More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5982 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_5982  histone family protein DNA-binding protein  100 
 
 		 100 aa  198  3e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.946495 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4435  histone family protein DNA-binding protein  79 
 
 		 101 aa  169  2e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.90338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3687  DNA-binding protein HU  82.76 
 
 		 110 aa  152  2e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0128  histone family protein DNA-binding protein  68.09 
 
 		 100 aa  137  4.999999999999999e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1534  histone family protein DNA-binding protein  61.46 
 
 		 96 aa  120  5e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.926041  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02675  DNA-binding protein HU  62.22 
 
 		 97 aa  115  1.9999999999999998e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0938  histone family protein DNA-binding protein  62.22 
 
 		 95 aa  115  3e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1479  histone family protein DNA-binding protein  58.16 
 
 		 104 aa  111  3e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1258  DNA-binding protein HU  55.56 
 
 		 92 aa  109  1.0000000000000001e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0154  histone family DNA-binding protein  51.58 
 
 		 95 aa  108  3e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1888  histone family protein DNA-binding protein  37.65 
 
 		 93 aa  67.8  0.00000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000630839  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2302  histone family protein DNA-binding protein  38.82 
 
 		 97 aa  67.4  0.00000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3012  integration host factor, beta subunit  36.17 
 
 		 95 aa  67  0.00000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000121818  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1417  histone-like DNA-binding protein  36.47 
 
 		 91 aa  66.2  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000053245  normal  0.466182 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3754  histone family protein DNA-binding protein  32.97 
 
 		 101 aa  66.2  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.159868  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0180  histone family protein DNA-binding protein  36.47 
 
 		 91 aa  66.2  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.75268  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1521  integration host factor, alpha subunit  35.16 
 
 		 91 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.43426  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2336  integration host factor, beta subunit  34.41 
 
 		 95 aa  65.1  0.0000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00131749  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0238  histone family protein DNA-binding protein  36.47 
 
 		 91 aa  65.5  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2356  histone family protein DNA-binding protein  35.29 
 
 		 94 aa  64.7  0.0000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2622  histone family protein DNA-binding protein  36.47 
 
 		 92 aa  64.7  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.349381  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1996  histone family protein DNA-binding protein  35.87 
 
 		 92 aa  64.7  0.0000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2224  histone family protein DNA-binding protein  35.87 
 
 		 92 aa  64.7  0.0000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000923552 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1886  integration host factor, alpha subunit  33.33 
 
 		 99 aa  64.3  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.067674 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0965  integration host factor, beta subunit  33.33 
 
 		 112 aa  64.3  0.0000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2120  integration host factor, alpha subunit  36.47 
 
 		 91 aa  63.9  0.0000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1424  integration host factor, alpha subunit  34.41 
 
 		 93 aa  63.5  0.0000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000184784  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1686  DNA-binding protein HU-beta, NS1(HU-1)  34.83 
 
 		 90 aa  63.5  0.0000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.460310000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3286  histone family protein DNA-binding protein  34.44 
 
 		 109 aa  63.2  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00577956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2470  integration host factor, beta subunit  32.04 
 
 		 103 aa  63.2  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.391555  normal  0.36333 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1992  histone family protein DNA-binding protein  36.56 
 
 		 99 aa  62.8  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.0074793  normal  0.250036 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1390  integration host factor, beta subunit  32.04 
 
 		 103 aa  63.2  0.000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0244556  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2245  putative integration host factor beta-subunit (ihf-beta) protein  32.22 
 
 		 111 aa  62.4  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1909  integration host factor subunit alpha  34.12 
 
 		 113 aa  62  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1969  integration host factor subunit alpha  34.12 
 
 		 113 aa  62  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.0019696  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1926  histone family protein DNA-binding protein  33.71 
 
 		 92 aa  62  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000201993  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1994  integration host factor subunit alpha  34.12 
 
 		 113 aa  62  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.110028  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0894  nucleoid DNA-binding protein  34.09 
 
 		 91 aa  62  0.000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  8.08972e-16  hitchhiker  0.000000000000265027 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0293  histone family protein DNA-binding protein  34.83 
 
 		 94 aa  61.2  0.000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.416752  normal  0.0238993 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1181  histone family protein DNA-binding protein  31.46 
 
 		 92 aa  61.6  0.000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.42545  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1365  integration host factor subunit beta  32.99 
 
 		 98 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.361598  normal  0.0158973 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3941  integration host factor subunit beta  32.99 
 
 		 98 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.21925 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4060  integration host factor subunit beta  31.63 
 
 		 98 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.343947 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4725  integration host factor, beta subunit  32.22 
 
 		 113 aa  60.8  0.000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.929388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1872  histone family protein DNA-binding protein  36.47 
 
 		 94 aa  60.8  0.000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000425439  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1031  histone family protein DNA-binding protein  28.26 
 
 		 94 aa  60.5  0.000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1028  integration host factor subunit beta  35.79 
 
 		 98 aa  60.5  0.000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.100562  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2797  integration host factor, beta subunit  30 
 
 		 104 aa  60.1  0.000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.903901  hitchhiker  0.000129709 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0525  nucleoid protein Hbs  36.36 
 
