44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_2747 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_2747  nitrile hydratase  100 
 
 		 218 aa  444  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2705  nitrile hydratase  85.25 
 
 		 219 aa  385  1e-106  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.745191  normal  0.533217 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3146  Nitrile hydratase  75.23 
 
 		 218 aa  345  3e-94  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.149044  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2749  nitrile hydratase  68.35 
 
 		 218 aa  304  6e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.5824 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4084  nitrile hydratase subunit beta (Nitrilase) (NHase)  66.67 
 
 		 219 aa  296  1e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.109394 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7675  nitrile hydratase beta subunit  54.79 
 
 		 231 aa  241  9e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.389873  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2784  Nitrile hydratase  50.23 
 
 		 219 aa  238  4e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.34863  normal  0.327581 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2525  Nitrile hydratase  52.27 
 
 		 219 aa  237  1e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.994092  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7182  Nitrile hydratase  53.85 
 
 		 223 aa  232  4.0000000000000004e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2000  nitrile hydratase  51.38 
 
 		 219 aa  227  9e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.58695  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0905  nitrile hydratase  52.51 
 
 		 219 aa  226  3e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.181053 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1666  Nitrile hydratase  53.05 
 
 		 221 aa  216  2e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6961  nitrile hydratase  52.75 
 
 		 247 aa  216  2e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0306533 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1971  nitrile hydratase  41.81 
 
 		 234 aa  150  1e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0907735 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0647  nitrile hydratase  36.21 
 
 		 230 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.15879  normal  0.564644 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6980  nitrile hydratase beta subunit  28.57 
 
 		 246 aa  91.7  8e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3234  nitrile hydratase  32.61 
 
 		 217 aa  88.2  9e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.586859 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6257  nitrile hydratase  31.74 
 
 		 217 aa  87.4  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.416291  normal  0.795432 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3459  nitrile hydratase beta subunit  30.13 
 
 		 245 aa  87  2e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6543  nitrile hydratase  31.74 
 
 		 217 aa  86.7  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.817506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4083  nitrile hydratase  31.74 
 
 		 217 aa  86.3  4e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4283  nitrile hydratase  31.74 
 
 		 217 aa  86.3  4e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.487082  normal  0.660679 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5090  nitrile hydratase beta subunit  25.4 
 
 		 247 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0204432  normal  0.0806995 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2729  nitrile hydratase  29.91 
 
 		 220 aa  82.4  0.000000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4710  nitrile hydratase beta subunit  26.47 
 
 		 247 aa  82.4  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.537552 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5826  nitrile hydratase  28.1 
 
 		 244 aa  82  0.000000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.484903 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1010  nitrile hydratase  26.86 
 
 		 245 aa  77.8  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.695468  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2112  Nitrile hydratase  30.22 
 
 		 192 aa  67.8  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2314  putative ScnA-like protein  43.33 
 
 		 97 aa  60.5  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4915  hypothetical protein  25.89 
 
 		 279 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.8251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5257  hypothetical protein  24.3 
 
 		 279 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5636  hypothetical protein  24.3 
 
 		 279 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.628248 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1505  hypothetical protein  25.7 
 
 		 279 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.598489  normal  0.365022 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5346  hypothetical protein  24.3 
 
 		 279 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1847  hypothetical protein  39.33 
 
 		 122 aa  54.7  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.41925 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2313  putative ScnB-like protein  38.71 
 
 		 99 aa  49.7  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1220  hypothetical protein  35.16 
 
 		 102 aa  49.3  0.00004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3786  putative ScnA-like protein  39.44 
 
 		 95 aa  49.3  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.132911 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1848  hypothetical protein  35.71 
 
 		 102 aa  46.6  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.411969 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4712  putative transmembrane nitrile hydratase  37.66 
 
 		 108 aa  46.2  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4231  hypothetical protein  33.33 
 
 		 284 aa  44.3  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0969344  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3461  putative transmembrane nitrile hydratase  36.84 
 
 		 115 aa  43.5  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7183  hypothetical protein  35.71 
 
 		 122 aa  43.5  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6982  putative transmembrane nitrile hydratase  33.77 
 
 		 108 aa  43.5  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>