37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_1010 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_1010  nitrile hydratase  100 
 
 
245 aa  498  1e-140  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.695468  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5826  nitrile hydratase  82.45 
 
 
244 aa  410  1e-113  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.484903 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5090  nitrile hydratase beta subunit  52.85 
 
 
247 aa  254  8e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0204432  normal  0.0806995 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4710  nitrile hydratase beta subunit  54.03 
 
 
247 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.537552 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6980  nitrile hydratase beta subunit  54.69 
 
 
246 aa  249  3e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3459  nitrile hydratase beta subunit  52.87 
 
 
245 aa  235  5.0000000000000005e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2749  nitrile hydratase  32.11 
 
 
218 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.5824 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7675  nitrile hydratase beta subunit  31.93 
 
 
231 aa  93.6  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.389873  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0647  nitrile hydratase  33.9 
 
 
230 aa  89  6e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.15879  normal  0.564644 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3146  Nitrile hydratase  28.74 
 
 
218 aa  86.3  4e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.149044  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2525  Nitrile hydratase  30.58 
 
 
219 aa  86.3  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.994092  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2705  nitrile hydratase  28.69 
 
 
219 aa  85.1  9e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.745191  normal  0.533217 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2784  Nitrile hydratase  30.45 
 
 
219 aa  84.7  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.34863  normal  0.327581 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0905  nitrile hydratase  31.3 
 
 
219 aa  83.6  0.000000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.181053 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1971  nitrile hydratase  28.08 
 
 
234 aa  80.5  0.00000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0907735 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6961  nitrile hydratase  29.92 
 
 
247 aa  79.7  0.00000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0306533 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2000  nitrile hydratase  27.87 
 
 
219 aa  79.3  0.00000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.58695  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2747  nitrile hydratase  26.86 
 
 
218 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4283  nitrile hydratase  28.74 
 
 
217 aa  75.5  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.487082  normal  0.660679 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4083  nitrile hydratase  28.74 
 
 
217 aa  75.5  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2729  nitrile hydratase  25.81 
 
 
220 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4084  nitrile hydratase subunit beta (Nitrilase) (NHase)  29.8 
 
 
219 aa  74.7  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.109394 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6543  nitrile hydratase  28.06 
 
 
217 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.817506  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3234  nitrile hydratase  27.94 
 
 
217 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.586859 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6257  nitrile hydratase  27.67 
 
 
217 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.416291  normal  0.795432 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7182  Nitrile hydratase  26.64 
 
 
223 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1666  Nitrile hydratase  27.31 
 
 
221 aa  67  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2112  Nitrile hydratase  29.79 
 
 
192 aa  57  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5346  hypothetical protein  24.61 
 
 
279 aa  48.9  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5257  hypothetical protein  24.61 
 
 
279 aa  48.9  0.00007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5636  hypothetical protein  24.61 
 
 
279 aa  48.9  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.628248 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2314  putative ScnA-like protein  34.44 
 
 
97 aa  48.1  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4915  hypothetical protein  24.08 
 
 
279 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.8251  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3786  putative ScnA-like protein  28.42 
 
 
95 aa  45.8  0.0006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.132911 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1848  hypothetical protein  32.56 
 
 
102 aa  45.8  0.0006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.411969 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1220  hypothetical protein  30.61 
 
 
102 aa  45.8  0.0006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1505  hypothetical protein  23.08 
 
 
279 aa  45.4  0.0008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.598489  normal  0.365022 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>