45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_2705 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_2705  nitrile hydratase  100 
 
 		 219 aa  443  1e-123  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.745191  normal  0.533217 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2747  nitrile hydratase  85.25 
 
 		 218 aa  385  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3146  Nitrile hydratase  78.7 
 
 		 218 aa  361  6e-99  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.149044  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2749  nitrile hydratase  72.81 
 
 		 218 aa  322  2e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.5824 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4084  nitrile hydratase subunit beta (Nitrilase) (NHase)  69.59 
 
 		 219 aa  306  2.0000000000000002e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.109394 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7675  nitrile hydratase beta subunit  57.27 
 
 		 231 aa  254  9e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.389873  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2784  Nitrile hydratase  50.23 
 
 		 219 aa  237  1e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.34863  normal  0.327581 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2525  Nitrile hydratase  51.82 
 
 		 219 aa  236  2e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.994092  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7182  Nitrile hydratase  54.13 
 
 		 223 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2000  nitrile hydratase  52.51 
 
 		 219 aa  234  1.0000000000000001e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.58695  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0905  nitrile hydratase  53.67 
 
 		 219 aa  231  9e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.181053 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6961  nitrile hydratase  55.45 
 
 		 247 aa  229  2e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0306533 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1666  Nitrile hydratase  55.87 
 
 		 221 aa  223  2e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1971  nitrile hydratase  42.06 
 
 		 234 aa  158  6e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0907735 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0647  nitrile hydratase  36.24 
 
 		 230 aa  130  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.15879  normal  0.564644 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6980  nitrile hydratase beta subunit  30.17 
 
 		 246 aa  102  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3234  nitrile hydratase  33.48 
 
 		 217 aa  98.6  7e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.586859 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2729  nitrile hydratase  33.63 
 
 		 220 aa  95.1  7e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6257  nitrile hydratase  33.78 
 
 		 217 aa  93.2  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.416291  normal  0.795432 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4710  nitrile hydratase beta subunit  28.45 
 
 		 247 aa  92.4  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.537552 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4283  nitrile hydratase  32.59 
 
 		 217 aa  92.4  5e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.487082  normal  0.660679 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6543  nitrile hydratase  33.78 
 
 		 217 aa  92.4  5e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.817506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4083  nitrile hydratase  32.59 
 
 		 217 aa  92.4  5e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3459  nitrile hydratase beta subunit  30.67 
 
 		 245 aa  92  6e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5826  nitrile hydratase  28.81 
 
 		 244 aa  89.7  3e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.484903 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1010  nitrile hydratase  28.69 
 
 		 245 aa  85.1  7e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.695468  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5090  nitrile hydratase beta subunit  26.69 
 
 		 247 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0204432  normal  0.0806995 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2112  Nitrile hydratase  29.9 
 
 		 192 aa  75.5  0.0000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1505  hypothetical protein  25.7 
 
 		 279 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.598489  normal  0.365022 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2314  putative ScnA-like protein  41.3 
 
 		 97 aa  55.8  0.0000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1847  hypothetical protein  40.45 
 
 		 122 aa  55.1  0.0000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.41925 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4915  hypothetical protein  26.34 
 
 		 279 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.8251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5636  hypothetical protein  24.77 
 
 		 279 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.628248 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5346  hypothetical protein  24.77 
 
 		 279 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5257  hypothetical protein  24.77 
 
 		 279 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4712  putative transmembrane nitrile hydratase  38.82 
 
 		 108 aa  51.2  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3786  putative ScnA-like protein  34.83 
 
 		 95 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.132911 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2313  putative ScnB-like protein  39.78 
 
 		 99 aa  50.4  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3461  putative transmembrane nitrile hydratase  38.71 
 
 		 115 aa  49.7  0.00004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1220  hypothetical protein  34.07 
 
 		 102 aa  48.1  0.00009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1848  hypothetical protein  36.36 
 
 		 102 aa  46.6  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.411969 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6982  putative transmembrane nitrile hydratase  35.29 
 
 		 108 aa  46.2  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7183  hypothetical protein  35.71 
 
 		 122 aa  45.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4231  hypothetical protein  24 
 
 		 284 aa  43.9  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0969344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2750  hypothetical protein  33.33 
 
 		 127 aa  42  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.566687 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>