35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6980 on replicon NC_012858
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012858  Rleg_6980  nitrile hydratase beta subunit  100 
 
 		 246 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4710  nitrile hydratase beta subunit  82.11 
 
 		 247 aa  432  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.537552 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3459  nitrile hydratase beta subunit  71.84 
 
 		 245 aa  371  1e-102  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5090  nitrile hydratase beta subunit  53.5 
 
 		 247 aa  257  1e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0204432  normal  0.0806995 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1010  nitrile hydratase  54.69 
 
 		 245 aa  249  3e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.695468  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5826  nitrile hydratase  53.47 
 
 		 244 aa  248  6e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.484903 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2705  nitrile hydratase  30.17 
 
 		 219 aa  102  7e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.745191  normal  0.533217 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0647  nitrile hydratase  30.04 
 
 		 230 aa  100  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.15879  normal  0.564644 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3146  Nitrile hydratase  29.41 
 
 		 218 aa  99.4  5e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.149044  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2749  nitrile hydratase  29.83 
 
 		 218 aa  97.8  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.5824 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7675  nitrile hydratase beta subunit  29.36 
 
 		 231 aa  94  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.389873  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2525  Nitrile hydratase  29.83 
 
 		 219 aa  92  8e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.994092  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2747  nitrile hydratase  28.57 
 
 		 218 aa  91.7  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7182  Nitrile hydratase  30.04 
 
 		 223 aa  90.5  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1666  Nitrile hydratase  30.21 
 
 		 221 aa  86.7  3e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2784  Nitrile hydratase  29.41 
 
 		 219 aa  85.9  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.34863  normal  0.327581 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2000  nitrile hydratase  27.62 
 
 		 219 aa  85.5  7e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.58695  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1971  nitrile hydratase  28.63 
 
 		 234 aa  85.5  7e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0907735 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0905  nitrile hydratase  31.05 
 
 		 219 aa  85.1  8e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.181053 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4084  nitrile hydratase subunit beta (Nitrilase) (NHase)  28.45 
 
 		 219 aa  82  0.000000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.109394 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6961  nitrile hydratase  28.09 
 
 		 247 aa  77.8  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0306533 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6543  nitrile hydratase  25.31 
 
 		 217 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.817506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4283  nitrile hydratase  25.91 
 
 		 217 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.487082  normal  0.660679 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2729  nitrile hydratase  24.9 
 
 		 220 aa  63.2  0.000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4083  nitrile hydratase  25.91 
 
 		 217 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6257  nitrile hydratase  24.9 
 
 		 217 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.416291  normal  0.795432 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3234  nitrile hydratase  24.8 
 
 		 217 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.586859 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2112  Nitrile hydratase  27.47 
 
 		 192 aa  55.8  0.0000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5257  hypothetical protein  25.22 
 
 		 279 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5346  hypothetical protein  25.22 
 
 		 279 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5636  hypothetical protein  25.22 
 
 		 279 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.628248 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4231  hypothetical protein  22.86 
 
 		 284 aa  46.2  0.0005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0969344  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1505  hypothetical protein  25.38 
 
 		 279 aa  46.2  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.598489  normal  0.365022 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4915  hypothetical protein  25.38 
 
 		 279 aa  44.7  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.8251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2314  putative ScnA-like protein  34.07 
 
 		 97 aa  44.3  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>