38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_3234 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_3234  nitrile hydratase  100 
 
 		 217 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.586859 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4083  nitrile hydratase  97.7 
 
 		 217 aa  428  1e-119  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4283  nitrile hydratase  97.7 
 
 		 217 aa  428  1e-119  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.487082  normal  0.660679 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6257  nitrile hydratase  94.34 
 
 		 217 aa  408  1e-113  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.416291  normal  0.795432 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6543  nitrile hydratase  94.81 
 
 		 217 aa  408  1e-113  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.817506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2729  nitrile hydratase  81.99 
 
 		 220 aa  360  8e-99  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2112  Nitrile hydratase  63.89 
 
 		 192 aa  240  1e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2705  nitrile hydratase  33.48 
 
 		 219 aa  98.6  7e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.745191  normal  0.533217 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3146  Nitrile hydratase  33.33 
 
 		 218 aa  98.6  7e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.149044  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2525  Nitrile hydratase  32.89 
 
 		 219 aa  95.1  7e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.994092  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2749  nitrile hydratase  32.89 
 
 		 218 aa  93.2  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.5824 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0905  nitrile hydratase  32.76 
 
 		 219 aa  93.6  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.181053 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2000  nitrile hydratase  31.7 
 
 		 219 aa  93.6  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.58695  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7675  nitrile hydratase beta subunit  32.76 
 
 		 231 aa  89  5e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.389873  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2747  nitrile hydratase  32.61 
 
 		 218 aa  88.2  9e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7182  Nitrile hydratase  32.61 
 
 		 223 aa  88.2  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4084  nitrile hydratase subunit beta (Nitrilase) (NHase)  33.19 
 
 		 219 aa  86.3  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.109394 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2784  Nitrile hydratase  32.75 
 
 		 219 aa  79.7  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.34863  normal  0.327581 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0647  nitrile hydratase  28.94 
 
 		 230 aa  78.2  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.15879  normal  0.564644 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1971  nitrile hydratase  32.37 
 
 		 234 aa  77.8  0.0000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0907735 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6961  nitrile hydratase  30.13 
 
 		 247 aa  73.2  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0306533 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1010  nitrile hydratase  27.94 
 
 		 245 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.695468  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5826  nitrile hydratase  27.35 
 
 		 244 aa  65.1  0.0000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.484903 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1666  Nitrile hydratase  29.46 
 
 		 221 aa  64.3  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4710  nitrile hydratase beta subunit  23.98 
 
 		 247 aa  62.8  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.537552 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5090  nitrile hydratase beta subunit  24.29 
 
 		 247 aa  61.6  0.000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0204432  normal  0.0806995 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6980  nitrile hydratase beta subunit  24.8 
 
 		 246 aa  61.6  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3459  nitrile hydratase beta subunit  24.69 
 
 		 245 aa  58.9  0.00000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1505  hypothetical protein  26.92 
 
 		 279 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.598489  normal  0.365022 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3786  putative ScnA-like protein  33.33 
 
 		 95 aa  52  0.000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.132911 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1848  hypothetical protein  32.29 
 
 		 102 aa  51.6  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.411969 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2314  putative ScnA-like protein  39.78 
 
 		 97 aa  50.4  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2313  putative ScnB-like protein  36.73 
 
 		 99 aa  50.1  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4915  hypothetical protein  25.96 
 
 		 279 aa  49.3  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.8251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5257  hypothetical protein  26.05 
 
 		 279 aa  45.4  0.0006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5346  hypothetical protein  26.05 
 
 		 279 aa  45.4  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5636  hypothetical protein  26.05 
 
 		 279 aa  45.4  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.628248 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3785  hypothetical protein  31.68 
 
 		 103 aa  43.1  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.135646 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>