42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_0647 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_0647  nitrile hydratase  100 
 
 
230 aa  475  1e-133  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.15879  normal  0.564644 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2525  Nitrile hydratase  38.1 
 
 
219 aa  139  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.994092  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2784  Nitrile hydratase  37.23 
 
 
219 aa  135  4e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.34863  normal  0.327581 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2000  nitrile hydratase  35.65 
 
 
219 aa  135  8e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.58695  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2705  nitrile hydratase  36.24 
 
 
219 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.745191  normal  0.533217 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7675  nitrile hydratase beta subunit  35.06 
 
 
231 aa  129  3e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.389873  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2747  nitrile hydratase  36.21 
 
 
218 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4084  nitrile hydratase subunit beta (Nitrilase) (NHase)  34.35 
 
 
219 aa  123  3e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.109394 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0905  nitrile hydratase  34.78 
 
 
219 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.181053 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7182  Nitrile hydratase  34.78 
 
 
223 aa  120  3e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3146  Nitrile hydratase  35.22 
 
 
218 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.149044  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2749  nitrile hydratase  33.62 
 
 
218 aa  118  6e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.5824 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1971  nitrile hydratase  36.91 
 
 
234 aa  114  8.999999999999998e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0907735 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6961  nitrile hydratase  33.91 
 
 
247 aa  106  3e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0306533 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1666  Nitrile hydratase  35.11 
 
 
221 aa  106  3e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4710  nitrile hydratase beta subunit  31.38 
 
 
247 aa  102  6e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.537552 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6980  nitrile hydratase beta subunit  30.04 
 
 
246 aa  100  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3459  nitrile hydratase beta subunit  31.93 
 
 
245 aa  98.2  1e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1010  nitrile hydratase  33.9 
 
 
245 aa  89  5e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.695468  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4283  nitrile hydratase  29.36 
 
 
217 aa  81.6  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.487082  normal  0.660679 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4083  nitrile hydratase  29.36 
 
 
217 aa  81.6  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5826  nitrile hydratase  30.51 
 
 
244 aa  80.5  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.484903 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3234  nitrile hydratase  28.94 
 
 
217 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.586859 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6257  nitrile hydratase  28.99 
 
 
217 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.416291  normal  0.795432 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6543  nitrile hydratase  28.99 
 
 
217 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.817506  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5090  nitrile hydratase beta subunit  25.3 
 
 
247 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0204432  normal  0.0806995 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2729  nitrile hydratase  27.47 
 
 
220 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5636  hypothetical protein  30.09 
 
 
279 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.628248 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5346  hypothetical protein  30.09 
 
 
279 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5257  hypothetical protein  30.09 
 
 
279 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4915  hypothetical protein  28.17 
 
 
279 aa  56.2  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.8251  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2313  putative ScnB-like protein  37.25 
 
 
99 aa  54.7  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1848  hypothetical protein  38.82 
 
 
102 aa  53.9  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.411969 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2112  Nitrile hydratase  29.21 
 
 
192 aa  54.3  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1221  hypothetical protein  31.68 
 
 
141 aa  52  0.000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4231  hypothetical protein  27.27 
 
 
284 aa  52  0.000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0969344  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1505  hypothetical protein  27.04 
 
 
279 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.598489  normal  0.365022 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2314  putative ScnA-like protein  35.63 
 
 
97 aa  49.7  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1078  hypothetical protein  35.06 
 
 
97 aa  45.1  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.248202  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3786  putative ScnA-like protein  31.03 
 
 
95 aa  44.7  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.132911 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1220  hypothetical protein  34.07 
 
 
102 aa  43.1  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1847  hypothetical protein  30.21 
 
 
122 aa  42.7  0.005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.41925 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>