53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4959 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_4959  hypothetical protein  100 
 
 
659 aa  1358    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0169  putative alpha-glucosidase  39.45 
 
 
656 aa  531  1e-149  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2360  putative alpha-glucosidase  42 
 
 
679 aa  520  1e-146  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.103256  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5726  Glycoside hydrolase 97  38.11 
 
 
656 aa  513  1e-144  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.035847 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1628  putative alpha-glucosidase  40.72 
 
 
678 aa  509  1e-143  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0539219  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2298  putative alpha-glucosidase  39.21 
 
 
647 aa  498  1e-139  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1312  putative alpha-glucosidase  37.42 
 
 
655 aa  494  9.999999999999999e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5410  alpha-glucosidase, putative  38.82 
 
 
648 aa  483  1e-135  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0179561  normal  0.0688693 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3217  alpha-glucosidase, putative  30.04 
 
 
682 aa  312  2e-83  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.751285  normal  0.432881 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1108  alpha-glucosidase  28.35 
 
 
676 aa  280  8e-74  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4326  hypothetical protein  29.61 
 
 
672 aa  268  2e-70  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0590  alpha-glucosidase  28.69 
 
 
684 aa  268  2e-70  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.225417  normal  0.0221919 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51780  alpha-glucosidase  29 
 
 
673 aa  263  8e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.816262  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1777  alpha-glucosidase  27.32 
 
 
697 aa  258  2e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.441918  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0058  Glycoside hydrolase 97  29.35 
 
 
693 aa  256  7e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.52966 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1876  alpha-glucosidase  27.83 
 
 
707 aa  256  7e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.507439 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23190  alpha-glucosidase  27.98 
 
 
701 aa  256  1.0000000000000001e-66  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.243429  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1019  alpha-glucosidase  27.33 
 
 
683 aa  252  2e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2445  alpha-glucosidase  27.17 
 
 
710 aa  248  2e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.607095  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2329  alpha-glucosidase  27.03 
 
 
710 aa  248  2e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1876  alpha-glucosidase  27.35 
 
 
703 aa  248  2e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1931  alpha-glucosidase  27.21 
 
 
703 aa  246  9.999999999999999e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2329  alpha-glucosidase  27.76 
 
 
710 aa  246  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.20719  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0367  putative alpha-glucosidase  26.8 
 
 
677 aa  244  3.9999999999999997e-63  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2102  alpha-glucosidase  27.07 
 
 
703 aa  244  5e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.869354  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2017  alpha-glucosidase  27.47 
 
 
702 aa  243  6e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.248833  hitchhiker  0.00490164 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2450  alpha-glucosidase  27.43 
 
 
699 aa  240  8e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2002  alpha-glucosidase  26.71 
 
 
727 aa  239  1e-61  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2740  alpha-glucosidase  27.19 
 
 
703 aa  238  2e-61  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0185  alpha-glucosidase  26.6 
 
 
680 aa  233  8.000000000000001e-60  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0777  hypothetical protein  28.89 
 
 
606 aa  233  9e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1209  hypothetical protein  26.88 
 
 
726 aa  231  4e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1892  alpha-glucosidase  25.83 
 
 
682 aa  229  1e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1394  hypothetical protein  26.85 
 
 
700 aa  226  9e-58  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.872498  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2499  putative alpha-glucosidase  27.31 
 
 
674 aa  225  2e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1400  hypothetical protein  27.08 
 
 
704 aa  213  1e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5767  putative alpha-glucosidase  26.8 
 
 
711 aa  211  2e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4429  hypothetical protein  27.78 
 
 
707 aa  210  6e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.857441  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2708  hypothetical protein  28.91 
 
 
629 aa  209  1e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0314889  normal  0.739389 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0626  alpha-glucosidase  25.68 
 
 
727 aa  208  3e-52  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0928  hypothetical protein  25.87 
 
 
728 aa  202  9.999999999999999e-51  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.453447  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1153  putative alpha-glucosidase  32.47 
 
 
574 aa  200  6e-50  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3876  Glycoside hydrolase 97  25.66 
 
 
571 aa  199  1.0000000000000001e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0907495  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1420  hypothetical protein  24.3 
 
 
649 aa  188  2e-46  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.828826  normal  0.205294 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0476  alpha-glucosidase, putative, adg97A  25.08 
 
 
643 aa  188  3e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.620164  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3590  hypothetical protein  28.52 
 
 
630 aa  172  2e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.116623  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2159  alpha-glucosidase, putative, adg97A  25.97 
 
 
658 aa  172  2e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0591315  hitchhiker  0.000480532 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0790  alpha-glucosidase  23.43 
 
 
661 aa  162  2e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0155602  normal  0.344193 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3805  hypothetical protein  24.93 
 
 
615 aa  161  4e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2469  Glycoside hydrolase 97  25.04 
 
 
641 aa  157  9e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.395097 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3873  hypothetical protein  24.01 
 
 
647 aa  137  8e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.437353  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1419  Glycoside hydrolase 97  23.55 
 
 
648 aa  135  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.067122  normal  0.614514 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1460  Protein of unknown function DUF2223  24.8 
 
 
1255 aa  132  2.0000000000000002e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>