38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_5826 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_5826  nitrile hydratase  100 
 
 		 244 aa  498  1e-140  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.484903 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1010  nitrile hydratase  82.45 
 
 		 245 aa  417  1e-116  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.695468  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5090  nitrile hydratase beta subunit  52.42 
 
 		 247 aa  256  2e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0204432  normal  0.0806995 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6980  nitrile hydratase beta subunit  53.47 
 
 		 246 aa  250  1e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4710  nitrile hydratase beta subunit  52.42 
 
 		 247 aa  244  6e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.537552 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3459  nitrile hydratase beta subunit  52.87 
 
 		 245 aa  241  7e-63  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2749  nitrile hydratase  32 
 
 		 218 aa  108  6e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.5824 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7675  nitrile hydratase beta subunit  30.36 
 
 		 231 aa  97.1  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.389873  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2705  nitrile hydratase  29.22 
 
 		 219 aa  93.6  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.745191  normal  0.533217 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2000  nitrile hydratase  29.13 
 
 		 219 aa  89.7  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.58695  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3146  Nitrile hydratase  29.75 
 
 		 218 aa  87.4  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.149044  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2784  Nitrile hydratase  30.49 
 
 		 219 aa  85.9  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.34863  normal  0.327581 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2747  nitrile hydratase  28.22 
 
 		 218 aa  85.9  5e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2525  Nitrile hydratase  30.2 
 
 		 219 aa  85.1  8e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.994092  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0647  nitrile hydratase  30.51 
 
 		 230 aa  81.6  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.15879  normal  0.564644 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4084  nitrile hydratase subunit beta (Nitrilase) (NHase)  30.74 
 
 		 219 aa  81.6  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.109394 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6961  nitrile hydratase  30.2 
 
 		 247 aa  80.9  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0306533 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0905  nitrile hydratase  28.05 
 
 		 219 aa  78.2  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.181053 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4283  nitrile hydratase  28.81 
 
 		 217 aa  72  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.487082  normal  0.660679 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4083  nitrile hydratase  28.81 
 
 		 217 aa  72  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1666  Nitrile hydratase  32.7 
 
 		 221 aa  71.6  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7182  Nitrile hydratase  23.97 
 
 		 223 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3234  nitrile hydratase  27.98 
 
 		 217 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.586859 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1971  nitrile hydratase  27.24 
 
 		 234 aa  69.3  0.00000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0907735 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6543  nitrile hydratase  28.29 
 
 		 217 aa  68.9  0.00000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.817506  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6257  nitrile hydratase  28.29 
 
 		 217 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.416291  normal  0.795432 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2729  nitrile hydratase  24.19 
 
 		 220 aa  62  0.000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5346  hypothetical protein  26.09 
 
 		 279 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5257  hypothetical protein  26.09 
 
 		 279 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4915  hypothetical protein  27.4 
 
 		 279 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.8251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5636  hypothetical protein  26.09 
 
 		 279 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.628248 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3786  putative ScnA-like protein  30.53 
 
 		 95 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.132911 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1505  hypothetical protein  25.73 
 
 		 279 aa  50.1  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.598489  normal  0.365022 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1848  hypothetical protein  30.77 
 
 		 102 aa  48.9  0.00008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.411969 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2112  Nitrile hydratase  25.67 
 
 		 192 aa  48.9  0.00008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4231  hypothetical protein  28.19 
 
 		 284 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0969344  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2314  putative ScnA-like protein  33.7 
 
 		 97 aa  47.8  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1220  hypothetical protein  28.28 
 
 		 102 aa  45.1  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>