More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_0647 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009715  CCV52592_0647  quinone-reactive Ni/Fe hydrogenase, large subunit  100 
 
 
406 aa  837    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0588  Coproporphyrinogen dehydrogenase  47.95 
 
 
415 aa  401  1e-111  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1176  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase, putative  35.25 
 
 
422 aa  222  8e-57  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.238058  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1519  coproporphyrinogen III oxidase  25 
 
 
437 aa  156  6e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.313435  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2750  coproporphyrinogen III oxidase  25.51 
 
 
437 aa  155  1e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.892772  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3797  coproporphyrinogen III oxidase  28.03 
 
 
437 aa  149  1.0000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0786791  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3885  coproporphyrinogen III oxidase  27.68 
 
 
437 aa  148  2.0000000000000003e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0654  coproporphyrinogen III oxidase  27.68 
 
 
414 aa  148  2.0000000000000003e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.044324  normal  0.350944 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4862  coproporphyrinogen III oxidase  26.24 
 
 
445 aa  141  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.29137 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3805  coproporphyrinogen III oxidase  26.37 
 
 
445 aa  141  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0536703 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1971  coproporphyrinogen III oxidase  24.91 
 
 
471 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.794108  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1750  coproporphyrinogen III oxidase  25.42 
 
 
440 aa  127  3e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0716204  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0384  coproporphyrinogen III oxidase  26.81 
 
 
452 aa  126  9e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1151  coproporphyrinogen III oxidase  37.17 
 
 
374 aa  122  9.999999999999999e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0328  coproporphyrinogen III oxidase  24.6 
 
 
455 aa  122  9.999999999999999e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000349479  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0299  putative coproporphyrinogen III oxidase  30.49 
 
 
490 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.587871  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2413  coproporphyrinogen III oxidase  28.85 
 
 
486 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1216  coproporphyrinogen III oxidase  27.6 
 
 
378 aa  120  3.9999999999999996e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3320  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  30.43 
 
 
357 aa  119  9.999999999999999e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00918826  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001356  coproporphyrinogen III oxidase, oxygen-independent  25.06 
 
 
456 aa  119  9.999999999999999e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.134261  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1249  coproporphyrinogen III oxidase  28.29 
 
 
379 aa  117  3e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2352  coproporphyrinogen III oxidase  29.81 
 
 
480 aa  117  5e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.830506  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3043  coproporphyrinogen III oxidase  30.95 
 
 
378 aa  117  5e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000458873  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3339  coproporphyrinogen III oxidase  25.85 
 
 
479 aa  116  6e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4168  coproporphyrinogen III oxidase  30.31 
 
 
379 aa  116  7.999999999999999e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0038285  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0873  Radical SAM domain protein  29.82 
 
 
443 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4450  coproporphyrinogen III oxidase  30.31 
 
 
378 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000131876  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05245  coproporphyrinogen III oxidase  23.65 
 
 
456 aa  115  1.0000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4339  coproporphyrinogen III oxidase  29.92 
 
 
378 aa  114  3e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.26628e-29 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1675  coproporphyrinogen III oxidase  33.51 
 
 
374 aa  114  4.0000000000000004e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.370593  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1641  coproporphyrinogen III oxidase  33.51 
 
 
374 aa  114  4.0000000000000004e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.905653  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0800  coproporphyrinogen III oxidase  30.31 
 
 
379 aa  113  5e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000109269  hitchhiker  5.6543700000000005e-18 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4436  coproporphyrinogen III oxidase  30.31 
 
 
379 aa  113  5e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000959102  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0165  coproporphyrinogen oxidase (coproporphyrinogen III oxidase)  30.3 
 
 
373 aa  113  6e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.763893  normal  0.238012 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4542  coproporphyrinogen III oxidase  29.53 
 
 
378 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.3385  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3361  coproporphyrinogen III oxidase  28.73 
 
 
380 aa  112  8.000000000000001e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00679793 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4216  coproporphyrinogen III oxidase  29.53 
 
 
379 aa  112  9e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4398  coproporphyrinogen III oxidase  29.92 
 
 
378 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.601746  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3447  coproporphyrinogen III oxidase  27.37 
 
 
378 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.286445 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4054  coproporphyrinogen III oxidase  29.53 
 
 
379 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.749761  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4064  coproporphyrinogen III oxidase  29.53 
 
 
379 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.659192  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1289  coproporphyrinogen III oxidase  29.02 
 
 
473 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0380  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  28.37 
 
 
379 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.182118  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0488  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  29.29 
 
 
374 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3343  coproporphyrinogen III oxidase  27.01 
 
 
378 aa  111  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.368838 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1649  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  28.57 
 
