37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_6543 on replicon NC_008392
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008392  Bamb_6543  nitrile hydratase  100 
 
 		 217 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.817506  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6257  nitrile hydratase  98.16 
 
 		 217 aa  433  1e-121  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.416291  normal  0.795432 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4083  nitrile hydratase  96.23 
 
 		 217 aa  413  1e-114  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4283  nitrile hydratase  96.23 
 
 		 217 aa  413  1e-114  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.487082  normal  0.660679 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3234  nitrile hydratase  94.81 
 
 		 217 aa  408  1e-113  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.586859 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2729  nitrile hydratase  81.94 
 
 		 220 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2112  Nitrile hydratase  63.89 
 
 		 192 aa  241  9e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3146  Nitrile hydratase  33.33 
 
 		 218 aa  97.8  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.149044  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0905  nitrile hydratase  34.05 
 
 		 219 aa  94  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.181053 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2705  nitrile hydratase  33.78 
 
 		 219 aa  92.4  5e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.745191  normal  0.533217 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2525  Nitrile hydratase  31.56 
 
 		 219 aa  89.7  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.994092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2000  nitrile hydratase  31.25 
 
 		 219 aa  89.4  4e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.58695  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2749  nitrile hydratase  31.28 
 
 		 218 aa  87.4  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.5824 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7675  nitrile hydratase beta subunit  33.19 
 
 		 231 aa  87.8  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.389873  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2747  nitrile hydratase  31.74 
 
 		 218 aa  86.7  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7182  Nitrile hydratase  32.16 
 
 		 223 aa  85.1  7e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4084  nitrile hydratase subunit beta (Nitrilase) (NHase)  33.19 
 
 		 219 aa  82  0.000000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.109394 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2784  Nitrile hydratase  32.31 
 
 		 219 aa  79  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.34863  normal  0.327581 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0647  nitrile hydratase  28.99 
 
 		 230 aa  76.3  0.0000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.15879  normal  0.564644 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1971  nitrile hydratase  31.8 
 
 		 234 aa  75.5  0.0000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0907735 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6961  nitrile hydratase  30.97 
 
 		 247 aa  73.9  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0306533 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1010  nitrile hydratase  28.06 
 
 		 245 aa  73.2  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.695468  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5826  nitrile hydratase  26.48 
 
 		 244 aa  66.2  0.0000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.484903 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5090  nitrile hydratase beta subunit  24.9 
 
 		 247 aa  65.1  0.0000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0204432  normal  0.0806995 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6980  nitrile hydratase beta subunit  25.31 
 
 		 246 aa  63.5  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4710  nitrile hydratase beta subunit  24.9 
 
 		 247 aa  62.4  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.537552 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1505  hypothetical protein  28.45 
 
 		 279 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.598489  normal  0.365022 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3459  nitrile hydratase beta subunit  25.81 
 
 		 245 aa  57.8  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1666  Nitrile hydratase  30.94 
 
 		 221 aa  58.2  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1848  hypothetical protein  34.78 
 
 		 102 aa  54.3  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.411969 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2314  putative ScnA-like protein  41.94 
 
 		 97 aa  53.9  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4915  hypothetical protein  26.72 
 
 		 279 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.8251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5636  hypothetical protein  26.85 
 
 		 279 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.628248 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5346  hypothetical protein  26.85 
 
 		 279 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5257  hypothetical protein  26.85 
 
 		 279 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3786  putative ScnA-like protein  32.97 
 
 		 95 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.132911 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2313  putative ScnB-like protein  35 
 
 		 99 aa  46.6  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>