More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3687 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_3687  DNA-binding protein HU  100 
 
 		 110 aa  216  7e-56  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5982  histone family protein DNA-binding protein  79 
 
 		 100 aa  164  2.9999999999999998e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.946495 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4435  histone family protein DNA-binding protein  74.26 
 
 		 101 aa  161  3e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.90338  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0128  histone family protein DNA-binding protein  72 
 
 		 100 aa  143  9e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0938  histone family protein DNA-binding protein  60 
 
 		 95 aa  120  8e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1534  histone family protein DNA-binding protein  58.33 
 
 		 96 aa  116  9.999999999999999e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.926041  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1258  DNA-binding protein HU  60 
 
 		 92 aa  115  1.9999999999999998e-25  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0154  histone family DNA-binding protein  53.85 
 
 		 95 aa  112  1.0000000000000001e-24  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02675  DNA-binding protein HU  56.25 
 
 		 97 aa  110  6e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1479  histone family protein DNA-binding protein  55.79 
 
 		 104 aa  110  6e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3286  histone family protein DNA-binding protein  35.56 
 
 		 109 aa  68.6  0.00000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00577956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1390  integration host factor, beta subunit  34.44 
 
 		 103 aa  67.4  0.00000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0244556  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1417  histone-like DNA-binding protein  37.36 
 
 		 91 aa  67.4  0.00000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000053245  normal  0.466182 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2470  integration host factor, beta subunit  34.44 
 
 		 103 aa  67.4  0.00000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.391555  normal  0.36333 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0965  integration host factor, beta subunit  32.22 
 
 		 112 aa  66.6  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1724  histone-like DNA-binding protein  36.56 
 
 		 102 aa  66.6  0.0000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.142965  normal  0.165722 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1521  integration host factor, alpha subunit  37.65 
 
 		 91 aa  65.5  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.43426  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1992  histone family protein DNA-binding protein  35.11 
 
 		 99 aa  65.9  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.0074793  normal  0.250036 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1686  DNA-binding protein HU-beta, NS1(HU-1)  35.29 
 
 		 90 aa  66.2  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.460310000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1888  histone family protein DNA-binding protein  36.47 
 
 		 93 aa  66.2  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000630839  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0186  histone family protein DNA-binding protein  34.15 
 
 		 90 aa  65.1  0.0000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2154  histone family protein DNA-binding protein  33.33 
 
 		 90 aa  65.5  0.0000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000552537  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2356  histone family protein DNA-binding protein  32.58 
 
 		 94 aa  65.1  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4725  integration host factor, beta subunit  33.33 
 
 		 113 aa  65.1  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.929388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3125  histone family protein DNA-binding protein  32.22 
 
 		 112 aa  64.7  0.0000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0598577  decreased coverage  0.00823154 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1926  histone family protein DNA-binding protein  34.83 
 
 		 92 aa  64.7  0.0000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000201993  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1181  histone family protein DNA-binding protein  34.12 
 
 		 92 aa  64.7  0.0000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.42545  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0238  histone family protein DNA-binding protein  35.29 
 
 		 91 aa  64.3  0.0000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0424  histone family protein DNA-binding protein  35.48 
 
 		 102 aa  64.7  0.0000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0149855  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0238  histone family protein DNA-binding protein  34.83 
 
 		 91 aa  63.9  0.0000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2622  histone family protein DNA-binding protein  36.47 
 
 		 92 aa  63.9  0.0000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.349381  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0293  histone family protein DNA-binding protein  35.16 
 
 		 94 aa  63.5  0.0000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.416752  normal  0.0238993 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2120  integration host factor, alpha subunit  38.04 
 
 		 91 aa  63.5  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1637  DNA-binding protein HU  33.33 
 
 		 90 aa  62.8  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00420342  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1329  integration host factor, beta subunit  33.33 
 
 		 101 aa  63.2  0.000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0690057  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1420  DNA-binding protein HU  33.33 
 
 		 90 aa  62.8  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.190218  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1392  DNA-binding protein HU  33.33 
 
 		 90 aa  62.8  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.011833  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1392  DNA-binding protein HU  33.33 
 
 		 90 aa  62.8  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000512711  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3779  DNA-binding protein HU  33.33 
 
 		 90 aa  62.8  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000354145  normal  0.961445 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1434  histone family protein DNA-binding protein  33.33 
 
 		 90 aa  62.8  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.087278  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2673  histone family protein DNA-binding protein  35.96 
 
 		 91 aa  62.8  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.156087  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1996  histone family protein DNA-binding protein  37.65 
 
 		 92 aa  63.5  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0765  nucleoid protein Hbs  32.95 
 
 		 91 aa  62.8  0.000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000296782  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0356  histone family protein DNA-binding protein  35.48 
 
 		 102 aa  63.2  0.000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1531  DNA-binding protein HU  33.33 
 
 		 90 aa  62.8  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.259543  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2245  putative integration host factor beta-subunit (ihf-beta) protein  27.52 
 
 		 111 aa  63.2  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1604  DNA-binding protein HU  33.33 
 
 		 90 aa  62.8  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000159132 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1565  histone-like DNA-binding protein  33.33 
 
 		 103 aa  63.2  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2224  histone family protein DNA-binding protein  37.65 
 
