More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_1546 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_1546  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  100 
 
 
400 aa  816    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.271774  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0843  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  68.96 
 
 
394 aa  541  9.999999999999999e-153  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.199924  normal  0.0119015 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19991  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  63.83 
 
 
436 aa  506  9.999999999999999e-143  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.206025 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13591  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  52.68 
 
 
415 aa  447  1.0000000000000001e-124  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.275317  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0877  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  50.37 
 
 
410 aa  435  1e-121  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.35495  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17311  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  49.38 
 
 
410 aa  427  1e-118  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.24625  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14721  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  46.15 
 
 
407 aa  391  1e-107  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14971  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  46.15 
 
 
407 aa  389  1e-107  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.90779  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15101  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  46.15 
 
 
407 aa  388  1e-106  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.574259  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1408  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  44.42 
 
 
407 aa  378  1e-103  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2382  coproporphyrinogen III oxidase  45.34 
 
 
396 aa  311  1e-83  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0342073 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2601  coproporphyrinogen III oxidase  40.64 
 
 
414 aa  311  1e-83  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3505  coproporphyrinogen III oxidase  40.64 
 
 
414 aa  310  2e-83  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.699164  normal  0.0919169 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2223  coproporphyrinogen III oxidase  41.07 
 
 
396 aa  305  9.000000000000001e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1516  coproporphyrinogen III oxidase  42.82 
 
 
405 aa  298  1e-79  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.493092  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4462  coproporphyrinogen III oxidase  40.45 
 
 
435 aa  297  2e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4269  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  40.31 
 
 
401 aa  296  3e-79  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.281837  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1194  coproporphyrinogen III oxidase  38.46 
 
 
421 aa  271  1e-71  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0134211 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_10143  predicted protein  38.78 
 
 
408 aa  268  2e-70  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00183786  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43572  predicted protein  34.52 
 
 
516 aa  232  9e-60  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1363  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  35.68 
 
 
389 aa  218  2e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3043  coproporphyrinogen III oxidase  33.68 
 
 
378 aa  216  4e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000458873  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0691  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  34.41 
 
 
380 aa  216  5.9999999999999996e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1999  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  36.44 
 
 
388 aa  213  4.9999999999999996e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.865362  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0890  coproporphyrinogen III oxidase  32.3 
 
 
376 aa  212  9e-54  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.112069  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1228  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  36.15 
 
 
380 aa  210  4e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4168  coproporphyrinogen III oxidase  32.74 
 
 
379 aa  210  4e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0038285  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1108  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  34.55 
 
 
360 aa  209  6e-53  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1649  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  34.59 
 
 
370 aa  209  7e-53  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.797828  normal  0.0143577 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0030  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase, putative  36.9 
 
 
385 aa  208  1e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.949331  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1304  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  38.24 
 
 
381 aa  207  2e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1109  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  30.26 
 
 
377 aa  207  3e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.298913  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4450  coproporphyrinogen III oxidase  34.12 
 
 
378 aa  205  1e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000131876  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3351  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  37.95 
 
 
384 aa  204  2e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1249  coproporphyrinogen III oxidase  32.74 
 
 
379 aa  204  2e-51  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3577  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  35.01 
 
 
381 aa  204  3e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3508  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  35.88 
 
 
381 aa  203  4e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.230764  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07700  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  34.7 
 
 
368 aa  203  4e-51  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.7688 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4216  coproporphyrinogen III oxidase  34.12 
 
 
379 aa  203  5e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4542  coproporphyrinogen III oxidase  34.12 
 
 
378 aa  203  5e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.3385  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4054  coproporphyrinogen III oxidase  34.12 
 
 
379 aa  202  7e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.749761  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4398  coproporphyrinogen III oxidase  33.82 
 
 
378 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.601746  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4064  coproporphyrinogen III oxidase  33.82 
 
 
379 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.659192  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2205  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  35.04 
 
 
484 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.434843  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3535  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  37.53 
 
 
383 aa  201  3e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000160096  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4339  coproporphyrinogen III oxidase  33.82 
 
 
378 aa  200  3e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.26628e-29 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2374  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  32.75 
 
 
448 aa  200  3e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0800  coproporphyrinogen III oxidase  33.63 
 
 
379 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000109269  hitchhiker  5.6543700000000005e-18 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1216  coproporphyrinogen III oxidase  31.27 
 
