31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_4710 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011368  Rleg2_4710  nitrile hydratase beta subunit  100 
 
 
247 aa  510  1e-144  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.537552 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6980  nitrile hydratase beta subunit  82.11 
 
 
246 aa  432  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3459  nitrile hydratase beta subunit  74.49 
 
 
245 aa  377  1e-103  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5090  nitrile hydratase beta subunit  53.09 
 
 
247 aa  261  4.999999999999999e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0204432  normal  0.0806995 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1010  nitrile hydratase  54.03 
 
 
245 aa  253  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.695468  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5826  nitrile hydratase  52.42 
 
 
244 aa  243  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.484903 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0647  nitrile hydratase  31.38 
 
 
230 aa  102  7e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.15879  normal  0.564644 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3146  Nitrile hydratase  28.57 
 
 
218 aa  94  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.149044  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2705  nitrile hydratase  28.45 
 
 
219 aa  92.4  6e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.745191  normal  0.533217 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2525  Nitrile hydratase  29.92 
 
 
219 aa  91.3  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.994092  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2749  nitrile hydratase  29.71 
 
 
218 aa  89  6e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.5824 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2000  nitrile hydratase  28.03 
 
 
219 aa  84.7  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.58695  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7675  nitrile hydratase beta subunit  27.39 
 
 
231 aa  84.3  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.389873  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2747  nitrile hydratase  26.47 
 
 
218 aa  82.4  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1971  nitrile hydratase  29.44 
 
 
234 aa  81.6  0.00000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0907735 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2784  Nitrile hydratase  28.03 
 
 
219 aa  81.3  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.34863  normal  0.327581 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0905  nitrile hydratase  30.22 
 
 
219 aa  80.9  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.181053 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1666  Nitrile hydratase  28.94 
 
 
221 aa  78.6  0.00000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7182  Nitrile hydratase  27.98 
 
 
223 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4084  nitrile hydratase subunit beta (Nitrilase) (NHase)  28.33 
 
 
219 aa  74.7  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.109394 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6961  nitrile hydratase  26.18 
 
 
247 aa  69.7  0.00000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0306533 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3234  nitrile hydratase  23.98 
 
 
217 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.586859 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2729  nitrile hydratase  24.02 
 
 
220 aa  62.8  0.000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6543  nitrile hydratase  24.9 
 
 
217 aa  62.4  0.000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.817506  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6257  nitrile hydratase  24.9 
 
 
217 aa  62  0.000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.416291  normal  0.795432 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4283  nitrile hydratase  25.1 
 
 
217 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.487082  normal  0.660679 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4083  nitrile hydratase  25.1 
 
 
217 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2112  Nitrile hydratase  26.34 
 
 
192 aa  51.6  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1505  hypothetical protein  25.7 
 
 
279 aa  45.1  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.598489  normal  0.365022 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4915  hypothetical protein  25.28 
 
 
279 aa  44.7  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.8251  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4231  hypothetical protein  23.7 
 
 
284 aa  44.7  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0969344  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>