 		 92 aa  63.5  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000923552 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0461  histone family protein DNA-binding protein  35.48 
 
 		 102 aa  62.8  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.376006  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1673  DNA-binding protein HU  33.33 
 
 		 90 aa  62.8  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000325838  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1031  histone family protein DNA-binding protein  32.26 
 
 		 94 aa  63.2  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1566  DNA-binding protein HU  33.33 
 
 		 90 aa  62.8  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.236067  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1233  histone family protein DNA-binding protein  33.33 
 
 		 90 aa  62.8  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0133564  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0465  histone family protein DNA-binding protein  32.22 
 
 		 90 aa  62.8  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2336  integration host factor, beta subunit  32.26 
 
 		 95 aa  62.4  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00131749  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3000  integration host factor subunit beta  28.43 
 
 		 107 aa  62  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.125834  hitchhiker  0.00514155 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1613  integration host factor, beta subunit  31.11 
 
 		 104 aa  62.4  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1900  histone family protein DNA-binding protein  35.16 
 
 		 90 aa  62  0.000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0802524 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1886  integration host factor, alpha subunit  34.12 
 
 		 99 aa  62.4  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.067674 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1788  integration host factor, beta subunit  31.11 
 
 		 104 aa  62.8  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000860483 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2302  histone family protein DNA-binding protein  35.29 
 
 		 97 aa  62.8  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0431  histone family protein DNA-binding protein  34.83 
 
 		 96 aa  62.8  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00947903  hitchhiker  0.00103246 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2944  integration host factor subunit beta  31.11 
 
 		 107 aa  62  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.846703  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0648  histone family protein DNA-binding protein  35.29 
 
 		 91 aa  61.6  0.000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000417185  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0201  histone family protein DNA-binding protein  32.97 
 
 		 91 aa  62  0.000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000429798  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0427  integration host factor subunit beta  31.11 
 
 		 107 aa  62  0.000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.496954  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0747  integration host factor subunit beta  30 
 
 		 107 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.189639  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0550  DNA-binding protein HU-beta  33.71 
 
 		 92 aa  61.6  0.000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.169626  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2992  integration host factor subunit beta  31.11 
 
 		 107 aa  62  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0181  integration host factor, beta subunit  31.11 
 
 		 113 aa  62  0.000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000858176  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1424  integration host factor, alpha subunit  35.29 
 
 		 93 aa  61.6  0.000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000184784  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1909  integration host factor subunit alpha  34.12 
 
 		 113 aa  61.6  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1639  integration host factor subunit beta  31.11 
 
 		 107 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.79916  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1994  integration host factor subunit alpha  34.12 
 
 		 113 aa  61.6  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.110028  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2571  integration host factor subunit beta  31.11 
 
 		 107 aa  62  0.000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.444385  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0946  integration host factor subunit beta  31.11 
 
 		 107 aa  62  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.666677  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0983  integration host factor subunit beta  28.71 
 
 		 107 aa  62  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.131421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2881  integration host factor subunit beta  31.11 
 
 		 107 aa  62  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0601006  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1533  histone family protein DNA-binding protein  31.46 
 
 		 90 aa  62  0.000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.753498  normal  0.353479 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1866  histone family protein DNA-binding protein  31.46 
 
 		 90 aa  61.6  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0187787  hitchhiker  0.00274705 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0202  integration host factor subunit beta  31.11 
 
 		 107 aa  62  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0525  nucleoid protein Hbs  36.36 
 
 		 91 aa  61.6  0.000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.00046461  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2256  integration host factor subunit beta  31.11 
 
 		 107 aa  62  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1969  integration host factor subunit alpha  34.12 
 
 		 113 aa  61.2  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.0019696  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3012  integration host factor, beta subunit  33.33 
 
 		 95 aa  61.6  0.000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000121818  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0928  integration host factor subunit beta  31.11 
 
 		 107 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.950077 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1028  integration host factor subunit beta  33.68 
 
 		 98 aa  61.2  0.000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.100562  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1786  histone family protein DNA-binding protein  32.97 
 
 		 103 aa  60.8  0.000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0401434 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1213  integration host factor, beta subunit  29.03 
 
 		 98 aa  61.2  0.000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0453781  normal  0.184792 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0924  integration host factor subunit beta  31.11 
 
 		 107 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.324388  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4161  integration host factor subunit beta  30 
 
 		 107 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0894  nucleoid DNA-binding protein  31.82 
 
 		 91 aa  60.8  0.000000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  8.08972e-16  hitchhiker  0.000000000000265027 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0562  integration host factor subunit beta  31.91 
 
 		 102 aa  60.5  0.000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.399271  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0569  integration host factor subunit beta  30 
 
 		 107 aa  60.8  0.000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1007  integration host factor subunit beta  30 
 
 		 107 aa  60.8  0.000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.864933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3021  histone family protein DNA-binding protein  30.49 
 
 		 91 aa  60.8  0.000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1048  integration host factor subunit beta  30 
 
 		 107 aa  60.8  0.000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1199  integration host factor, beta subunit  34.04 
 
 		 108 aa  60.5  0.000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2797  integration host factor, beta subunit  30 
 
 		 104 aa  60.5  0.000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.903901  hitchhiker  0.000129709 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>