35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_2112 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_2112  Nitrile hydratase  100 
 
 		 192 aa  400  1e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2729  nitrile hydratase  63.89 
 
 		 220 aa  249  1e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6543  nitrile hydratase  63.89 
 
 		 217 aa  241  7e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.817506  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3234  nitrile hydratase  63.89 
 
 		 217 aa  240  7.999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.586859 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4083  nitrile hydratase  63.89 
 
 		 217 aa  240  1e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4283  nitrile hydratase  63.89 
 
 		 217 aa  240  1e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.487082  normal  0.660679 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6257  nitrile hydratase  62.78 
 
 		 217 aa  238  2.9999999999999997e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.416291  normal  0.795432 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2525  Nitrile hydratase  31.09 
 
 		 219 aa  78.2  0.00000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.994092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2000  nitrile hydratase  31.18 
 
 		 219 aa  77  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.58695  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2749  nitrile hydratase  30.81 
 
 		 218 aa  75.5  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.5824 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2705  nitrile hydratase  29.9 
 
 		 219 aa  75.5  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.745191  normal  0.533217 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2784  Nitrile hydratase  31.75 
 
 		 219 aa  73.6  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.34863  normal  0.327581 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3146  Nitrile hydratase  31.91 
 
 		 218 aa  72  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.149044  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7182  Nitrile hydratase  31.95 
 
 		 223 aa  71.2  0.000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2747  nitrile hydratase  30.22 
 
 		 218 aa  67.8  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0905  nitrile hydratase  31.02 
 
 		 219 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.181053 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4084  nitrile hydratase subunit beta (Nitrilase) (NHase)  30.96 
 
 		 219 aa  64.7  0.0000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.109394 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7675  nitrile hydratase beta subunit  30.11 
 
 		 231 aa  62.8  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.389873  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6961  nitrile hydratase  31.35 
 
 		 247 aa  58.5  0.00000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0306533 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1010  nitrile hydratase  29.79 
 
 		 245 aa  57  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.695468  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1971  nitrile hydratase  32.2 
 
 		 234 aa  57  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0907735 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6980  nitrile hydratase beta subunit  27.47 
 
 		 246 aa  55.8  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0647  nitrile hydratase  29.21 
 
 		 230 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.15879  normal  0.564644 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4710  nitrile hydratase beta subunit  26.34 
 
 		 247 aa  51.6  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.537552 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3459  nitrile hydratase beta subunit  28.02 
 
 		 245 aa  51.6  0.000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1666  Nitrile hydratase  31.14 
 
 		 221 aa  50.8  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1505  hypothetical protein  27.57 
 
 		 279 aa  48.1  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.598489  normal  0.365022 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5090  nitrile hydratase beta subunit  24.87 
 
 		 247 aa  46.2  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0204432  normal  0.0806995 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2313  putative ScnB-like protein  33.67 
 
 		 99 aa  46.6  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3785  hypothetical protein  28.71 
 
 		 103 aa  43.5  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.135646 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5826  nitrile hydratase  24.86 
 
 		 244 aa  42.4  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.484903 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4915  hypothetical protein  26.34 
 
 		 279 aa  41.6  0.007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.8251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5257  hypothetical protein  25.41 
 
 		 279 aa  41.2  0.009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5346  hypothetical protein  25.41 
 
 		 279 aa  41.2  0.009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5636  hypothetical protein  25.41 
 
 		 279 aa  41.2  0.009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.628248 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>