37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_5090 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_5090  nitrile hydratase beta subunit  100 
 
 		 247 aa  510  1e-143  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0204432  normal  0.0806995 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3459  nitrile hydratase beta subunit  53.91 
 
 		 245 aa  262  4e-69  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4710  nitrile hydratase beta subunit  53.09 
 
 		 247 aa  261  4.999999999999999e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.537552 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6980  nitrile hydratase beta subunit  53.5 
 
 		 246 aa  257  1e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5826  nitrile hydratase  52.42 
 
 		 244 aa  256  2e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.484903 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1010  nitrile hydratase  52.85 
 
 		 245 aa  254  8e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.695468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2749  nitrile hydratase  27.38 
 
 		 218 aa  94  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.5824 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2525  Nitrile hydratase  30.89 
 
 		 219 aa  92  8e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.994092  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2784  Nitrile hydratase  30.92 
 
 		 219 aa  88.6  8e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.34863  normal  0.327581 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2000  nitrile hydratase  28.92 
 
 		 219 aa  87  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.58695  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1666  Nitrile hydratase  28.33 
 
 		 221 aa  86.3  4e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2705  nitrile hydratase  26.69 
 
 		 219 aa  84.7  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.745191  normal  0.533217 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2747  nitrile hydratase  25.4 
 
 		 218 aa  83.6  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3146  Nitrile hydratase  24.5 
 
 		 218 aa  82.8  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.149044  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7675  nitrile hydratase beta subunit  24.41 
 
 		 231 aa  80.9  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.389873  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7182  Nitrile hydratase  25.4 
 
 		 223 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0647  nitrile hydratase  25.3 
 
 		 230 aa  76.3  0.0000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.15879  normal  0.564644 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0905  nitrile hydratase  28.97 
 
 		 219 aa  75.9  0.0000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.181053 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4084  nitrile hydratase subunit beta (Nitrilase) (NHase)  24.39 
 
 		 219 aa  74.3  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.109394 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4283  nitrile hydratase  25.3 
 
 		 217 aa  67  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.487082  normal  0.660679 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4083  nitrile hydratase  25.3 
 
 		 217 aa  67  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6961  nitrile hydratase  23.9 
 
 		 247 aa  66.6  0.0000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0306533 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6257  nitrile hydratase  24.51 
 
 		 217 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.416291  normal  0.795432 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6543  nitrile hydratase  24.9 
 
 		 217 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.817506  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3234  nitrile hydratase  24.29 
 
 		 217 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.586859 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1971  nitrile hydratase  25.39 
 
 		 234 aa  60.8  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0907735 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2729  nitrile hydratase  23.32 
 
 		 220 aa  58.9  0.00000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5257  hypothetical protein  24.22 
 
 		 279 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5636  hypothetical protein  24.22 
 
 		 279 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.628248 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5346  hypothetical protein  24.22 
 
 		 279 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1505  hypothetical protein  26.11 
 
 		 279 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.598489  normal  0.365022 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4915  hypothetical protein  25.62 
 
 		 279 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.8251  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4231  hypothetical protein  29.86 
 
 		 284 aa  50.1  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0969344  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2314  putative ScnA-like protein  34.09 
 
 		 97 aa  48.1  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1848  hypothetical protein  31.87 
 
 		 102 aa  46.6  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.411969 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2112  Nitrile hydratase  24.87 
 
 		 192 aa  46.2  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3786  putative ScnA-like protein  29.03 
 
 		 95 aa  42  0.01  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.132911 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>