54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5726 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_1312  putative alpha-glucosidase  56.79 
 
 
655 aa  776    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5726  Glycoside hydrolase 97  100 
 
 
656 aa  1355    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.035847 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4959  hypothetical protein  38.11 
 
 
659 aa  513  1e-144  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0169  putative alpha-glucosidase  41.68 
 
 
656 aa  505  1e-141  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5410  alpha-glucosidase, putative  38.31 
 
 
648 aa  480  1e-134  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0179561  normal  0.0688693 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2298  putative alpha-glucosidase  38.3 
 
 
647 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2360  putative alpha-glucosidase  38.71 
 
 
679 aa  464  1e-129  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.103256  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1628  putative alpha-glucosidase  37.98 
 
 
678 aa  457  1e-127  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0539219  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3217  alpha-glucosidase, putative  34.22 
 
 
682 aa  334  2e-90  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.751285  normal  0.432881 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0058  Glycoside hydrolase 97  31 
 
 
693 aa  271  4e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.52966 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23190  alpha-glucosidase  29.14 
 
 
701 aa  256  9e-67  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.243429  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1394  hypothetical protein  27.79 
 
 
700 aa  254  4.0000000000000004e-66  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.872498  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1108  alpha-glucosidase  28.43 
 
 
676 aa  253  8.000000000000001e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1777  alpha-glucosidase  27.58 
 
 
697 aa  252  1e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.441918  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0590  alpha-glucosidase  28.59 
 
 
684 aa  252  1e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.225417  normal  0.0221919 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4326  hypothetical protein  28.24 
 
 
672 aa  249  1e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0367  putative alpha-glucosidase  28.97 
 
 
677 aa  240  5.999999999999999e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1876  alpha-glucosidase  27.6 
 
 
707 aa  239  2e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.507439 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51780  alpha-glucosidase  29.06 
 
 
673 aa  239  2e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.816262  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2740  alpha-glucosidase  29.33 
 
 
703 aa  238  3e-61  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2102  alpha-glucosidase  28.1 
 
 
703 aa  237  5.0000000000000005e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.869354  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2329  alpha-glucosidase  28.36 
 
 
710 aa  236  1.0000000000000001e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.20719  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2329  alpha-glucosidase  28.22 
 
 
710 aa  235  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0185  alpha-glucosidase  28.49 
 
 
680 aa  234  4.0000000000000004e-60  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1876  alpha-glucosidase  27.67 
 
 
703 aa  234  4.0000000000000004e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2445  alpha-glucosidase  28.22 
 
 
710 aa  234  5e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.607095  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2450  alpha-glucosidase  27.94 
 
 
699 aa  233  1e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2002  alpha-glucosidase  27.32 
 
 
727 aa  232  1e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1931  alpha-glucosidase  27.39 
 
 
703 aa  231  3e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2017  alpha-glucosidase  28.19 
 
 
702 aa  231  4e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.248833  hitchhiker  0.00490164 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1019  alpha-glucosidase  29.81 
 
 
683 aa  229  1e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1892  alpha-glucosidase  27.89 
 
 
682 aa  228  3e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1209  hypothetical protein  26.74 
 
 
726 aa  226  9e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0626  alpha-glucosidase  26.42 
 
 
727 aa  221  3e-56  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1400  hypothetical protein  25.8 
 
 
704 aa  209  1e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0777  hypothetical protein  26.45 
 
 
606 aa  209  2e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3876  Glycoside hydrolase 97  28.19 
 
 
571 aa  205  2e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0907495  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0928  hypothetical protein  27.09 
 
 
728 aa  202  1.9999999999999998e-50  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.453447  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2708  hypothetical protein  24.22 
 
 
629 aa  196  1e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0314889  normal  0.739389 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4429  hypothetical protein  24.04 
 
 
707 aa  195  3e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.857441  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5767  putative alpha-glucosidase  25.21 
 
 
711 aa  191  2.9999999999999997e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1153  putative alpha-glucosidase  31.5 
 
 
574 aa  183  7e-45  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3805  hypothetical protein  24.74 
 
 
615 aa  177  4e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2499  putative alpha-glucosidase  24.51 
 
 
674 aa  176  9.999999999999999e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0476  alpha-glucosidase, putative, adg97A  26.13 
 
 
643 aa  175  2.9999999999999996e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.620164  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3590  hypothetical protein  26.39 
 
 
630 aa  164  5.0000000000000005e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.116623  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0790  alpha-glucosidase  26.1 
 
 
661 aa  164  5.0000000000000005e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0155602  normal  0.344193 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1420  hypothetical protein  24.06 
 
 
649 aa  161  3e-38  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.828826  normal  0.205294 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2469  Glycoside hydrolase 97  24.82 
 
 
641 aa  160  1e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.395097 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2159  alpha-glucosidase, putative, adg97A  25.34 
 
 
658 aa  140  4.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0591315  hitchhiker  0.000480532 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1419  Glycoside hydrolase 97  24.84 
 
 
648 aa  135  3e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.067122  normal  0.614514 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1460  Protein of unknown function DUF2223  25.41 
 
 
1255 aa  133  1.0000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3873  hypothetical protein  21.95 
 
 
647 aa  132  2.0000000000000002e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.437353  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3892  Alpha-galactosidase  28.66 
 
 
387 aa  47.8  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.77449  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>