43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_0905 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_0905  nitrile hydratase  100 
 
 
219 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.181053 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7675  nitrile hydratase beta subunit  64.84 
 
 
231 aa  280  2e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.389873  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6961  nitrile hydratase  64.22 
 
 
247 aa  262  2e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0306533 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4084  nitrile hydratase subunit beta (Nitrilase) (NHase)  54.34 
 
 
219 aa  244  6.999999999999999e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.109394 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7182  Nitrile hydratase  56.62 
 
 
223 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2705  nitrile hydratase  53.67 
 
 
219 aa  231  9e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.745191  normal  0.533217 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3146  Nitrile hydratase  53.42 
 
 
218 aa  230  2e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.149044  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2000  nitrile hydratase  50.46 
 
 
219 aa  229  4e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.58695  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2747  nitrile hydratase  52.51 
 
 
218 aa  226  3e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2784  Nitrile hydratase  48.4 
 
 
219 aa  217  1e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.34863  normal  0.327581 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2525  Nitrile hydratase  48.85 
 
 
219 aa  215  4e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.994092  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2749  nitrile hydratase  51.14 
 
 
218 aa  208  5e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.5824 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1666  Nitrile hydratase  51.17 
 
 
221 aa  196  2.0000000000000003e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1971  nitrile hydratase  39.83 
 
 
234 aa  148  5e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0907735 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0647  nitrile hydratase  34.78 
 
 
230 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.15879  normal  0.564644 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2729  nitrile hydratase  32.61 
 
 
220 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4083  nitrile hydratase  34.05 
 
 
217 aa  94.4  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6257  nitrile hydratase  34.05 
 
 
217 aa  94.4  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.416291  normal  0.795432 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4283  nitrile hydratase  34.05 
 
 
217 aa  94.4  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.487082  normal  0.660679 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6543  nitrile hydratase  34.05 
 
 
217 aa  94  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.817506  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3234  nitrile hydratase  32.76 
 
 
217 aa  93.6  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.586859 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6980  nitrile hydratase beta subunit  31.05 
 
 
246 aa  85.1  7e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1010  nitrile hydratase  31.3 
 
 
245 aa  83.6  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.695468  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4710  nitrile hydratase beta subunit  30.22 
 
 
247 aa  80.9  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.537552 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3459  nitrile hydratase beta subunit  29.83 
 
 
245 aa  77.4  0.0000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5826  nitrile hydratase  27.35 
 
 
244 aa  77  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.484903 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5090  nitrile hydratase beta subunit  28.97 
 
 
247 aa  75.9  0.0000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0204432  normal  0.0806995 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2112  Nitrile hydratase  31.02 
 
 
192 aa  67  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2314  putative ScnA-like protein  43.33 
 
 
97 aa  58.9  0.00000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1847  hypothetical protein  39.53 
 
 
122 aa  57.4  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.41925 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1505  hypothetical protein  28.32 
 
 
279 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.598489  normal  0.365022 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4915  hypothetical protein  27.43 
 
 
279 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.8251  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1848  hypothetical protein  35.56 
 
 
102 aa  49.7  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.411969 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5346  hypothetical protein  26.61 
 
 
279 aa  49.7  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5257  hypothetical protein  26.61 
 
 
279 aa  49.7  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5636  hypothetical protein  26.61 
 
 
279 aa  49.7  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.628248 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3786  putative ScnA-like protein  31.11 
 
 
95 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.132911 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6982  putative transmembrane nitrile hydratase  31.25 
 
 
108 aa  46.6  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1079  hypothetical protein  36.9 
 
 
108 aa  44.3  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.160511  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3461  putative transmembrane nitrile hydratase  35.23 
 
 
115 aa  43.5  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1220  hypothetical protein  31.87 
 
 
102 aa  43.1  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2313  putative ScnB-like protein  36.56 
 
 
99 aa  43.1  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1078  hypothetical protein  36.36 
 
 
97 aa  43.5  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.248202  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>