53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3590 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_3590  hypothetical protein  100 
 
 
630 aa  1303    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.116623  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2708  hypothetical protein  30.88 
 
 
629 aa  281  2e-74  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0314889  normal  0.739389 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1420  hypothetical protein  30.88 
 
 
649 aa  256  7e-67  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.828826  normal  0.205294 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0169  putative alpha-glucosidase  27.82 
 
 
656 aa  214  4.9999999999999996e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1628  putative alpha-glucosidase  28.03 
 
 
678 aa  206  9e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0539219  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3876  Glycoside hydrolase 97  28.9 
 
 
571 aa  205  2e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0907495  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0476  alpha-glucosidase, putative, adg97A  27.65 
 
 
643 aa  202  1.9999999999999998e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.620164  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2159  alpha-glucosidase, putative, adg97A  27.68 
 
 
658 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0591315  hitchhiker  0.000480532 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0790  alpha-glucosidase  27.73 
 
 
661 aa  196  9e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0155602  normal  0.344193 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2298  putative alpha-glucosidase  28.77 
 
 
647 aa  196  9e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1153  putative alpha-glucosidase  30.77 
 
 
574 aa  196  1e-48  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3217  alpha-glucosidase, putative  26.95 
 
 
682 aa  184  3e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.751285  normal  0.432881 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23190  alpha-glucosidase  26.72 
 
 
701 aa  183  8.000000000000001e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.243429  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4959  hypothetical protein  28.52 
 
 
659 aa  182  2e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2499  putative alpha-glucosidase  31.98 
 
 
674 aa  178  2e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2360  putative alpha-glucosidase  27.49 
 
 
679 aa  178  3e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.103256  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1312  putative alpha-glucosidase  24.96 
 
 
655 aa  176  9.999999999999999e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5726  Glycoside hydrolase 97  26.39 
 
 
656 aa  176  1.9999999999999998e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.035847 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5410  alpha-glucosidase, putative  26.52 
 
 
648 aa  175  1.9999999999999998e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0179561  normal  0.0688693 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0185  alpha-glucosidase  27.87 
 
 
680 aa  172  2e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2329  alpha-glucosidase  26.76 
 
 
710 aa  169  1e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51780  alpha-glucosidase  27.15 
 
 
673 aa  168  2e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.816262  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2469  Glycoside hydrolase 97  25.67 
 
 
641 aa  168  2.9999999999999998e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.395097 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2445  alpha-glucosidase  26.43 
 
 
710 aa  167  5e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.607095  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0367  putative alpha-glucosidase  27.84 
 
 
677 aa  167  5.9999999999999996e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2740  alpha-glucosidase  27.81 
 
 
703 aa  167  8e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1892  alpha-glucosidase  26.83 
 
 
682 aa  166  1.0000000000000001e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1876  alpha-glucosidase  25.98 
 
 
707 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.507439 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2329  alpha-glucosidase  26.62 
 
 
710 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.20719  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2017  alpha-glucosidase  26.47 
 
 
702 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.248833  hitchhiker  0.00490164 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0058  Glycoside hydrolase 97  26.81 
 
 
693 aa  164  4.0000000000000004e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.52966 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0777  hypothetical protein  27.26 
 
 
606 aa  163  9e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2450  alpha-glucosidase  25.29 
 
 
699 aa  162  2e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0590  alpha-glucosidase  26.22 
 
 
684 aa  161  3e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.225417  normal  0.0221919 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2002  alpha-glucosidase  26.61 
 
 
727 aa  160  5e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1400  hypothetical protein  25.1 
 
 
704 aa  160  9e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1876  alpha-glucosidase  26.31 
 
 
703 aa  159  1e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1777  alpha-glucosidase  24.57 
 
 
697 aa  159  1e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.441918  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4326  hypothetical protein  26.47 
 
 
672 aa  157  4e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1931  alpha-glucosidase  26.49 
 
 
703 aa  157  5.0000000000000005e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2102  alpha-glucosidase  25.91 
 
 
703 aa  157  5.0000000000000005e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.869354  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4429  hypothetical protein  27.72 
 
 
707 aa  156  9e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.857441  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1108  alpha-glucosidase  26.09 
 
 
676 aa  155  2e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1394  hypothetical protein  25.35 
 
 
700 aa  154  7e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.872498  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5767  putative alpha-glucosidase  25.93 
 
 
711 aa  152  2e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1019  alpha-glucosidase  26.83 
 
 
683 aa  147  8.000000000000001e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3873  hypothetical protein  26.05 
 
 
647 aa  144  5e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.437353  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0626  alpha-glucosidase  24.16 
 
 
727 aa  139  2e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1209  hypothetical protein  24.64 
 
 
726 aa  137  4e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0928  hypothetical protein  25.75 
 
 
728 aa  118  3e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.453447  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3805  hypothetical protein  22.66 
 
 
615 aa  105  2e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1419  Glycoside hydrolase 97  24.3 
 
 
648 aa  104  6e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.067122  normal  0.614514 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1460  Protein of unknown function DUF2223  22.48 
 
 
1255 aa  90.9  6e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>