37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_2729 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_2729  nitrile hydratase  100 
 
 		 220 aa  449  1e-125  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6257  nitrile hydratase  81.94 
 
 		 217 aa  369  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.416291  normal  0.795432 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6543  nitrile hydratase  81.94 
 
 		 217 aa  370  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.817506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4083  nitrile hydratase  82.46 
 
 		 217 aa  362  2e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4283  nitrile hydratase  82.46 
 
 		 217 aa  362  2e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.487082  normal  0.660679 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3234  nitrile hydratase  81.99 
 
 		 217 aa  360  8e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.586859 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2112  Nitrile hydratase  63.89 
 
 		 192 aa  249  2e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0905  nitrile hydratase  32.61 
 
 		 219 aa  97.1  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.181053 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2705  nitrile hydratase  33.63 
 
 		 219 aa  95.1  7e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.745191  normal  0.533217 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2749  nitrile hydratase  32.44 
 
 		 218 aa  89  5e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.5824 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2525  Nitrile hydratase  31.58 
 
 		 219 aa  88.6  7e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.994092  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3146  Nitrile hydratase  31.47 
 
 		 218 aa  88.2  9e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.149044  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2000  nitrile hydratase  30.53 
 
 		 219 aa  87.4  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.58695  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7182  Nitrile hydratase  30.53 
 
 		 223 aa  86.7  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4084  nitrile hydratase subunit beta (Nitrilase) (NHase)  32.16 
 
 		 219 aa  83.6  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.109394 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7675  nitrile hydratase beta subunit  30.9 
 
 		 231 aa  82.8  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.389873  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2747  nitrile hydratase  29.91 
 
 		 218 aa  82.4  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2784  Nitrile hydratase  30.64 
 
 		 219 aa  80.1  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.34863  normal  0.327581 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1971  nitrile hydratase  31.12 
 
 		 234 aa  80.9  0.00000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0907735 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6961  nitrile hydratase  29.82 
 
 		 247 aa  76.6  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0306533 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1010  nitrile hydratase  25.81 
 
 		 245 aa  74.7  0.0000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.695468  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0647  nitrile hydratase  27.47 
 
 		 230 aa  74.3  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.15879  normal  0.564644 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6980  nitrile hydratase beta subunit  24.9 
 
 		 246 aa  63.2  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4710  nitrile hydratase beta subunit  24.02 
 
 		 247 aa  62.8  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.537552 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1505  hypothetical protein  27.59 
 
 		 279 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.598489  normal  0.365022 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5090  nitrile hydratase beta subunit  23.32 
 
 		 247 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0204432  normal  0.0806995 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3459  nitrile hydratase beta subunit  23.87 
 
 		 245 aa  56.6  0.0000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5826  nitrile hydratase  23.69 
 
 		 244 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.484903 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2314  putative ScnA-like protein  39.78 
 
 		 97 aa  55.5  0.0000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1848  hypothetical protein  33.66 
 
 		 102 aa  55.1  0.0000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.411969 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1666  Nitrile hydratase  29.55 
 
 		 221 aa  55.1  0.0000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3786  putative ScnA-like protein  34.83 
 
 		 95 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.132911 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5257  hypothetical protein  26.67 
 
 		 279 aa  48.9  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2313  putative ScnB-like protein  35.71 
 
 		 99 aa  48.9  0.00006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5636  hypothetical protein  26.67 
 
 		 279 aa  48.9  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.628248 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5346  hypothetical protein  26.67 
 
 		 279 aa  48.9  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4915  hypothetical protein  25 
 
 		 279 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.8251  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>