35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2313 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2313  putative ScnB-like protein  100 
 
 		 99 aa  196  1.0000000000000001e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1847  hypothetical protein  45.83 
 
 		 122 aa  73.2  0.000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.41925 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1539  hypothetical protein  38.95 
 
 		 110 aa  67.8  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.562944  normal  0.196246 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1079  hypothetical protein  47.44 
 
 		 108 aa  65.1  0.0000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.160511  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2000  nitrile hydratase  41.94 
 
 		 219 aa  59.7  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.58695  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2525  Nitrile hydratase  37.36 
 
 		 219 aa  58.2  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.994092  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3785  hypothetical protein  40.82 
 
 		 103 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.135646 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1666  Nitrile hydratase  40.48 
 
 		 221 aa  57  0.00000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0647  nitrile hydratase  37.25 
 
 		 230 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.15879  normal  0.564644 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2784  Nitrile hydratase  36.26 
 
 		 219 aa  54.7  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.34863  normal  0.327581 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3461  putative transmembrane nitrile hydratase  41.46 
 
 		 115 aa  52  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1505  hypothetical protein  34.78 
 
 		 279 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.598489  normal  0.365022 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3146  Nitrile hydratase  38.71 
 
 		 218 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.149044  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1221  hypothetical protein  31.52 
 
 		 141 aa  52  0.000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4915  hypothetical protein  33.33 
 
 		 279 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.8251  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2749  nitrile hydratase  40.86 
 
 		 218 aa  50.8  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.5824 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2705  nitrile hydratase  39.78 
 
 		 219 aa  50.4  0.000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.745191  normal  0.533217 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2747  nitrile hydratase  38.71 
 
 		 218 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4083  nitrile hydratase  36.73 
 
 		 217 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4283  nitrile hydratase  36.73 
 
 		 217 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.487082  normal  0.660679 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3234  nitrile hydratase  36.73 
 
 		 217 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.586859 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5346  hypothetical protein  34.07 
 
 		 279 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5257  hypothetical protein  34.07 
 
 		 279 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2729  nitrile hydratase  35.71 
 
 		 220 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5636  hypothetical protein  34.07 
 
 		 279 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.628248 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7182  Nitrile hydratase  36.17 
 
 		 223 aa  47.8  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4084  nitrile hydratase subunit beta (Nitrilase) (NHase)  37.63 
 
 		 219 aa  47.8  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.109394 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6543  nitrile hydratase  35 
 
 		 217 aa  46.6  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.817506  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2112  Nitrile hydratase  33.67 
 
 		 192 aa  46.6  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6257  nitrile hydratase  34.02 
 
 		 217 aa  46.2  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.416291  normal  0.795432 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3775  hypothetical protein  31.25 
 
 		 109 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.317339  normal  0.076368 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7675  nitrile hydratase beta subunit  35.79 
 
 		 231 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.389873  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6961  nitrile hydratase  36.84 
 
 		 247 aa  43.5  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0306533 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0905  nitrile hydratase  36.56 
 
 		 219 aa  43.1  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.181053 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1971  nitrile hydratase  38.04 
 
 		 234 aa  43.5  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0907735 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>