42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_6961 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_6961  nitrile hydratase  100 
 
 		 247 aa  487  1e-137  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0306533 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7675  nitrile hydratase beta subunit  81.94 
 
 		 231 aa  382  1e-105  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.389873  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0905  nitrile hydratase  64.22 
 
 		 219 aa  276  3e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.181053 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2784  Nitrile hydratase  55.5 
 
 		 219 aa  251  5.000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.34863  normal  0.327581 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2000  nitrile hydratase  57.53 
 
 		 219 aa  246  3e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.58695  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2705  nitrile hydratase  55.45 
 
 		 219 aa  245  4e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.745191  normal  0.533217 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2525  Nitrile hydratase  55.76 
 
 		 219 aa  242  3e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.994092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4084  nitrile hydratase subunit beta (Nitrilase) (NHase)  54.38 
 
 		 219 aa  242  3.9999999999999997e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.109394 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3146  Nitrile hydratase  56.22 
 
 		 218 aa  241  1e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.149044  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7182  Nitrile hydratase  55.96 
 
 		 223 aa  241  1e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2747  nitrile hydratase  52.75 
 
 		 218 aa  232  3e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2749  nitrile hydratase  54.13 
 
 		 218 aa  226  2e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.5824 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1666  Nitrile hydratase  50.23 
 
 		 221 aa  197  2.0000000000000003e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1971  nitrile hydratase  39.66 
 
 		 234 aa  143  3e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0907735 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0647  nitrile hydratase  33.91 
 
 		 230 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.15879  normal  0.564644 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5826  nitrile hydratase  31.3 
 
 		 244 aa  91.3  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.484903 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1010  nitrile hydratase  30.33 
 
 		 245 aa  90.1  3e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.695468  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6980  nitrile hydratase beta subunit  28.34 
 
 		 246 aa  87.8  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4083  nitrile hydratase  31.7 
 
 		 217 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4283  nitrile hydratase  31.7 
 
 		 217 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.487082  normal  0.660679 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2729  nitrile hydratase  30.6 
 
 		 220 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3234  nitrile hydratase  30.13 
 
 		 217 aa  79  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.586859 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6543  nitrile hydratase  31.42 
 
 		 217 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.817506  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4710  nitrile hydratase beta subunit  26.14 
 
 		 247 aa  77  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.537552 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6257  nitrile hydratase  30.97 
 
 		 217 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.416291  normal  0.795432 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3459  nitrile hydratase beta subunit  28.93 
 
 		 245 aa  75.1  0.000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5090  nitrile hydratase beta subunit  24.1 
 
 		 247 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0204432  normal  0.0806995 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2112  Nitrile hydratase  31.35 
 
 		 192 aa  64.3  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2314  putative ScnA-like protein  43.18 
 
 		 97 aa  57.8  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5636  hypothetical protein  26.98 
 
 		 279 aa  55.5  0.0000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.628248 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5257  hypothetical protein  26.98 
 
 		 279 aa  55.5  0.0000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5346  hypothetical protein  26.98 
 
 		 279 aa  55.5  0.0000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1848  hypothetical protein  43.02 
 
 		 102 aa  53.9  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.411969 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4915  hypothetical protein  25.7 
 
 		 279 aa  52.4  0.000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.8251  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3786  putative ScnA-like protein  33.71 
 
 		 95 aa  50.4  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.132911 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1847  hypothetical protein  38.81 
 
 		 122 aa  48.5  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.41925 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1505  hypothetical protein  26.17 
 
 		 279 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.598489  normal  0.365022 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3461  putative transmembrane nitrile hydratase  37.93 
 
 		 115 aa  44.3  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4231  hypothetical protein  37.33 
 
 		 284 aa  43.9  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0969344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1078  hypothetical protein  34.74 
 
 		 97 aa  43.1  0.004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.248202  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2313  putative ScnB-like protein  36.84 
 
 		 99 aa  42.7  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4712  putative transmembrane nitrile hydratase  31.65 
 
 		 108 aa  42  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>