42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_2784 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_2784  Nitrile hydratase  100 
 
 		 219 aa  451  1.0000000000000001e-126  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.34863  normal  0.327581 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2525  Nitrile hydratase  86.18 
 
 		 219 aa  391  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.994092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2000  nitrile hydratase  75.23 
 
 		 219 aa  344  5e-94  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.58695  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7675  nitrile hydratase beta subunit  55.71 
 
 		 231 aa  252  3e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.389873  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4084  nitrile hydratase subunit beta (Nitrilase) (NHase)  52.51 
 
 		 219 aa  243  9.999999999999999e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.109394 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6961  nitrile hydratase  55.5 
 
 		 247 aa  241  5e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0306533 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2747  nitrile hydratase  50.23 
 
 		 218 aa  238  4e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2705  nitrile hydratase  50.23 
 
 		 219 aa  237  1e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.745191  normal  0.533217 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3146  Nitrile hydratase  50.23 
 
 		 218 aa  232  4.0000000000000004e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.149044  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7182  Nitrile hydratase  50.46 
 
 		 223 aa  226  2e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2749  nitrile hydratase  50.45 
 
 		 218 aa  221  4.9999999999999996e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.5824 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0905  nitrile hydratase  48.4 
 
 		 219 aa  217  1e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.181053 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1666  Nitrile hydratase  48.83 
 
 		 221 aa  200  9.999999999999999e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1971  nitrile hydratase  42.42 
 
 		 234 aa  171  7.999999999999999e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0907735 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0647  nitrile hydratase  37.23 
 
 		 230 aa  135  4e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.15879  normal  0.564644 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3459  nitrile hydratase beta subunit  32.92 
 
 		 245 aa  97.1  2e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5090  nitrile hydratase beta subunit  30.92 
 
 		 247 aa  88.6  7e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0204432  normal  0.0806995 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6980  nitrile hydratase beta subunit  29.41 
 
 		 246 aa  85.9  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1010  nitrile hydratase  30.45 
 
 		 245 aa  84.7  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.695468  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4283  nitrile hydratase  32.3 
 
 		 217 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.487082  normal  0.660679 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5826  nitrile hydratase  30.33 
 
 		 244 aa  84  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.484903 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4083  nitrile hydratase  32.3 
 
 		 217 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4710  nitrile hydratase beta subunit  28.03 
 
 		 247 aa  81.3  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.537552 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2729  nitrile hydratase  30.64 
 
 		 220 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3234  nitrile hydratase  32.75 
 
 		 217 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.586859 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6543  nitrile hydratase  32.31 
 
 		 217 aa  79  0.00000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.817506  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6257  nitrile hydratase  31.88 
 
 		 217 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.416291  normal  0.795432 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2112  Nitrile hydratase  31.75 
 
 		 192 aa  73.6  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5257  hypothetical protein  28.27 
 
 		 279 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5636  hypothetical protein  28.27 
 
 		 279 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.628248 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5346  hypothetical protein  28.27 
 
 		 279 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2314  putative ScnA-like protein  40 
 
 		 97 aa  60.5  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4915  hypothetical protein  25.22 
 
 		 279 aa  59.3  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.8251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2313  putative ScnB-like protein  36.26 
 
 		 99 aa  54.7  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1505  hypothetical protein  26.39 
 
 		 279 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.598489  normal  0.365022 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1848  hypothetical protein  36.78 
 
 		 102 aa  52.4  0.000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.411969 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3785  hypothetical protein  33.33 
 
 		 103 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.135646 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1847  hypothetical protein  33.72 
 
 		 122 aa  48.9  0.00005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.41925 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3786  putative ScnA-like protein  32.61 
 
 		 95 aa  48.5  0.00007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.132911 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1079  hypothetical protein  31.58 
 
 		 108 aa  42.7  0.004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.160511  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1220  hypothetical protein  31.52 
 
 		 102 aa  42  0.007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1221  hypothetical protein  30.85 
 
 		 141 aa  41.6  0.01  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>