43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_2000 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_2000  nitrile hydratase  100 
 
 		 219 aa  450  1e-125  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.58695  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2525  Nitrile hydratase  76.26 
 
 		 219 aa  351  5.9999999999999994e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.994092  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2784  Nitrile hydratase  75.23 
 
 		 219 aa  344  5e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.34863  normal  0.327581 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7675  nitrile hydratase beta subunit  55.96 
 
 		 231 aa  238  4e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.389873  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3146  Nitrile hydratase  53 
 
 		 218 aa  234  9e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.149044  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2705  nitrile hydratase  52.51 
 
 		 219 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.745191  normal  0.533217 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0905  nitrile hydratase  50.46 
 
 		 219 aa  229  4e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.181053 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6961  nitrile hydratase  57.53 
 
 		 247 aa  228  5e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0306533 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2747  nitrile hydratase  51.38 
 
 		 218 aa  227  9e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4084  nitrile hydratase subunit beta (Nitrilase) (NHase)  48.85 
 
 		 219 aa  221  7e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.109394 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7182  Nitrile hydratase  49.54 
 
 		 223 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2749  nitrile hydratase  50.46 
 
 		 218 aa  204  6e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.5824 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1666  Nitrile hydratase  47.89 
 
 		 221 aa  192  3e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1971  nitrile hydratase  43.1 
 
 		 234 aa  173  9.999999999999999e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0907735 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0647  nitrile hydratase  35.65 
 
 		 230 aa  135  7.000000000000001e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.15879  normal  0.564644 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3459  nitrile hydratase beta subunit  31.67 
 
 		 245 aa  95.5  5e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4283  nitrile hydratase  32.59 
 
 		 217 aa  94.4  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.487082  normal  0.660679 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4083  nitrile hydratase  32.59 
 
 		 217 aa  94.4  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3234  nitrile hydratase  31.7 
 
 		 217 aa  93.6  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.586859 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5826  nitrile hydratase  29.13 
 
 		 244 aa  90.1  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.484903 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6543  nitrile hydratase  31.25 
 
 		 217 aa  89.4  4e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.817506  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6257  nitrile hydratase  31.25 
 
 		 217 aa  89.4  4e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.416291  normal  0.795432 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2729  nitrile hydratase  30.53 
 
 		 220 aa  87.4  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5090  nitrile hydratase beta subunit  28.92 
 
 		 247 aa  87  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0204432  normal  0.0806995 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6980  nitrile hydratase beta subunit  27.62 
 
 		 246 aa  85.5  6e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4710  nitrile hydratase beta subunit  28.03 
 
 		 247 aa  84.7  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.537552 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1010  nitrile hydratase  27.87 
 
 		 245 aa  79.3  0.00000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.695468  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2112  Nitrile hydratase  31.18 
 
 		 192 aa  77  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2313  putative ScnB-like protein  41.94 
 
 		 99 aa  59.7  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5636  hypothetical protein  28.51 
 
 		 279 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.628248 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5257  hypothetical protein  28.51 
 
 		 279 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5346  hypothetical protein  28.51 
 
 		 279 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2314  putative ScnA-like protein  36.36 
 
 		 97 aa  53.9  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1847  hypothetical protein  38.64 
 
 		 122 aa  51.2  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.41925 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3786  putative ScnA-like protein  31.87 
 
 		 95 aa  50.1  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.132911 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4915  hypothetical protein  29.2 
 
 		 279 aa  49.7  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.8251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1848  hypothetical protein  33.33 
 
 		 102 aa  46.6  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.411969 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3785  hypothetical protein  37.89 
 
 		 103 aa  45.4  0.0006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.135646 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1220  hypothetical protein  31.11 
 
 		 102 aa  43.9  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1505  hypothetical protein  26.69 
 
 		 279 aa  43.5  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.598489  normal  0.365022 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4231  hypothetical protein  30 
 
 		 284 aa  43.1  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0969344  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1221  hypothetical protein  34.09 
 
 		 141 aa  42.7  0.004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1078  hypothetical protein  34.74 
 
 		 97 aa  42.4  0.005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.248202  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>