53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4429 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013162  Coch_0626  alpha-glucosidase  65.19 
 
 
727 aa  969    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1209  hypothetical protein  58.35 
 
 
726 aa  825    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1400  hypothetical protein  78.09 
 
 
704 aa  1160    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1394  hypothetical protein  53.68 
 
 
700 aa  770    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.872498  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0928  hypothetical protein  64.79 
 
 
728 aa  989    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.453447  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4429  hypothetical protein  100 
 
 
707 aa  1475    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.857441  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5767  putative alpha-glucosidase  66.15 
 
 
711 aa  967    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0058  Glycoside hydrolase 97  51.58 
 
 
693 aa  729    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.52966 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0367  putative alpha-glucosidase  42.2 
 
 
677 aa  565  1.0000000000000001e-159  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4326  hypothetical protein  42.14 
 
 
672 aa  535  1e-150  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51780  alpha-glucosidase  41.83 
 
 
673 aa  518  1.0000000000000001e-145  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.816262  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23190  alpha-glucosidase  41.74 
 
 
701 aa  518  1.0000000000000001e-145  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.243429  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1019  alpha-glucosidase  41.11 
 
 
683 aa  507  9.999999999999999e-143  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1777  alpha-glucosidase  40.62 
 
 
697 aa  499  1e-140  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.441918  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0185  alpha-glucosidase  40.49 
 
 
680 aa  496  1e-139  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1108  alpha-glucosidase  40.77 
 
 
676 aa  497  1e-139  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1892  alpha-glucosidase  39.94 
 
 
682 aa  493  9.999999999999999e-139  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0590  alpha-glucosidase  40.33 
 
 
684 aa  493  9.999999999999999e-139  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.225417  normal  0.0221919 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1876  alpha-glucosidase  39.69 
 
 
707 aa  494  9.999999999999999e-139  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.507439 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2002  alpha-glucosidase  39.5 
 
 
727 aa  488  1e-136  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2329  alpha-glucosidase  39.47 
 
 
710 aa  483  1e-135  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1931  alpha-glucosidase  38.92 
 
 
703 aa  479  1e-134  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1876  alpha-glucosidase  38.98 
 
 
703 aa  479  1e-134  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2329  alpha-glucosidase  39.33 
 
 
710 aa  477  1e-133  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.20719  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2445  alpha-glucosidase  39.33 
 
 
710 aa  479  1e-133  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.607095  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2102  alpha-glucosidase  38.98 
 
 
703 aa  479  1e-133  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.869354  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2450  alpha-glucosidase  39.41 
 
 
699 aa  475  1e-132  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2740  alpha-glucosidase  38.67 
 
 
703 aa  473  1e-132  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2017  alpha-glucosidase  39.05 
 
 
702 aa  475  1e-132  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.248833  hitchhiker  0.00490164 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0777  hypothetical protein  38.86 
 
 
606 aa  450  1e-125  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1460  Protein of unknown function DUF2223  33.22 
 
 
1255 aa  309  1.0000000000000001e-82  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3217  alpha-glucosidase, putative  28.79 
 
 
682 aa  248  2e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.751285  normal  0.432881 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0169  putative alpha-glucosidase  28.01 
 
 
656 aa  221  3e-56  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2298  putative alpha-glucosidase  27.23 
 
 
647 aa  213  7e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1628  putative alpha-glucosidase  27.37 
 
 
678 aa  211  3e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0539219  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4959  hypothetical protein  27.78 
 
 
659 aa  210  7e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5410  alpha-glucosidase, putative  27.61 
 
 
648 aa  200  6e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0179561  normal  0.0688693 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1312  putative alpha-glucosidase  25.68 
 
 
655 aa  200  7.999999999999999e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5726  Glycoside hydrolase 97  24.04 
 
 
656 aa  195  3e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.035847 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0476  alpha-glucosidase, putative, adg97A  26.51 
 
 
643 aa  184  5.0000000000000004e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.620164  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2360  putative alpha-glucosidase  26.56 
 
 
679 aa  179  2e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.103256  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3805  hypothetical protein  25 
 
 
615 aa  171  5e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0790  alpha-glucosidase  25.42 
 
 
661 aa  166  2.0000000000000002e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0155602  normal  0.344193 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2499  putative alpha-glucosidase  24.52 
 
 
674 aa  154  4e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3876  Glycoside hydrolase 97  25.62 
 
 
571 aa  154  4e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0907495  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3590  hypothetical protein  27.72 
 
 
630 aa  148  3e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.116623  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2708  hypothetical protein  24.81 
 
 
629 aa  148  3e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0314889  normal  0.739389 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1153  putative alpha-glucosidase  25.39 
 
 
574 aa  136  1.9999999999999998e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2469  Glycoside hydrolase 97  24.93 
 
 
641 aa  133  1.0000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.395097 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1419  Glycoside hydrolase 97  24.71 
 
 
648 aa  129  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.067122  normal  0.614514 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1420  hypothetical protein  23.48 
 
 
649 aa  125  3e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.828826  normal  0.205294 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2159  alpha-glucosidase, putative, adg97A  23.74 
 
 
658 aa  124  4e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0591315  hitchhiker  0.000480532 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3873  hypothetical protein  23.23 
 
 
647 aa  121  4.9999999999999996e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.437353  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>