More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_1408 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008817  P9515_14721  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  77.89 
 
 
407 aa  676    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1408  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  100 
 
 
407 aa  835    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14971  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  89.19 
 
 
407 aa  760    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.90779  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15101  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  89.19 
 
 
407 aa  761    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.574259  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19991  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  47.51 
 
 
436 aa  419  1e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.206025 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13591  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  48.76 
 
 
415 aa  416  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.275317  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0877  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  49.01 
 
 
410 aa  416  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.35495  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17311  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  49.01 
 
 
410 aa  416  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.24625  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0843  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  44.91 
 
 
394 aa  384  1e-105  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.199924  normal  0.0119015 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1546  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  44.42 
 
 
400 aa  378  1e-103  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.271774  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2223  coproporphyrinogen III oxidase  37.53 
 
 
396 aa  277  2e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4269  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  36.27 
 
 
401 aa  276  6e-73  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.281837  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4462  coproporphyrinogen III oxidase  37.17 
 
 
435 aa  273  3e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2382  coproporphyrinogen III oxidase  35.45 
 
 
396 aa  270  2.9999999999999997e-71  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0342073 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3505  coproporphyrinogen III oxidase  37.35 
 
 
414 aa  269  7e-71  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.699164  normal  0.0919169 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2601  coproporphyrinogen III oxidase  37.35 
 
 
414 aa  269  7e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1516  coproporphyrinogen III oxidase  33.17 
 
 
405 aa  256  3e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.493092  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1194  coproporphyrinogen III oxidase  35.27 
 
 
421 aa  250  3e-65  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0134211 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_10143  predicted protein  35.47 
 
 
408 aa  237  2e-61  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00183786  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3535  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  34.14 
 
 
383 aa  215  9.999999999999999e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000160096  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0030  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase, putative  32.11 
 
 
385 aa  206  5e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.949331  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43572  predicted protein  31.79 
 
 
516 aa  206  5e-52  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3577  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  33.08 
 
 
381 aa  205  1e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1228  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  32.82 
 
 
380 aa  200  3.9999999999999996e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0208  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  32.75 
 
 
381 aa  199  7e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000567402  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3508  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  32.25 
 
 
381 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.230764  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2008  coproporphyrinogen III oxidase  31.9 
 
 
377 aa  195  1e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3351  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  30.9 
 
 
384 aa  193  4e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2293  coproporphyrinogen III oxidase  31.39 
 
 
377 aa  192  6e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1363  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  31.25 
 
 
389 aa  191  2e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3043  coproporphyrinogen III oxidase  34.51 
 
 
378 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000458873  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2082  coproporphyrinogen III oxidase  31.46 
 
 
375 aa  189  5.999999999999999e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4168  coproporphyrinogen III oxidase  32.67 
 
 
379 aa  189  5.999999999999999e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0038285  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0007  coproporphyrinogen III oxidase  31.23 
 
 
381 aa  189  8e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000223665 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4054  coproporphyrinogen III oxidase  32.11 
 
 
379 aa  187  2e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.749761  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4064  coproporphyrinogen III oxidase  32.4 
 
 
379 aa  188  2e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.659192  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4216  coproporphyrinogen III oxidase  32.11 
 
 
379 aa  187  4e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4450  coproporphyrinogen III oxidase  31.85 
 
 
378 aa  186  5e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000131876  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4542  coproporphyrinogen III oxidase  32.11 
 
 
378 aa  186  5e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.3385  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0800  coproporphyrinogen III oxidase  31.85 
 
 
379 aa  186  6e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000109269  hitchhiker  5.6543700000000005e-18 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1999  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  29.61 
 
 
388 aa  186  7e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.865362  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4398  coproporphyrinogen III oxidase  31.85 
 
 
378 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.601746  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1249  coproporphyrinogen III oxidase  30.4 
 
 
379 aa  185  1.0000000000000001e-45  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4436  coproporphyrinogen III oxidase  32.57 
 
 
379 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000959102  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0394  coproporphyrinogen III oxidase  29.75 
 
 
393 aa  184  3e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4339  coproporphyrinogen III oxidase  31.85 
 
 
378 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.26628e-29 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1325  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  31.39 
 
 
380 aa  183  6e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2500  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  32.32 
 
 
378 aa  181  2e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000623828  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0471  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  29.95 
 
 
392 aa  181  2e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.039333  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3577  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  29.64 
 
