41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_5636 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_5257  hypothetical protein  100 
 
 
279 aa  570  1e-161  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5636  hypothetical protein  100 
 
 
279 aa  570  1e-161  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.628248 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5346  hypothetical protein  100 
 
 
279 aa  570  1e-161  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4915  hypothetical protein  85.25 
 
 
279 aa  490  1e-137  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.8251  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1505  hypothetical protein  84.95 
 
 
279 aa  488  1e-137  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.598489  normal  0.365022 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4231  hypothetical protein  41.09 
 
 
284 aa  170  3e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0969344  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1221  hypothetical protein  41.73 
 
 
141 aa  103  3e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1220  hypothetical protein  51.09 
 
 
102 aa  90.1  4e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2784  Nitrile hydratase  28.27 
 
 
219 aa  67.4  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.34863  normal  0.327581 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0647  nitrile hydratase  30.09 
 
 
230 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.15879  normal  0.564644 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2314  putative ScnA-like protein  40 
 
 
97 aa  62  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4084  nitrile hydratase subunit beta (Nitrilase) (NHase)  27.15 
 
 
219 aa  60.5  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.109394 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2525  Nitrile hydratase  27.23 
 
 
219 aa  60.8  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.994092  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2747  nitrile hydratase  24.3 
 
 
218 aa  56.6  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7182  Nitrile hydratase  26.69 
 
 
223 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3459  nitrile hydratase beta subunit  28.94 
 
 
245 aa  54.7  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5090  nitrile hydratase beta subunit  24.22 
 
 
247 aa  54.7  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0204432  normal  0.0806995 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2749  nitrile hydratase  27.05 
 
 
218 aa  54.7  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.5824 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2000  nitrile hydratase  28.51 
 
 
219 aa  54.7  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.58695  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1666  Nitrile hydratase  25 
 
 
221 aa  52.8  0.000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2705  nitrile hydratase  24.77 
 
 
219 aa  52.8  0.000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.745191  normal  0.533217 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5826  nitrile hydratase  25.6 
 
 
244 aa  52.4  0.000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.484903 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3786  putative ScnA-like protein  32.26 
 
 
95 aa  52.4  0.000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.132911 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6543  nitrile hydratase  26.85 
 
 
217 aa  51.2  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.817506  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7675  nitrile hydratase beta subunit  22.03 
 
 
231 aa  50.4  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.389873  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1078  hypothetical protein  39.18 
 
 
97 aa  50.8  0.00003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.248202  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0905  nitrile hydratase  26.61 
 
 
219 aa  49.7  0.00006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.181053 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2313  putative ScnB-like protein  34.07 
 
 
99 aa  49.7  0.00006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2729  nitrile hydratase  26.67 
 
 
220 aa  48.9  0.00009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4083  nitrile hydratase  26.74 
 
 
217 aa  48.9  0.00009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4283  nitrile hydratase  26.74 
 
 
217 aa  48.9  0.00009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.487082  normal  0.660679 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1010  nitrile hydratase  24.61 
 
 
245 aa  48.9  0.00009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.695468  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3146  Nitrile hydratase  24.07 
 
 
218 aa  48.9  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.149044  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6980  nitrile hydratase beta subunit  25.22 
 
 
246 aa  48.1  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6257  nitrile hydratase  26.07 
 
 
217 aa  47.8  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.416291  normal  0.795432 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6961  nitrile hydratase  26.17 
 
 
247 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0306533 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1848  hypothetical protein  38.2 
 
 
102 aa  46.2  0.0006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.411969 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3234  nitrile hydratase  26.05 
 
 
217 aa  45.4  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.586859 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1847  hypothetical protein  27.84 
 
 
122 aa  45.1  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.41925 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1539  hypothetical protein  34.02 
 
 
110 aa  43.1  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.562944  normal  0.196246 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1079  hypothetical protein  31.33 
 
 
108 aa  42.7  0.007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.160511  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>