More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aasi_0154 on replicon NC_010830
Organism: Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010830  Aasi_0154  histone family DNA-binding protein  100 
 
 		 95 aa  188  2.9999999999999997e-47  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3687  DNA-binding protein HU  54.65 
 
 		 110 aa  108  2.0000000000000002e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5982  histone family protein DNA-binding protein  51.58 
 
 		 100 aa  108  3e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.946495 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4435  histone family protein DNA-binding protein  51.11 
 
 		 101 aa  107  8.000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.90338  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0128  histone family protein DNA-binding protein  53.33 
 
 		 100 aa  105  2e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0938  histone family protein DNA-binding protein  46.67 
 
 		 95 aa  92  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1479  histone family protein DNA-binding protein  42.55 
 
 		 104 aa  80.9  0.000000000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1534  histone family protein DNA-binding protein  41.11 
 
 		 96 aa  77.4  0.00000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.926041  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02675  DNA-binding protein HU  38.89 
 
 		 97 aa  76.3  0.0000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1258  DNA-binding protein HU  40 
 
 		 92 aa  75.1  0.0000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0356  histone family protein DNA-binding protein  34.78 
 
 		 102 aa  62.8  0.000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0424  histone family protein DNA-binding protein  33.7 
 
 		 102 aa  61.2  0.000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0149855  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15071  histone-like DNA-binding protein  34.07 
 
 		 91 aa  60.1  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15201  histone-like DNA-binding protein  34.07 
 
 		 91 aa  60.1  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.581406  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1992  histone family protein DNA-binding protein  32.61 
 
 		 99 aa  60.1  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.0074793  normal  0.250036 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0564  histone-like DNA-binding protein  33.73 
 
 		 102 aa  59.7  0.00000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0461  histone family protein DNA-binding protein  34.41 
 
 		 102 aa  60.1  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.376006  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14821  histone-like DNA-binding protein  34.07 
 
 		 91 aa  59.3  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1419  histone-like DNA-binding protein  34.07 
 
 		 91 aa  59.3  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0765  nucleoid protein Hbs  33.71 
 
 		 91 aa  58.9  0.00000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000296782  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1786  histone family protein DNA-binding protein  32.18 
 
 		 103 aa  57.8  0.00000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0401434 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1724  histone-like DNA-binding protein  31.18 
 
 		 102 aa  58.2  0.00000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.142965  normal  0.165722 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0894  nucleoid DNA-binding protein  33.71 
 
 		 91 aa  57.8  0.00000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  8.08972e-16  hitchhiker  0.000000000000265027 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0186  histone family protein DNA-binding protein  30.85 
 
 		 90 aa  57.4  0.00000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0525  nucleoid protein Hbs  33.71 
 
 		 91 aa  57.4  0.00000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.00046461  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0892  histone-like DNA-binding protein  32.97 
 
 		 91 aa  56.2  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.879625  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3199  integration host factor subunit beta  31.11 
 
 		 98 aa  56.2  0.0000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0890177  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0579  histone-like DNA-binding protein  32.97 
 
 		 91 aa  56.6  0.0000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.410031  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0848  histone-like DNA-binding protein  30.12 
 
 		 102 aa  56.2  0.0000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2092  nucleoid protein Hbs  32.97 
 
 		 91 aa  56.6  0.0000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17471  histone-like DNA-binding protein  32.97 
 
 		 91 aa  56.2  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.631409  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3085  histone family protein DNA-binding protein  31.76 
 
 		 91 aa  55.5  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000115471  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0550  DNA-binding protein HU-beta  31.76 
 
 		 92 aa  55.8  0.0000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.169626  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2802  DNA-binding protein HU  29.21 
 
 		 91 aa  55.5  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000000141643  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2488  DNA-binding protein HU  29.21 
 
 		 91 aa  55.5  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.0000000000405619  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0687  histone family protein DNA-binding protein  32.22 
 
 		 91 aa  55.1  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.105584  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2248  nucleoid protein Hbs  29.67 
 
 		 91 aa  55.5  0.0000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0990789 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0648  histone family protein DNA-binding protein  31.33 
 
 		 91 aa  55.5  0.0000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000417185  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0135  histone family protein DNA-binding protein  32.22 
 
 		 91 aa  54.7  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00267128  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00892  integration host factor subunit beta  29.47 
 
 		 103 aa  54.7  0.0000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0417223  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1653  histone-like DNA-binding protein  30.34 
 
 		 90 aa  54.7  0.0000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000047794  unclonable  0.0000440637 
 
 
 
NC_008820  P9303_05711  histone-like DNA-binding protein  32.97 
 
 		 91 aa  54.7  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.761988 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2657  nucleoid protein Hbs  29.67 
 
 		 91 aa  54.7  0.0000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000194133  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15880  integration host factor subunit beta  26.67 
 
 		 92 aa  54.3  0.0000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0075  histone family protein DNA-binding protein  29.21 
 
 		 91 aa  54.7  0.0000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0181  integration host factor, beta subunit  27.78 
 
 		 113 aa  54.3  0.0000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000858176  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1426  histone family protein DNA-binding protein  32.53 
 
 		 102 aa  54.3  0.0000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1855  integration host factor subunit beta  26.67 
 
