43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_3146 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_3146  Nitrile hydratase  100 
 
 		 218 aa  440  1e-123  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.149044  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2705  nitrile hydratase  78.7 
 
 		 219 aa  361  6e-99  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.745191  normal  0.533217 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2747  nitrile hydratase  75.23 
 
 		 218 aa  345  3e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2749  nitrile hydratase  68.35 
 
 		 218 aa  302  2.0000000000000002e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.5824 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4084  nitrile hydratase subunit beta (Nitrilase) (NHase)  68.04 
 
 		 219 aa  298  5e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.109394 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7675  nitrile hydratase beta subunit  57.53 
 
 		 231 aa  247  1e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.389873  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2525  Nitrile hydratase  52.49 
 
 		 219 aa  235  4e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.994092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2000  nitrile hydratase  53 
 
 		 219 aa  234  9e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.58695  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2784  Nitrile hydratase  50.23 
 
 		 219 aa  232  4.0000000000000004e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.34863  normal  0.327581 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7182  Nitrile hydratase  54.84 
 
 		 223 aa  231  8.000000000000001e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0905  nitrile hydratase  53.42 
 
 		 219 aa  230  2e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.181053 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1666  Nitrile hydratase  58.22 
 
 		 221 aa  224  5.0000000000000005e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6961  nitrile hydratase  56.22 
 
 		 247 aa  225  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0306533 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1971  nitrile hydratase  43.72 
 
 		 234 aa  159  4e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0907735 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0647  nitrile hydratase  35.22 
 
 		 230 aa  119  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.15879  normal  0.564644 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4083  nitrile hydratase  33.48 
 
 		 217 aa  99.8  3e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4283  nitrile hydratase  33.48 
 
 		 217 aa  99.8  3e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.487082  normal  0.660679 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6980  nitrile hydratase beta subunit  29.41 
 
 		 246 aa  99.4  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3234  nitrile hydratase  33.33 
 
 		 217 aa  98.6  7e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.586859 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6257  nitrile hydratase  32.46 
 
 		 217 aa  97.4  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.416291  normal  0.795432 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6543  nitrile hydratase  33.33 
 
 		 217 aa  97.8  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.817506  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4710  nitrile hydratase beta subunit  28.57 
 
 		 247 aa  94  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.537552 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2729  nitrile hydratase  31.47 
 
 		 220 aa  88.2  9e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1010  nitrile hydratase  28.74 
 
 		 245 aa  86.3  3e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.695468  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5826  nitrile hydratase  29.75 
 
 		 244 aa  85.1  8e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.484903 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5090  nitrile hydratase beta subunit  24.5 
 
 		 247 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0204432  normal  0.0806995 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3459  nitrile hydratase beta subunit  27.62 
 
 		 245 aa  79  0.00000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2112  Nitrile hydratase  31.91 
 
 		 192 aa  72  0.000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2314  putative ScnA-like protein  40.62 
 
 		 97 aa  61.2  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1505  hypothetical protein  26.01 
 
 		 279 aa  52  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.598489  normal  0.365022 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2313  putative ScnB-like protein  38.71 
 
 		 99 aa  52  0.000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1847  hypothetical protein  38.2 
 
 		 122 aa  50.8  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.41925 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4915  hypothetical protein  24.02 
 
 		 279 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.8251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5257  hypothetical protein  24.07 
 
 		 279 aa  48.9  0.00007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5346  hypothetical protein  24.07 
 
 		 279 aa  48.9  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5636  hypothetical protein  24.07 
 
 		 279 aa  48.9  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.628248 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4231  hypothetical protein  34.41 
 
 		 284 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0969344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3786  putative ScnA-like protein  31.11 
 
 		 95 aa  45.8  0.0005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.132911 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4712  putative transmembrane nitrile hydratase  36.36 
 
 		 108 aa  45.4  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1848  hypothetical protein  34.02 
 
 		 102 aa  45.4  0.0006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.411969 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3461  putative transmembrane nitrile hydratase  36.36 
 
 		 115 aa  43.5  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0906  hypothetical protein  34.07 
 
 		 107 aa  42.7  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.163885 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7183  hypothetical protein  37.33 
 
 		 122 aa  42.4  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>