41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_7675 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_7675  nitrile hydratase beta subunit  100 
 
 		 231 aa  463  1e-129  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.389873  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6961  nitrile hydratase  83.26 
 
 		 247 aa  364  1e-100  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0306533 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0905  nitrile hydratase  64.84 
 
 		 219 aa  280  2e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.181053 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2705  nitrile hydratase  57.27 
 
 		 219 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.745191  normal  0.533217 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2784  Nitrile hydratase  55.71 
 
 		 219 aa  252  3e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.34863  normal  0.327581 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3146  Nitrile hydratase  57.53 
 
 		 218 aa  247  1e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.149044  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7182  Nitrile hydratase  56.42 
 
 		 223 aa  246  2e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2525  Nitrile hydratase  55.3 
 
 		 219 aa  244  8e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.994092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4084  nitrile hydratase subunit beta (Nitrilase) (NHase)  54.79 
 
 		 219 aa  242  3.9999999999999997e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.109394 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2747  nitrile hydratase  54.79 
 
 		 218 aa  241  1e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2000  nitrile hydratase  55.96 
 
 		 219 aa  238  4e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.58695  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2749  nitrile hydratase  53.42 
 
 		 218 aa  226  2e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.5824 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1666  Nitrile hydratase  52.58 
 
 		 221 aa  204  1e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1971  nitrile hydratase  41.13 
 
 		 234 aa  150  2e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0907735 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0647  nitrile hydratase  35.06 
 
 		 230 aa  129  3e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.15879  normal  0.564644 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6980  nitrile hydratase beta subunit  29.36 
 
 		 246 aa  94  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1010  nitrile hydratase  31.93 
 
 		 245 aa  93.6  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.695468  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5826  nitrile hydratase  30.36 
 
 		 244 aa  93.2  3e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.484903 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4083  nitrile hydratase  33.33 
 
 		 217 aa  90.1  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4283  nitrile hydratase  33.33 
 
 		 217 aa  90.1  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.487082  normal  0.660679 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3234  nitrile hydratase  32.76 
 
 		 217 aa  89  6e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.586859 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6543  nitrile hydratase  33.19 
 
 		 217 aa  87.8  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.817506  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6257  nitrile hydratase  32.76 
 
 		 217 aa  85.9  4e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.416291  normal  0.795432 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4710  nitrile hydratase beta subunit  27.39 
 
 		 247 aa  84.3  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.537552 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2729  nitrile hydratase  30.9 
 
 		 220 aa  82.8  0.000000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5090  nitrile hydratase beta subunit  24.41 
 
 		 247 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0204432  normal  0.0806995 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3459  nitrile hydratase beta subunit  28.15 
 
 		 245 aa  75.9  0.0000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2112  Nitrile hydratase  30.11 
 
 		 192 aa  62.8  0.000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2314  putative ScnA-like protein  41.11 
 
 		 97 aa  57.8  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1848  hypothetical protein  41.3 
 
 		 102 aa  56.6  0.0000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.411969 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4915  hypothetical protein  25 
 
 		 279 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.8251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1505  hypothetical protein  24.55 
 
 		 279 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.598489  normal  0.365022 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5346  hypothetical protein  22.03 
 
 		 279 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5257  hypothetical protein  22.03 
 
 		 279 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5636  hypothetical protein  22.03 
 
 		 279 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.628248 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4231  hypothetical protein  39.73 
 
 		 284 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0969344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3786  putative ScnA-like protein  31.87 
 
 		 95 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.132911 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1220  hypothetical protein  32.98 
 
 		 102 aa  44.7  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2313  putative ScnB-like protein  35.79 
 
 		 99 aa  44.3  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1078  hypothetical protein  38.96 
 
 		 97 aa  42.7  0.005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.248202  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1847  hypothetical protein  34.33 
 
 		 122 aa  42.4  0.006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.41925 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>