 		 91 aa  60.1  0.000000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.00046461  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1751  integration host factor, beta subunit  34.44 
 
 		 98 aa  59.3  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0162553  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3641  integration host factor subunit beta  34.44 
 
 		 98 aa  59.3  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.222556  normal  0.634422 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4161  integration host factor subunit beta  32.22 
 
 		 107 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3229  histone family protein DNA-binding protein  34.07 
 
 		 91 aa  59.7  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1007  integration host factor subunit beta  32.22 
 
 		 107 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.864933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1855  integration host factor subunit beta  34.44 
 
 		 95 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.756472  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15880  integration host factor subunit beta  34.44 
 
 		 92 aa  59.7  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3223  integration host factor, beta subunit  30.61 
 
 		 102 aa  59.7  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00795206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3742  integration host factor, alpha subunit  33.72 
 
 		 100 aa  60.1  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.266099  normal  0.554438 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0569  integration host factor subunit beta  32.22 
 
 		 107 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2654  histone family protein DNA-binding protein  30.61 
 
 		 102 aa  59.7  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1048  integration host factor subunit beta  32.22 
 
 		 107 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0765  nucleoid protein Hbs  32.95 
 
 		 91 aa  60.1  0.00000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000296782  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0905  integration host factor, beta subunit  35.56 
 
 		 101 aa  59.3  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.809702  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1026  integration host factor, beta subunit  35.56 
 
 		 101 aa  59.3  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00129538  unclonable  0.0000000000260989 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1786  histone family protein DNA-binding protein  35.16 
 
 		 103 aa  58.9  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0401434 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1968  integration host factor subunit beta  34.44 
 
 		 94 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.943011  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23340  integration host factor subunit beta  34.44 
 
 		 94 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116436  hitchhiker  0.00519002 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0238  histone family protein DNA-binding protein  31.76 
 
 		 91 aa  58.9  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0424  histone family protein DNA-binding protein  35.48 
 
 		 102 aa  59.3  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0149855  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0532  DNA-binding protein HU-beta  33.71 
 
 		 90 aa  58.2  0.00000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00043104  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0461  histone family protein DNA-binding protein  35.11 
 
 		 102 aa  58.5  0.00000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.376006  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0548  HU family DNA-binding protein  33.71 
 
 		 90 aa  58.5  0.00000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_16074  predicted protein  32.18 
 
 		 90 aa  58.5  0.00000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.73937  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0356  histone family protein DNA-binding protein  35.05 
 
 		 102 aa  58.2  0.00000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2673  histone family protein DNA-binding protein  31.46 
 
 		 91 aa  58.5  0.00000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.156087  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1788  integration host factor, beta subunit  30 
 
 		 104 aa  58.5  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000860483 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4105  nucleoid protein Hbs  35.96 
 
 		 110 aa  58.2  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.340401  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0918  integration host factor, alpha subunit  28.57 
 
 		 99 aa  58.5  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2256  integration host factor subunit beta  31.11 
 
 		 107 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1773  integration host factor subunit beta  33.33 
 
 		 100 aa  57.8  0.00000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.976325  normal  0.0185498 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1613  integration host factor, beta subunit  30 
 
 		 104 aa  58.2  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0548  histone family protein DNA-binding protein  33.71 
 
 		 90 aa  57.8  0.00000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1724  histone-like DNA-binding protein  34.04 
 
 		 102 aa  57.8  0.00000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.142965  normal  0.165722 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0564  histone-like DNA-binding protein  36.9 
 
 		 102 aa  57.8  0.00000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0983  integration host factor subunit beta  28.71 
 
 		 107 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.131421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2465  integration host factor subunit beta  33.33 
 
 		 96 aa  57.8  0.00000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000000804162  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0747  integration host factor subunit beta  31.11 
 
 		 107 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.189639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3207  histone family protein DNA-binding protein  33.71 
 
 		 91 aa  57.8  0.00000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1430  histone family protein DNA-binding protein  35.56 
 
 		 90 aa  57.8  0.00000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000153062  normal  0.144736 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0547  histone family protein DNA-binding protein  33.71 
 
 		 90 aa  57.8  0.00000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0135  histone family protein DNA-binding protein  31.11 
 
 		 91 aa  57.4  0.00000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00267128  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2074  integration host factor subunit beta  31.11 
 
 		 95 aa  57.8  0.00000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000549511  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3000  integration host factor subunit beta  28.71 
 
 		 107 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.125834  hitchhiker  0.00514155 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0181  integration host factor, beta subunit  31.11 
 
 		 113 aa  57.4  0.00000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000858176  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1380  integration host factor subunit beta  33.33 
 
 		 98 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3021  histone family protein DNA-binding protein  29.27 
 
 		 91 aa  57.4  0.00000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2154  histone family protein DNA-binding protein  30 
 
 		 90 aa  57.4  0.00000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000552537  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1737  integration host factor subunit beta  31.11 
 
 		 95 aa  57.4  0.00000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122677  hitchhiker  0.00231326 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1633  histone family protein DNA-binding protein  35.29 
 
 		 90 aa  57.4  0.00000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3199  integration host factor subunit beta  32.99 
 
 		 98 aa  57.4  0.00000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0890177  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>