 		 95 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.756472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1968  integration host factor subunit beta  26.67 
 
 		 94 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.943011  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1882  integration host factor alpha-subunit  30.53 
 
 		 113 aa  54.3  0.0000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.027165 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0083  DNA-binding protein HU (DNA-binding protein II)  36.14 
 
 		 90 aa  54.3  0.0000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23340  integration host factor subunit beta  26.67 
 
 		 94 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116436  hitchhiker  0.00519002 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1031  histone family protein DNA-binding protein  24.18 
 
 		 94 aa  53.9  0.0000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2846  histone family protein DNA-binding protein  29.79 
 
 		 235 aa  53.9  0.0000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4060  integration host factor subunit beta  26.67 
 
 		 98 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.343947 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3021  histone family protein DNA-binding protein  26.67 
 
 		 91 aa  53.9  0.0000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1028  integration host factor subunit beta  30.53 
 
 		 98 aa  53.9  0.0000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.100562  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0390  histone family protein DNA-binding protein  28.09 
 
 		 90 aa  53.9  0.0000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.0000165854  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2572  histone family protein DNA-binding protein  34.72 
 
 		 206 aa  53.5  0.0000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1751  integration host factor, beta subunit  26.67 
 
 		 98 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0162553  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3641  integration host factor subunit beta  26.67 
 
 		 98 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.222556  normal  0.634422 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2493  integration host factor subunit alpha  30 
 
 		 98 aa  53.5  0.0000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.044668  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0115  histone family protein DNA-binding protein  31.33 
 
 		 95 aa  53.5  0.0000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.552761  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0721  histone family protein DNA-binding protein  33.71 
 
 		 91 aa  53.5  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.824313 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1474  putative DNA-binding protein HU-beta  29.21 
 
 		 90 aa  53.5  0.000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000997119  hitchhiker  0.0000985943 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2142  histone family protein DNA-binding protein  27.47 
 
 		 91 aa  53.1  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0158969  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1180  histone-like DNA-binding protein  34.12 
 
 		 90 aa  53.1  0.000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  2.95654e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0465  histone family protein DNA-binding protein  31.11 
 
 		 90 aa  53.1  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2489  histone family protein DNA-binding protein  32.58 
 
 		 95 aa  53.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0133  histone family protein DNA-binding protein  34.07 
 
 		 91 aa  53.1  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116647  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2301  nucleoid protein Hbs  35.06 
 
 		 90 aa  53.1  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.265465  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1763  histone family protein DNA-binding protein  31.11 
 
 		 90 aa  52.8  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.203917  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2403  histone family protein DNA-binding protein  31.11 
 
 		 90 aa  52.8  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000237544  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2424  histone family protein DNA-binding protein  29.21 
 
 		 91 aa  52.4  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000394497  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2342  DNA-binding protein HU  31.11 
 
 		 90 aa  52  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.868034  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2983  DNA-binding protein HU  31.11 
 
 		 90 aa  52  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4159  histone family protein DNA-binding protein  29.21 
 
 		 91 aa  52.8  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2154  histone family protein DNA-binding protein  30 
 
 		 90 aa  52.8  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000552537  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0238  histone family protein DNA-binding protein  31.87 
 
 		 91 aa  52.8  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2203  histone family protein DNA-binding protein  30.77 
 
 		 91 aa  52.8  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0471577  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1250  histone family protein DNA-binding protein  31.87 
 
 		 91 aa  52  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1870  histone family protein DNA-binding protein  30 
 
 		 91 aa  52  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0130937 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0983  integration host factor subunit beta  26.67 
 
 		 107 aa  52.8  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.131421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1468  DNA-binding protein HU beta subunit  31.76 
 
 		 91 aa  52.4  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.961834  normal  0.643607 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2184  histone family protein DNA-binding protein  32.22 
 
 		 90 aa  52.8  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.170143  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1341  histone family protein DNA-binding protein  31.87 
 
 		 91 aa  52.4  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1172  histone-like DNA-binding protein  31.76 
 
 		 90 aa  52.4  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.856335  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2213  DNA-binding protein HU  31.11 
 
 		 90 aa  52  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.519209  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0969  integration host factor subunit alpha  30.85 
 
 		 134 aa  52  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0165  integration host factor subunit beta  29.79 
 
 		 94 aa  52  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1718  integration host factor subunit alpha  30.85 
 
 		 134 aa  52  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2470  integration host factor, beta subunit  29.76 
 
 		 103 aa  51.6  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.391555  normal  0.36333 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0085  nucleoid protein Hbs  29.21 
 
 		 91 aa  52  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0539634  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2589  integration host factor subunit alpha  30.85 
 
 		 134 aa  52  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3585  integration host factor subunit beta  29.35 
 
 		 95 aa  52  0.000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0516176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1405  integration host factor subunit alpha  30.85 
 
 		 131 aa  51.6  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1741  integration host factor subunit alpha  30.85 
 
 		 134 aa  52  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.394996  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1365  integration host factor subunit beta  25.56 
 
 		 98 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.361598  normal  0.0158973 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0875  histone family protein DNA-binding protein  29.21 
 
 		 90 aa  51.6  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.757232  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1365  integration host factor subunit alpha  30.85 
 
 		 131 aa  51.6  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>