 
378 aa  200  3.9999999999999996e-50  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4436  coproporphyrinogen III oxidase  32.06 
 
 
379 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000959102  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1641  coproporphyrinogen III oxidase  32.54 
 
 
374 aa  200  3.9999999999999996e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.905653  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1675  coproporphyrinogen III oxidase  32.54 
 
 
374 aa  200  3.9999999999999996e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.370593  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1582  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  33.25 
 
 
381 aa  199  5e-50  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000332518  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2293  coproporphyrinogen III oxidase  30.85 
 
 
377 aa  199  6e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0582  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  33.59 
 
 
388 aa  199  7e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2008  coproporphyrinogen III oxidase  30.59 
 
 
377 aa  199  7e-50  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0858  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase, putative  34.55 
 
 
378 aa  198  1.0000000000000001e-49  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0560367  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2703  putative anaerobic coproporphyrinogen III oxidase oxidoreductase protein  35.17 
 
 
417 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0024  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  35.55 
 
 
398 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0304834 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3582  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  35.25 
 
 
385 aa  197  2.0000000000000003e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0475  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase, putative  36.11 
 
 
376 aa  197  3e-49  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2063  coproporphyrinogen III oxidase  38.1 
 
 
384 aa  197  3e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1151  coproporphyrinogen III oxidase  30.47 
 
 
374 aa  196  5.000000000000001e-49  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0471  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  34.86 
 
 
392 aa  196  5.000000000000001e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.039333  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0569  coproporphyrinogen III oxidase  36.32 
 
 
397 aa  196  5.000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4974  coproporphyrinogen III oxidase  33.77 
 
 
391 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2215  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  38.17 
 
 
412 aa  196  7e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.892548  normal  0.0148235 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0776  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  34.46 
 
 
378 aa  195  1e-48  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00749552  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0816  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  38.26 
 
 
396 aa  194  2e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.847489  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1898  coproporphyrinogen III oxidase  36.13 
 
 
426 aa  194  2e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.133769  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1631  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  35.29 
 
 
394 aa  193  3e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.526463  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1325  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  30.05 
 
 
380 aa  194  3e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3577  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  34.47 
 
 
390 aa  193  4e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0892028  normal  0.365381 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3639  coproporphyrinogen III oxidase  37.17 
 
 
414 aa  193  5e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0208  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  34.36 
 
 
381 aa  192  7e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000567402  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2479  coproporphyrinogen III oxidase  34.92 
 
 
413 aa  192  8e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.226119  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1649  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  32.39 
 
 
374 aa  192  8e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4323  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  34.5 
 
 
419 aa  192  9e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1980  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  30.55 
 
 
380 aa  192  1e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000136099  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0068  coproporphyrinogen III oxidase  37.65 
 
 
408 aa  192  1e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2199  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  39.72 
 
 
448 aa  191  1e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.186673  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0485  coproporphyrinogen III oxidase  38.13 
 
 
384 aa  191  2e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4155  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  39.74 
 
 
416 aa  191  2e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2537  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  35.4 
 
 
399 aa  191  2e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.878033 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1010  coproporphyrinogen III oxidase  35.31 
 
 
379 aa  190  4e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3398  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  35.66 
 
 
402 aa  189  7e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.217833 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1148  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  36.84 
 
 
403 aa  189  8e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.61254 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0403  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  33.93 
 
 
405 aa  189  9e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.68433  normal  0.919308 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0436  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  34.43 
 
 
398 aa  188  1e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.355394  normal  0.414795 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2155  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  33.83 
 
 
389 aa  188  1e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1337  coproporphyrinogen III oxidase  34.74 
 
 
392 aa  188  2e-46  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1553  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  35.31 
 
 
423 aa  188  2e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2885  coproporphyrinogen III oxidase  37.54 
 
 
385 aa  187  2e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5101  coproporphyrinogen III oxidase  33.85 
 
 
391 aa  186  4e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.608313  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2285  Coproporphyrinogen dehydrogenase  39.66 
 
 
403 aa  186  4e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.617284 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1341  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  33.78 
 
 
394 aa  187  4e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2661  coproporphyrinogen III oxidase  36.12 
 
 
385 aa  186  5e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.226338  normal  0.501465 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05040  coproporphyrinogen III oxidase  37.46 
 
 
384 aa  186  5e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0027  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  34.53 
 
 
387 aa  186  6e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.444781  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_761  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  35.15 
 
 
378 aa  186  6e-46  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000202557  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>