34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_1971 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_1971  nitrile hydratase  100 
 
 		 234 aa  476  1e-133  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0907735 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2000  nitrile hydratase  43.1 
 
 		 219 aa  181  9.000000000000001e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.58695  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2784  Nitrile hydratase  42.42 
 
 		 219 aa  177  9e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.34863  normal  0.327581 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2525  Nitrile hydratase  42.17 
 
 		 219 aa  177  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.994092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4084  nitrile hydratase subunit beta (Nitrilase) (NHase)  45.22 
 
 		 219 aa  170  1e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.109394 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3146  Nitrile hydratase  43.72 
 
 		 218 aa  167  9e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.149044  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2705  nitrile hydratase  42.06 
 
 		 219 aa  167  1e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.745191  normal  0.533217 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2749  nitrile hydratase  41.45 
 
 		 218 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.5824 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1666  Nitrile hydratase  42.92 
 
 		 221 aa  159  3e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0905  nitrile hydratase  39.83 
 
 		 219 aa  158  6e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.181053 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2747  nitrile hydratase  43.1 
 
 		 218 aa  158  6e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7675  nitrile hydratase beta subunit  41.13 
 
 		 231 aa  156  2e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.389873  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7182  Nitrile hydratase  39.32 
 
 		 223 aa  155  6e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6961  nitrile hydratase  39.66 
 
 		 247 aa  145  6e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0306533 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0647  nitrile hydratase  36.91 
 
 		 230 aa  122  6e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.15879  normal  0.564644 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6980  nitrile hydratase beta subunit  28.63 
 
 		 246 aa  93.2  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2729  nitrile hydratase  31.12 
 
 		 220 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1010  nitrile hydratase  28.08 
 
 		 245 aa  89.4  4e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.695468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4710  nitrile hydratase beta subunit  29.44 
 
 		 247 aa  89.4  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.537552 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4283  nitrile hydratase  32.92 
 
 		 217 aa  87.8  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.487082  normal  0.660679 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3234  nitrile hydratase  32.37 
 
 		 217 aa  88.2  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.586859 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4083  nitrile hydratase  32.92 
 
 		 217 aa  87.8  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6257  nitrile hydratase  31.8 
 
 		 217 aa  85.9  5e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.416291  normal  0.795432 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6543  nitrile hydratase  31.8 
 
 		 217 aa  85.5  6e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.817506  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3459  nitrile hydratase beta subunit  29.15 
 
 		 245 aa  80.1  0.00000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5826  nitrile hydratase  27.13 
 
 		 244 aa  74.7  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.484903 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5090  nitrile hydratase beta subunit  25.39 
 
 		 247 aa  69.3  0.00000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0204432  normal  0.0806995 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2112  Nitrile hydratase  32.2 
 
 		 192 aa  66.6  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2313  putative ScnB-like protein  38.04 
 
 		 99 aa  53.5  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1078  hypothetical protein  35.16 
 
 		 97 aa  48.1  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.248202  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2314  putative ScnA-like protein  34.78 
 
 		 97 aa  47  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1847  hypothetical protein  33.73 
 
 		 122 aa  47  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.41925 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3786  putative ScnA-like protein  31.08 
 
 		 95 aa  44.7  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.132911 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3785  hypothetical protein  31.53 
 
 		 103 aa  42.4  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.135646 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>