase  26.97 
 
 
379 aa  118  3e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.659192  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4436  coproporphyrinogen III oxidase  26.97 
 
 
379 aa  118  3e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000959102  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0800  coproporphyrinogen III oxidase  27.54 
 
 
379 aa  118  3e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000109269  hitchhiker  5.6543700000000005e-18 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4450  coproporphyrinogen III oxidase  26.97 
 
 
378 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000131876  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4216  coproporphyrinogen III oxidase  26.97 
 
 
379 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2223  coproporphyrinogen III oxidase  28.83 
 
 
396 aa  117  3.9999999999999997e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4542  coproporphyrinogen III oxidase  26.97 
 
 
378 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.3385  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0582  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  29.11 
 
 
388 aa  117  5e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1194  coproporphyrinogen III oxidase  29.13 
 
 
421 aa  117  5e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0134211 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0873  Radical SAM domain protein  26.35 
 
 
443 aa  117  6e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0647  quinone-reactive Ni/Fe hydrogenase, large subunit  25.85 
 
 
406 aa  117  6.9999999999999995e-25  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4054  coproporphyrinogen III oxidase  26.97 
 
 
379 aa  116  7.999999999999999e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.749761  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3828  coproporphyrinogen III oxidase  25.9 
 
 
460 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4339  coproporphyrinogen III oxidase  27.06 
 
 
378 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.26628e-29 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4398  coproporphyrinogen III oxidase  26.64 
 
 
378 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.601746  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3508  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  29.3 
 
 
381 aa  114  3e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.230764  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0843  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  31.86 
 
 
394 aa  114  5e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.199924  normal  0.0119015 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_10143  predicted protein  32.18 
 
 
408 aa  114  5e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00183786  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2002  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  25.06 
 
 
448 aa  113  6e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.55227  normal  0.313368 
 
 
-
 
NC_002950  PG0475  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase, putative  31.1 
 
 
376 aa  113  7.000000000000001e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0110  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase, putative  32.78 
 
 
393 aa  113  7.000000000000001e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000543862  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3386  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  25.41 
 
 
460 aa  113  7.000000000000001e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00479262  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0739  coproporphyrinogen III oxidase  31.67 
 
 
447 aa  113  8.000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2244  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  28.49 
 
 
384 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0144  Coproporphyrinogen dehydrogenase  28.08 
 
 
465 aa  112  2.0000000000000002e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4155  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  32.85 
 
 
416 aa  112  2.0000000000000002e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2187  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  31.3 
 
 
390 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000177967  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1464  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  24.93 
 
 
462 aa  111  3e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000299867  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14971  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  27.93 
 
 
407 aa  110  4.0000000000000004e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.90779  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1177  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  28.18 
 
 
372 aa  111  4.0000000000000004e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4269  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  25.88 
 
 
401 aa  110  4.0000000000000004e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.281837  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1675  coproporphyrinogen III oxidase  27.44 
 
 
374 aa  110  5e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.370593  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1641  coproporphyrinogen III oxidase  27.44 
 
 
374 aa  110  5e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.905653  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1516  coproporphyrinogen III oxidase  27.8 
 
 
405 aa  110  5e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.493092  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5458  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  28.34 
 
 
406 aa  110  6e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2161  coproporphyrinogen III oxidase  28.9 
 
 
424 aa  110  6e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0050137  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1546  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  33.33 
 
 
400 aa  110  6e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.271774  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0030  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase, putative  31.14 
 
 
385 aa  110  8.000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.949331  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2113  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  27.4 
 
 
369 aa  109  8.000000000000001e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.512598  normal  0.05877 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19991  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  32.88 
 
 
436 aa  110  8.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.206025 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1626  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  26.27 
 
 
387 aa  109  9.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.981357 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1999  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  31.97 
 
 
388 aa  109  1e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.865362  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3351  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  27.97 
 
 
384 aa  109  1e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3875  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  27.14 
 
 
406 aa  109  1e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2282  coproporphyrinogen III oxidase  28.14 
 
 
422 aa  109  1e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.485067  normal  0.946355 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2479  coproporphyrinogen III oxidase  26.73 
 
 
413 aa  108  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.226119  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13591  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  30.31 
 
 
415 aa  108  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.275317  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0850  coproporphyrinogen III oxidase  26.27 
 
 
419 aa  108  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.260825  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2357  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  33.18 
 
 
466 aa  108  2e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0972265  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6524  Coproporphyrinogen dehydrogenase  30.89 
 
 
431 aa  108  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3577  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  32.99 
 
 
390 aa  108  2e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0892028  normal  0.365381 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1962  coproporphyrinogen III oxidase  28.51 
 
 
422 aa  108  3e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.154783  normal  0.857394 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0789  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  31.96 
 
 
393 aa  108  3e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.284669  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0816  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  32.64 
 
 
396 aa  108  3e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.847489  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4335  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  31.86 
 
 
389 aa  107  4e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3535  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  31.65 
 
 
383 aa  107  4e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000160096  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1408  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  28.53 
 
 
407 aa  107  5e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3639  coproporphyrinogen III oxidase  28.98 
 
 
414 aa  107  5e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0068  coproporphyrinogen III oxidase  34.01 
 
 
408 aa  107  6e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14721  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  26.73 
 
 
407 aa  107  6e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3577  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  28.94 
 
 
381 aa  107  6e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3612  coproporphyrinogen III oxidase  34.2 
 
 
379 aa  107  6e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4026  coproporphyrinogen III oxidase  28.33 
 
 
407 aa  107  7e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.799175  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2693  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  32.31 
 
 
387 aa  106  7e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1289  coproporphyrinogen III oxidase  29.28 
 
 
473 aa  107  7e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1571  coproporphyrinogen III oxidase  23.85 
 
 
453 aa  107  7e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000177625  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1341  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  32.12 
 
 
394 aa  106  8e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3244  coproporphyrinogen III oxidase  29.86 
 
 
480 aa  106  9e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0142288 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3559  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  30.2 
 
 
393 aa  106  9e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4974  coproporphyrinogen III oxidase  32.82 
 
 
391 aa  106  9e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0770  coproporphyrinogen III oxidase  33.16 
 
 
378 aa  105  1e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.261122  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>