16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_3785 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_3785  hypothetical protein  100 
 
 		 103 aa  208  3e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.135646 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3775  hypothetical protein  58.95 
 
 		 109 aa  117  6e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.317339  normal  0.076368 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1847  hypothetical protein  37.25 
 
 		 122 aa  65.5  0.0000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.41925 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2313  putative ScnB-like protein  40.82 
 
 		 99 aa  57.8  0.00000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1539  hypothetical protein  39.78 
 
 		 110 aa  56.6  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.562944  normal  0.196246 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1079  hypothetical protein  37.35 
 
 		 108 aa  55.8  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.160511  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2784  Nitrile hydratase  33.33 
 
 		 219 aa  50.1  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.34863  normal  0.327581 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2000  nitrile hydratase  37.89 
 
 		 219 aa  45.4  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.58695  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2525  Nitrile hydratase  33.33 
 
 		 219 aa  45.1  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.994092  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2112  Nitrile hydratase  28.71 
 
 		 192 aa  43.5  0.0009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4083  nitrile hydratase  31.68 
 
 		 217 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4283  nitrile hydratase  31.68 
 
 		 217 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.487082  normal  0.660679 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3234  nitrile hydratase  31.68 
 
 		 217 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.586859 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7182  Nitrile hydratase  33.33 
 
 		 223 aa  42  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2729  nitrile hydratase  28.87 
 
 		 220 aa  40.8  0.006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6961  nitrile hydratase  32.69 
 
 		 247 aa  40.4  0.008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0306533 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>