More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_05245 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013457  VEA_001356  coproporphyrinogen III oxidase, oxygen-independent  87.94 
 
 
456 aa  808    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.134261  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05245  coproporphyrinogen III oxidase  100 
 
 
456 aa  956    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0328  coproporphyrinogen III oxidase  68.28 
 
 
455 aa  630  1e-179  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000349479  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1750  coproporphyrinogen III oxidase  57.21 
 
 
440 aa  523  1e-147  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0716204  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3339  coproporphyrinogen III oxidase  42.08 
 
 
479 aa  335  1e-90  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3797  coproporphyrinogen III oxidase  38.41 
 
 
437 aa  301  2e-80  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0786791  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3885  coproporphyrinogen III oxidase  38.17 
 
 
437 aa  300  2e-80  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0654  coproporphyrinogen III oxidase  38.73 
 
 
414 aa  298  2e-79  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.044324  normal  0.350944 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1519  coproporphyrinogen III oxidase  39.11 
 
 
437 aa  280  3e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.313435  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0384  coproporphyrinogen III oxidase  36.71 
 
 
452 aa  280  4e-74  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2750  coproporphyrinogen III oxidase  39.11 
 
 
437 aa  279  7e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.892772  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3805  coproporphyrinogen III oxidase  36.17 
 
 
445 aa  263  3e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0536703 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4862  coproporphyrinogen III oxidase  35.92 
 
 
445 aa  263  6e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.29137 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2413  coproporphyrinogen III oxidase  33.57 
 
 
486 aa  199  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0164  coproporphyrinogen III oxidase  33.1 
 
 
474 aa  198  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1971  coproporphyrinogen III oxidase  31.99 
 
 
471 aa  191  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.794108  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2352  coproporphyrinogen III oxidase  32.86 
 
 
480 aa  180  4e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.830506  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0588  Coproporphyrinogen dehydrogenase  25 
 
 
415 aa  140  4.999999999999999e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1363  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  28.35 
 
 
389 aa  139  8.999999999999999e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1176  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase, putative  24.53 
 
 
422 aa  139  1e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.238058  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3043  coproporphyrinogen III oxidase  28.39 
 
 
378 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000458873  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4436  coproporphyrinogen III oxidase  27.82 
 
 
379 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000959102  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0647  quinone-reactive Ni/Fe hydrogenase, large subunit  23.65 
 
 
406 aa  135  9.999999999999999e-31  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0800  coproporphyrinogen III oxidase  27.82 
 
 
379 aa  134  3e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000109269  hitchhiker  5.6543700000000005e-18 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4168  coproporphyrinogen III oxidase  27.7 
 
 
379 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0038285  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2082  coproporphyrinogen III oxidase  25.75 
 
 
375 aa  133  6e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4450  coproporphyrinogen III oxidase  27.63 
 
 
378 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000131876  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4064  coproporphyrinogen III oxidase  29.9 
 
 
379 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.659192  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4339  coproporphyrinogen III oxidase  27.44 
 
 
378 aa  130  6e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.26628e-29 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4216  coproporphyrinogen III oxidase  27.37 
 
 
379 aa  130  7.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4542  coproporphyrinogen III oxidase  27.37 
 
 
378 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.3385  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2440  coproporphyrinogen III oxidase  29.16 
 
 
382 aa  130  7.000000000000001e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000264436  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4054  coproporphyrinogen III oxidase  27.37 
 
 
379 aa  129  9.000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.749761  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4398  coproporphyrinogen III oxidase  27.37 
 
 
378 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.601746  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0873  Radical SAM domain protein  27.61 
 
 
443 aa  127  4.0000000000000003e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1151  coproporphyrinogen III oxidase  29.43 
 
 
374 aa  126  7e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1675  coproporphyrinogen III oxidase  29.41 
 
 
374 aa  126  9e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.370593  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1641  coproporphyrinogen III oxidase  29.41 
 
 
374 aa  126  9e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.905653  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2366  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  34.2 
 
 
410 aa  124  2e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3018  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  26.51 
 
 
393 aa  125  2e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0185  coproporphyrinogen III oxidase  31.43 
 
 
409 aa  125  2e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.867892  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0170  coproporphyrinogen III oxidase  31.41 
 
 
404 aa  123  5e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.379163  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0176  coproporphyrinogen III oxidase  31.41 
 
 
385 aa  123  8e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0760  coproporphyrinogen III oxidase  30 
 
 
383 aa  117  3.9999999999999997e-25  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1341  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  29.82 
 
 
394 aa  117  5e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13360  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  28.18 
 
