39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_4915 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_4915  hypothetical protein  100 
 
 
279 aa  566  1e-160  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.8251  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1505  hypothetical protein  88.85 
 
 
279 aa  509  1e-143  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.598489  normal  0.365022 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5636  hypothetical protein  85.25 
 
 
279 aa  490  1e-137  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.628248 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5257  hypothetical protein  85.25 
 
 
279 aa  490  1e-137  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5346  hypothetical protein  85.25 
 
 
279 aa  490  1e-137  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4231  hypothetical protein  39.15 
 
 
284 aa  158  8e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0969344  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1221  hypothetical protein  40.29 
 
 
141 aa  99.8  4e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1220  hypothetical protein  45.05 
 
 
102 aa  82  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4084  nitrile hydratase subunit beta (Nitrilase) (NHase)  29.36 
 
 
219 aa  62.8  0.000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.109394 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2525  Nitrile hydratase  28.07 
 
 
219 aa  59.3  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.994092  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2784  Nitrile hydratase  25.22 
 
 
219 aa  59.3  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.34863  normal  0.327581 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2747  nitrile hydratase  25.89 
 
 
218 aa  56.6  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0647  nitrile hydratase  28.17 
 
 
230 aa  56.2  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.15879  normal  0.564644 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2314  putative ScnA-like protein  35.56 
 
 
97 aa  53.9  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7675  nitrile hydratase beta subunit  25 
 
 
231 aa  53.9  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.389873  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2705  nitrile hydratase  26.34 
 
 
219 aa  53.9  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.745191  normal  0.533217 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0905  nitrile hydratase  27.43 
 
 
219 aa  53.1  0.000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.181053 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6543  nitrile hydratase  26.72 
 
 
217 aa  52.8  0.000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.817506  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1666  Nitrile hydratase  25.11 
 
 
221 aa  51.6  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4283  nitrile hydratase  25.86 
 
 
217 aa  51.2  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.487082  normal  0.660679 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2313  putative ScnB-like protein  33.33 
 
 
99 aa  51.2  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4083  nitrile hydratase  25.86 
 
 
217 aa  51.2  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5090  nitrile hydratase beta subunit  25.62 
 
 
247 aa  50.4  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0204432  normal  0.0806995 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5826  nitrile hydratase  26.92 
 
 
244 aa  50.8  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.484903 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6257  nitrile hydratase  26.29 
 
 
217 aa  50.8  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.416291  normal  0.795432 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3786  putative ScnA-like protein  33.33 
 
 
95 aa  50.1  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.132911 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3146  Nitrile hydratase  24.02 
 
 
218 aa  50.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.149044  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2000  nitrile hydratase  29.2 
 
 
219 aa  49.7  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.58695  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3234  nitrile hydratase  25.96 
 
 
217 aa  49.3  0.00008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.586859 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2749  nitrile hydratase  25.21 
 
 
218 aa  48.5  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.5824 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1078  hypothetical protein  41.56 
 
 
97 aa  47.8  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.248202  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7182  Nitrile hydratase  24.89 
 
 
223 aa  48.1  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2729  nitrile hydratase  25 
 
 
220 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1010  nitrile hydratase  24.08 
 
 
245 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.695468  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3459  nitrile hydratase beta subunit  26.36 
 
 
245 aa  45.8  0.0008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6980  nitrile hydratase beta subunit  25.38 
 
 
246 aa  44.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4710  nitrile hydratase beta subunit  25.28 
 
 
247 aa  44.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.537552 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6961  nitrile hydratase  24.55 
 
 
247 aa  43.5  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0306533 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1847  hypothetical protein  26.8 
 
 
122 aa  42.4  0.008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.41925 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>