42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_2749 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_2749  nitrile hydratase  100 
 
 		 218 aa  444  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.5824 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2705  nitrile hydratase  72.81 
 
 		 219 aa  322  2e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.745191  normal  0.533217 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2747  nitrile hydratase  68.35 
 
 		 218 aa  304  6e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3146  Nitrile hydratase  68.35 
 
 		 218 aa  302  2.0000000000000002e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.149044  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4084  nitrile hydratase subunit beta (Nitrilase) (NHase)  66.36 
 
 		 219 aa  288  5.0000000000000004e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.109394 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7675  nitrile hydratase beta subunit  53.42 
 
 		 231 aa  226  2e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.389873  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2784  Nitrile hydratase  50.45 
 
 		 219 aa  221  4.9999999999999996e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.34863  normal  0.327581 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7182  Nitrile hydratase  52.27 
 
 		 223 aa  216  2e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1666  Nitrile hydratase  56.34 
 
 		 221 aa  214  9.999999999999999e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2525  Nitrile hydratase  50.23 
 
 		 219 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.994092  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6961  nitrile hydratase  54.59 
 
 		 247 aa  209  3e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0306533 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0905  nitrile hydratase  51.14 
 
 		 219 aa  208  5e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.181053 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2000  nitrile hydratase  50.46 
 
 		 219 aa  204  6e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.58695  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1971  nitrile hydratase  41.45 
 
 		 234 aa  151  7e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0907735 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0647  nitrile hydratase  33.62 
 
 		 230 aa  118  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.15879  normal  0.564644 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5826  nitrile hydratase  32 
 
 		 244 aa  105  4e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.484903 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1010  nitrile hydratase  32.11 
 
 		 245 aa  100  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.695468  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6980  nitrile hydratase beta subunit  29.83 
 
 		 246 aa  97.8  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5090  nitrile hydratase beta subunit  27.38 
 
 		 247 aa  94  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0204432  normal  0.0806995 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3234  nitrile hydratase  32.89 
 
 		 217 aa  93.2  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.586859 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3459  nitrile hydratase beta subunit  31.65 
 
 		 245 aa  89.7  3e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4083  nitrile hydratase  33.04 
 
 		 217 aa  89.4  4e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4283  nitrile hydratase  33.04 
 
 		 217 aa  89.4  4e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.487082  normal  0.660679 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4710  nitrile hydratase beta subunit  29.71 
 
 		 247 aa  89  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.537552 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2729  nitrile hydratase  32.44 
 
 		 220 aa  89  5e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6257  nitrile hydratase  31.28 
 
 		 217 aa  87.4  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.416291  normal  0.795432 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6543  nitrile hydratase  31.28 
 
 		 217 aa  87.4  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.817506  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2112  Nitrile hydratase  30.81 
 
 		 192 aa  75.5  0.0000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3786  putative ScnA-like protein  35.87 
 
 		 95 aa  55.1  0.0000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.132911 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5257  hypothetical protein  27.05 
 
 		 279 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5636  hypothetical protein  27.05 
 
 		 279 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.628248 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5346  hypothetical protein  27.05 
 
 		 279 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1848  hypothetical protein  37.36 
 
 		 102 aa  51.2  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.411969 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2313  putative ScnB-like protein  40.86 
 
 		 99 aa  50.8  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1847  hypothetical protein  38.2 
 
 		 122 aa  49.7  0.00004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.41925 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4915  hypothetical protein  25.21 
 
 		 279 aa  48.5  0.00007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.8251  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4712  putative transmembrane nitrile hydratase  38.1 
 
 		 108 aa  47  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1505  hypothetical protein  23.29 
 
 		 279 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.598489  normal  0.365022 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2314  putative ScnA-like protein  37.78 
 
 		 97 aa  45.1  0.0009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3461  putative transmembrane nitrile hydratase  37.5 
 
 		 115 aa  44.7  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7183  hypothetical protein  33.73 
 
 		 122 aa  43.5  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6982  putative transmembrane nitrile hydratase  31.11 
 
 		 108 aa  41.6  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>