 
418 aa  116  6.9999999999999995e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.186133  normal  0.0883125 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1249  coproporphyrinogen III oxidase  27.13 
 
 
379 aa  116  7.999999999999999e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0847  coproporphyrinogen III oxidase  30 
 
 
383 aa  116  1.0000000000000001e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1582  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  25.93 
 
 
381 aa  115  1.0000000000000001e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000332518  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0691  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  28.02 
 
 
380 aa  115  1.0000000000000001e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4155  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  34.5 
 
 
416 aa  114  3e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1337  coproporphyrinogen III oxidase  29.14 
 
 
392 aa  114  3e-24  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0003  coproporphyrinogen III oxidase  30.4 
 
 
401 aa  114  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.045882 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1010  coproporphyrinogen III oxidase  27.57 
 
 
379 aa  114  3e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4974  coproporphyrinogen III oxidase  29.35 
 
 
391 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0455  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  27.46 
 
 
391 aa  114  5e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.664559  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0850  coproporphyrinogen III oxidase  29.13 
 
 
419 aa  114  5e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.260825  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0003  coproporphyrinogen III oxidase  30.4 
 
 
400 aa  114  5e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.242877  hitchhiker  0.00414143 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2033  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  29.3 
 
 
414 aa  113  6e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.772986 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2500  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  24.6 
 
 
378 aa  113  6e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000623828  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0816  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  33.16 
 
 
396 aa  113  7.000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.847489  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2063  coproporphyrinogen III oxidase  26.94 
 
 
384 aa  113  8.000000000000001e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1216  coproporphyrinogen III oxidase  26.46 
 
 
378 aa  113  8.000000000000001e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0858  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase, putative  25.46 
 
 
378 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0560367  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2199  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  32.05 
 
 
448 aa  112  1.0000000000000001e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.186673  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0471  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  27.86 
 
 
392 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.039333  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0582  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  25.2 
 
 
388 aa  112  1.0000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2002  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  23.89 
 
 
448 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.55227  normal  0.313368 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3508  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  31.75 
 
 
381 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.230764  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4393  coproporphyrinogen III oxidase  26.46 
 
 
472 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000149984 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1631  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  28.94 
 
 
394 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.526463  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3288  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  27.02 
 
 
396 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3668  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  26.41 
 
 
388 aa  111  3e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.231493  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1001  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  26.02 
 
 
424 aa  111  3e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3853  coproporphyrinogen III oxidase  34.2 
 
 
399 aa  111  3e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.800608  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2479  coproporphyrinogen III oxidase  28.66 
 
 
413 aa  111  3e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.226119  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1980  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  21.95 
 
 
380 aa  111  3e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000136099  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2205  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  28.28 
 
 
484 aa  111  3e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.434843  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2963  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  29.32 
 
 
387 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000535992  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0364  coproporphyrinogen III oxidase  28.57 
 
 
395 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.250524  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1626  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  29.55 
 
 
387 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.981357 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0394  coproporphyrinogen III oxidase  30.4 
 
 
393 aa  110  5e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2375  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  27.14 
 
 
374 aa  110  5e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.950801  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0541  coproporphyrinogen III oxidase  28.32 
 
 
454 aa  110  6e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5101  coproporphyrinogen III oxidase  28.36 
 
 
391 aa  110  6e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.608313  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0475  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase, putative  29.08 
 
 
376 aa  110  6e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4323  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  32.47 
 
 
419 aa  110  6e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4013  coproporphyrinogen III oxidase  29.56 
 
 
387 aa  110  6e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00338322  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2293  coproporphyrinogen III oxidase  26.75 
 
 
377 aa  110  6e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3582  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  28.37 
 
 
385 aa  110  6e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3306  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  25.3 
 
 
423 aa  110  7.000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.661128  normal  0.0726751 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0007  coproporphyrinogen III oxidase  29.1 
 
 
381 aa  109  8.000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000223665 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0890  coproporphyrinogen III oxidase  27.04 
 
 
376 aa  109  1e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.112069  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_761  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  26.03 
 
 
378 aa  109  1e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000202557  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1999  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  28.05 
 
 
388 aa  109  1e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.865362  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1583  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  26.44 
 
 
374 aa  109  1e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0299  putative coproporphyrinogen III oxidase  31.66 
 
 
490 aa  108  1e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.587871  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1980  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  28.47 
 
 
385 aa  109  1e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.958254  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2346  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase, putative  28.47 
 
 
385 aa  109  1e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4335  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  27.6 
 
 
389 aa  108  1e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>