33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_1848 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_1848  hypothetical protein  100 
 
 		 102 aa  203  6e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.411969 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2314  putative ScnA-like protein  51.16 
 
 		 97 aa  82.8  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3786  putative ScnA-like protein  43.02 
 
 		 95 aa  76.6  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.132911 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1078  hypothetical protein  53.95 
 
 		 97 aa  72.8  0.000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.248202  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7675  nitrile hydratase beta subunit  41.3 
 
 		 231 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.389873  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2729  nitrile hydratase  33.66 
 
 		 220 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4083  nitrile hydratase  33.67 
 
 		 217 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4283  nitrile hydratase  33.67 
 
 		 217 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.487082  normal  0.660679 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1220  hypothetical protein  38.04 
 
 		 102 aa  54.3  0.0000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6543  nitrile hydratase  34.78 
 
 		 217 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.817506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0647  nitrile hydratase  38.82 
 
 		 230 aa  53.9  0.0000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.15879  normal  0.564644 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6961  nitrile hydratase  43.02 
 
 		 247 aa  53.5  0.0000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0306533 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2784  Nitrile hydratase  36.78 
 
 		 219 aa  52.4  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.34863  normal  0.327581 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6257  nitrile hydratase  32.61 
 
 		 217 aa  51.6  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.416291  normal  0.795432 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2749  nitrile hydratase  37.36 
 
 		 218 aa  51.2  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.5824 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3234  nitrile hydratase  32.29 
 
 		 217 aa  51.6  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.586859 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2525  Nitrile hydratase  35.16 
 
 		 219 aa  50.1  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.994092  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0905  nitrile hydratase  35.56 
 
 		 219 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.181053 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4084  nitrile hydratase subunit beta (Nitrilase) (NHase)  37.27 
 
 		 219 aa  48.5  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.109394 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5826  nitrile hydratase  30.77 
 
 		 244 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.484903 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4231  hypothetical protein  37.5 
 
 		 284 aa  47  0.00009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0969344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2000  nitrile hydratase  33.33 
 
 		 219 aa  46.6  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.58695  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5090  nitrile hydratase beta subunit  31.87 
 
 		 247 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0204432  normal  0.0806995 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2747  nitrile hydratase  35.71 
 
 		 218 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2705  nitrile hydratase  36.36 
 
 		 219 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.745191  normal  0.533217 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1010  nitrile hydratase  32.56 
 
 		 245 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.695468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5636  hypothetical protein  38.2 
 
 		 279 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.628248 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5346  hypothetical protein  38.2 
 
 		 279 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3146  Nitrile hydratase  34.02 
 
 		 218 aa  45.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.149044  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5257  hypothetical protein  38.2 
 
 		 279 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7182  Nitrile hydratase  36.05 
 
 		 223 aa  44.3  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1505  hypothetical protein  30.84 
 
 		 279 aa  42.4  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.598489  normal  0.365022 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1666  Nitrile hydratase  33.33 
 
 		 221 aa  40.8  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>