 
374 aa  110  3e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0936  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  28.62 
 
 
383 aa  110  3e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3278  coproporphyrinogen III oxidase  27.01 
 
 
378 aa  111  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.026335 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3351  coproporphyrinogen III oxidase  27.01 
 
 
378 aa  110  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.315269 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0164  coproporphyrinogen III oxidase  28.22 
 
 
474 aa  110  5e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1148  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  24.61 
 
 
403 aa  108  2e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.61254 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1583  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  27.46 
 
 
374 aa  108  2e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2843  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  30.85 
 
 
374 aa  108  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.225724  normal  0.624237 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1108  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  30.65 
 
 
360 aa  108  2e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0816  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  25.83 
 
 
396 aa  107  3e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.847489  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0890  coproporphyrinogen III oxidase  26.4 
 
 
376 aa  107  3e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.112069  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3267  coproporphyrinogen III oxidase  26.64 
 
 
378 aa  107  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6524  Coproporphyrinogen dehydrogenase  24.24 
 
 
431 aa  107  3e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1341  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  24.35 
 
 
394 aa  107  4e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4974  coproporphyrinogen III oxidase  24.63 
 
 
391 aa  107  4e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1109  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  31.11 
 
 
377 aa  107  5e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.298913  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2483  coproporphyrinogen III oxidase  24.89 
 
 
484 aa  107  5e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00279185  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3720  coproporphyrinogen III oxidase  25.62 
 
 
446 aa  106  6e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.959602  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1569  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  24.66 
 
 
411 aa  106  6e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0883271  normal  0.0181268 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4493  coproporphyrinogen III oxidase  26.25 
 
 
446 aa  106  6e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.320649 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0047  coproporphyrinogen III oxidase  26.25 
 
 
446 aa  106  6e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.577126  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4351  coproporphyrinogen III oxidase  26.25 
 
 
446 aa  106  6e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3913  coproporphyrinogen III oxidase  27.62 
 
 
446 aa  106  6e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2375  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  30.32 
 
 
374 aa  106  6e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.950801  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4296  coproporphyrinogen III oxidase  26.25 
 
 
446 aa  106  7e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000258009 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04915  coproporphyrinogen III oxidase  26.94 
 
 
376 aa  106  7e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2440  coproporphyrinogen III oxidase  32.46 
 
 
382 aa  106  8e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000264436  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3299  coproporphyrinogen III oxidase  27.17 
 
 
378 aa  106  8e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3097  coproporphyrinogen III oxidase  26.64 
 
 
378 aa  106  9e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000345052 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02785  coproporphyrinogen III oxidase  26.62 
 
 
378 aa  105  1e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.179359  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0740  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  26.64 
 
 
378 aa  105  1e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3387  coproporphyrinogen III oxidase  26.64 
 
 
378 aa  105  1e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4730  coproporphyrinogen III oxidase  26.25 
 
 
458 aa  105  1e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2374  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  26.09 
 
 
448 aa  105  1e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4258  coproporphyrinogen III oxidase  26.64 
 
 
378 aa  105  1e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0759  coproporphyrinogen III oxidase  26.64 
 
 
378 aa  105  1e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000573813 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3115  coproporphyrinogen III oxidase  26.64 
 
 
378 aa  105  1e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02748  hypothetical protein  26.62 
 
 
378 aa  105  1e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.153415  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0770  coproporphyrinogen III oxidase  25.55 
 
 
378 aa  105  2e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.261122  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1980  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  30.73 
 
 
380 aa  105  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000136099  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0394  coproporphyrinogen III oxidase  30.1 
 
 
393 aa  105  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5458  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  23.67 
 
 
406 aa  105  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2366  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  27.07 
 
 
410 aa  105  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4003  coproporphyrinogen III oxidase  25.94 
 
 
446 aa  105  2e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.258904 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4116  coproporphyrinogen III oxidase  25.94 
 
 
446 aa  105  2e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0475  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase, putative  25.51 
 
 
376 aa  104  3e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1999  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  27.05 
 
 
388 aa  104  3e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.865362  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2199  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  26.74 
 
 
448 aa  104  3e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.186673  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3911  coproporphyrinogen III oxidase  25.94 
 
 
446 aa  104  3e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0495726 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2010  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  29.95 
 
 
371 aa  104  3e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0030  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase, putative  24.23 
 
 
385 aa  103  4e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.949331  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0115  coproporphyrinogen III oxidase  24.87 
 
 
465 aa  103  4e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0026  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  29.08 
 
 
468 aa  103  4e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1638  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  32.14 
 
 
349 aa  103  5e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3351  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  25.84 
 
 
384 aa  103  6e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>