53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_2102 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008347  Mmar10_2740  alpha-glucosidase  57.72 
 
 		 703 aa  791    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4326  hypothetical protein  47.13 
 
 		 672 aa  654    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2329  alpha-glucosidase  86.08 
 
 		 710 aa  1271    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.20719  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2450  alpha-glucosidase  87.86 
 
 		 699 aa  1280    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2445  alpha-glucosidase  85.94 
 
 		 710 aa  1270    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.607095  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1019  alpha-glucosidase  52.8 
 
 		 683 aa  699    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1876  alpha-glucosidase  71.94 
 
 		 707 aa  1053    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.507439 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2329  alpha-glucosidase  85.51 
 
 		 710 aa  1264    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1108  alpha-glucosidase  65.02 
 
 		 676 aa  879    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1931  alpha-glucosidase  97.87 
 
 		 703 aa  1432    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1777  alpha-glucosidase  72.28 
 
 		 697 aa  1046    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.441918  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2102  alpha-glucosidase  100 
 
 		 703 aa  1458    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.869354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1876  alpha-glucosidase  99.15 
 
 		 703 aa  1446    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0185  alpha-glucosidase  50.76 
 
 		 680 aa  657    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2002  alpha-glucosidase  72.25 
 
 		 727 aa  1058    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0367  putative alpha-glucosidase  50.22 
 
 		 677 aa  688    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2017  alpha-glucosidase  87.04 
 
 		 702 aa  1258    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.248833  hitchhiker  0.00490164 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0590  alpha-glucosidase  65.73 
 
 		 684 aa  947    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.225417  normal  0.0221919 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1892  alpha-glucosidase  48.85 
 
 		 682 aa  662    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51780  alpha-glucosidase  50.15 
 
 		 673 aa  627  1e-178  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.816262  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0058  Glycoside hydrolase 97  45.26 
 
 		 693 aa  580  1e-164  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.52966 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23190  alpha-glucosidase  45.52 
 
 		 701 aa  563  1.0000000000000001e-159  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.243429  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0777  hypothetical protein  45.6 
 
 		 606 aa  543  1e-153  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1394  hypothetical protein  41.32 
 
 		 700 aa  531  1e-149  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.872498  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1209  hypothetical protein  41.08 
 
 		 726 aa  523  1e-147  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5767  putative alpha-glucosidase  40.93 
 
 		 711 aa  514  1e-144  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0626  alpha-glucosidase  39.22 
 
 		 727 aa  508  9.999999999999999e-143  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4429  hypothetical protein  38.98 
 
 		 707 aa  479  1e-133  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.857441  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0928  hypothetical protein  38.23 
 
 		 728 aa  472  1.0000000000000001e-131  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.453447  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1400  hypothetical protein  36.89 
 
 		 704 aa  471  1.0000000000000001e-131  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1460  Protein of unknown function DUF2223  35.34 
 
 		 1255 aa  294  4e-78  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3217  alpha-glucosidase, putative  30.46 
 
 		 682 aa  263  8.999999999999999e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.751285  normal  0.432881 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2298  putative alpha-glucosidase  29.52 
 
 		 647 aa  259  2e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1628  putative alpha-glucosidase  28.99 
 
 		 678 aa  245  1.9999999999999999e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0539219  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1312  putative alpha-glucosidase  28.97 
 
 		 655 aa  244  3e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4959  hypothetical protein  27.07 
 
 		 659 aa  244  5e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0169  putative alpha-glucosidase  29.57 
 
 		 656 aa  237  5.0000000000000005e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5726  Glycoside hydrolase 97  28.1 
 
 		 656 aa  237  5.0000000000000005e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.035847 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5410  alpha-glucosidase, putative  30.09 
 
 		 648 aa  235  2.0000000000000002e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0179561  normal  0.0688693 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2360  putative alpha-glucosidase  28.65 
 
 		 679 aa  225  2e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.103256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3805  hypothetical protein  26.24 
 
 		 615 aa  204  6e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3876  Glycoside hydrolase 97  26.32 
 
 		 571 aa  157  5.0000000000000005e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0907495  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2159  alpha-glucosidase, putative, adg97A  27.37 
 
 		 658 aa  151  3e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0591315  hitchhiker  0.000480532 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3590  hypothetical protein  25.66 
 
 		 630 aa  151  4e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.116623  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0476  alpha-glucosidase, putative, adg97A  26.8 
 
 		 643 aa  150  1.0000000000000001e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.620164  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1420  hypothetical protein  24.41 
 
 		 649 aa  144  5e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.828826  normal  0.205294 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2708  hypothetical protein  24.18 
 
 		 629 aa  140  7.999999999999999e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0314889  normal  0.739389 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1153  putative alpha-glucosidase  24.17 
 
 		 574 aa  137  6.0000000000000005e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2499  putative alpha-glucosidase  25.34 
 
 		 674 aa  127  7e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0790  alpha-glucosidase  24.61 
 
 		 661 aa  120  9.999999999999999e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0155602  normal  0.344193 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2469  Glycoside hydrolase 97  24.24 
 
 		 641 aa  110  7.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.395097 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1419  Glycoside hydrolase 97  22.77 
 
 		 648 aa  97.1  9e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.067122  normal  0.614514 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3873  hypothetical protein  22.08 
 
 		 647 aa  95.1  4e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.437353  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>