40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_4084 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_4084  nitrile hydratase subunit beta (Nitrilase) (NHase)  100 
 
 		 219 aa  443  1e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.109394 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2705  nitrile hydratase  69.59 
 
 		 219 aa  306  2.0000000000000002e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.745191  normal  0.533217 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3146  Nitrile hydratase  68.04 
 
 		 218 aa  298  5e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.149044  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2747  nitrile hydratase  66.67 
 
 		 218 aa  296  1e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2749  nitrile hydratase  66.36 
 
 		 218 aa  288  5.0000000000000004e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.5824 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0905  nitrile hydratase  54.34 
 
 		 219 aa  244  6.999999999999999e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.181053 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2784  Nitrile hydratase  52.51 
 
 		 219 aa  243  9.999999999999999e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.34863  normal  0.327581 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7675  nitrile hydratase beta subunit  54.79 
 
 		 231 aa  242  3e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.389873  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2525  Nitrile hydratase  50.92 
 
 		 219 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.994092  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6961  nitrile hydratase  54.38 
 
 		 247 aa  230  1e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0306533 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7182  Nitrile hydratase  51.61 
 
 		 223 aa  224  9e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2000  nitrile hydratase  48.85 
 
 		 219 aa  221  7e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.58695  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1666  Nitrile hydratase  55.4 
 
 		 221 aa  220  9.999999999999999e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1971  nitrile hydratase  44.78 
 
 		 234 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0907735 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0647  nitrile hydratase  34.35 
 
 		 230 aa  123  2e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.15879  normal  0.564644 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4083  nitrile hydratase  32.76 
 
 		 217 aa  86.7  3e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3234  nitrile hydratase  33.19 
 
 		 217 aa  86.3  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.586859 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4283  nitrile hydratase  32.76 
 
 		 217 aa  86.7  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.487082  normal  0.660679 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2729  nitrile hydratase  32.16 
 
 		 220 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6257  nitrile hydratase  33.19 
 
 		 217 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.416291  normal  0.795432 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6980  nitrile hydratase beta subunit  28.45 
 
 		 246 aa  82  0.000000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6543  nitrile hydratase  33.19 
 
 		 217 aa  82  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.817506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5826  nitrile hydratase  30.33 
 
 		 244 aa  77.4  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.484903 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5090  nitrile hydratase beta subunit  24.39 
 
 		 247 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0204432  normal  0.0806995 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4710  nitrile hydratase beta subunit  28.33 
 
 		 247 aa  74.7  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.537552 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1010  nitrile hydratase  29.8 
 
 		 245 aa  74.7  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.695468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3459  nitrile hydratase beta subunit  30 
 
 		 245 aa  72  0.000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1505  hypothetical protein  28.9 
 
 		 279 aa  69.3  0.00000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.598489  normal  0.365022 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2112  Nitrile hydratase  30.96 
 
 		 192 aa  64.7  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4915  hypothetical protein  29.36 
 
 		 279 aa  62.8  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.8251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5346  hypothetical protein  27.15 
 
 		 279 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5257  hypothetical protein  27.15 
 
 		 279 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5636  hypothetical protein  27.15 
 
 		 279 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.628248 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2314  putative ScnA-like protein  40 
 
 		 97 aa  56.6  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4231  hypothetical protein  28.63 
 
 		 284 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0969344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3786  putative ScnA-like protein  34.07 
 
 		 95 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.132911 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1848  hypothetical protein  37.27 
 
 		 102 aa  48.5  0.00008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.411969 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2313  putative ScnB-like protein  37.63 
 
 		 99 aa  47.8  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1220  hypothetical protein  34.09 
 
 		 102 aa  46.2  0.0004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1847  hypothetical protein  34.83 
 
 		 122 aa  46.2  0.0004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.41925 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>