 
390 aa  181  2e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0892028  normal  0.365381 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0003  coproporphyrinogen III oxidase  30.13 
 
 
400 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.242877  hitchhiker  0.00414143 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0003  coproporphyrinogen III oxidase  30.13 
 
 
401 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.045882 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1337  coproporphyrinogen III oxidase  29.22 
 
 
392 aa  180  4e-44  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1582  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  29.47 
 
 
381 aa  179  7e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000332518  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1631  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  30.79 
 
 
394 aa  179  8e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.526463  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0110  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase, putative  34.42 
 
 
393 aa  179  9e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000543862  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1553  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  30.75 
 
 
423 aa  179  1e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0149  coproporphyrinogen III oxidase  32.25 
 
 
386 aa  177  3e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0330  coproporphyrinogen III oxidase  31.86 
 
 
385 aa  177  4e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.154347  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1304  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  31.27 
 
 
381 aa  177  4e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1675  coproporphyrinogen III oxidase  30.36 
 
 
374 aa  175  9.999999999999999e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.370593  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1641  coproporphyrinogen III oxidase  30.36 
 
 
374 aa  175  9.999999999999999e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.905653  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4013  coproporphyrinogen III oxidase  29.4 
 
 
387 aa  175  9.999999999999999e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00338322  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0582  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  27.82 
 
 
388 aa  174  2.9999999999999996e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0024  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  29.43 
 
 
398 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0304834 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0191  coproporphyrinogen III oxidase  30.75 
 
 
386 aa  173  3.9999999999999995e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.605644 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0436  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  29.43 
 
 
398 aa  173  5e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.355394  normal  0.414795 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1109  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  31.5 
 
 
377 aa  173  5.999999999999999e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.298913  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1010  coproporphyrinogen III oxidase  32.64 
 
 
379 aa  173  5.999999999999999e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12830  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  32.67 
 
 
385 aa  172  6.999999999999999e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.402755  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2155  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  28.53 
 
 
389 aa  172  6.999999999999999e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2205  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  28.82 
 
 
484 aa  172  9e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.434843  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0184  coproporphyrinogen III oxidase  30.72 
 
 
385 aa  171  2e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0185  coproporphyrinogen III oxidase  29.33 
 
 
409 aa  171  2e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.867892  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4155  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  28.89 
 
 
416 aa  171  2e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0890  coproporphyrinogen III oxidase  29.37 
 
 
376 aa  170  4e-41  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.112069  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2440  coproporphyrinogen III oxidase  33.73 
 
 
382 aa  170  4e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000264436  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0603  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  28.29 
 
 
378 aa  170  5e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2033  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  28.9 
 
 
414 aa  169  6e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.772986 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0403  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  29.25 
 
 
405 aa  169  7e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.68433  normal  0.919308 
 
 
-
 
NC_004310  BR0176  coproporphyrinogen III oxidase  27.89 
 
 
385 aa  169  7e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0170  coproporphyrinogen III oxidase  27.89 
 
 
404 aa  169  9e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.379163  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0630  coproporphyrinogen III oxidase  32.49 
 
 
393 aa  169  9e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.824124  normal  0.0911038 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4306  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  30.12 
 
 
375 aa  168  1e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0329595  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1177  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  32.84 
 
 
372 aa  168  1e-40  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4035  coproporphyrinogen III oxidase  36.07 
 
 
379 aa  169  1e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.023291 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0691  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  28.61 
 
 
380 aa  167  2e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0027  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  28.5 
 
 
387 aa  168  2e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.444781  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1151  coproporphyrinogen III oxidase  29.08 
 
 
374 aa  167  4e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0936  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  31.92 
 
 
383 aa  167  4e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0697  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  31.08 
 
 
410 aa  167  4e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.504316 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0816  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  29.13 
 
 
396 aa  167  4e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.847489  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1649  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  30.3 
 
 
374 aa  166  5e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2537  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  26.57 
 
 
399 aa  166  5.9999999999999996e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.878033 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0536  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  29.38 
 
 
578 aa  166  8e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.448786  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0755  coproporphyrinogen III oxidase  35.34 
 
 
379 aa  166  8e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0052  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  28.26 
 
 
390 aa  166  8e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0403831  normal  0.42577 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2703  putative anaerobic coproporphyrinogen III oxidase oxidoreductase protein  29.06 
 
 
417 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3612  coproporphyrinogen III oxidase  34.64 
 
 
379 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2405  coproporphyrinogen III oxidase  28.86 
 
 
404 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>