53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0169 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_0169  putative alpha-glucosidase  100 
 
 
656 aa  1345    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1628  putative alpha-glucosidase  48.36 
 
 
678 aa  633  1e-180  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0539219  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5410  alpha-glucosidase, putative  47.35 
 
 
648 aa  629  1e-179  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0179561  normal  0.0688693 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2360  putative alpha-glucosidase  44.22 
 
 
679 aa  588  1e-167  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.103256  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2298  putative alpha-glucosidase  42.77 
 
 
647 aa  538  1e-151  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4959  hypothetical protein  39.45 
 
 
659 aa  531  1e-149  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1312  putative alpha-glucosidase  41.6 
 
 
655 aa  519  1e-146  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5726  Glycoside hydrolase 97  41.68 
 
 
656 aa  505  1e-141  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.035847 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3217  alpha-glucosidase, putative  37.69 
 
 
682 aa  357  3.9999999999999996e-97  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.751285  normal  0.432881 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0058  Glycoside hydrolase 97  33.87 
 
 
693 aa  290  5.0000000000000004e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.52966 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4326  hypothetical protein  29.94 
 
 
672 aa  287  5e-76  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1019  alpha-glucosidase  33.33 
 
 
683 aa  274  4.0000000000000004e-72  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1777  alpha-glucosidase  31.37 
 
 
697 aa  273  1e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.441918  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23190  alpha-glucosidase  30.83 
 
 
701 aa  269  1e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.243429  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0367  putative alpha-glucosidase  32.45 
 
 
677 aa  266  1e-69  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1108  alpha-glucosidase  30.6 
 
 
676 aa  265  2e-69  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2002  alpha-glucosidase  30.39 
 
 
727 aa  262  2e-68  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0590  alpha-glucosidase  29.41 
 
 
684 aa  257  4e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.225417  normal  0.0221919 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1876  alpha-glucosidase  29.65 
 
 
707 aa  254  3e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.507439 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3876  Glycoside hydrolase 97  32.08 
 
 
571 aa  253  7e-66  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0907495  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2740  alpha-glucosidase  32.18 
 
 
703 aa  248  2e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1931  alpha-glucosidase  29.47 
 
 
703 aa  246  6.999999999999999e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51780  alpha-glucosidase  30.47 
 
 
673 aa  246  9e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.816262  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1394  hypothetical protein  29.7 
 
 
700 aa  246  9.999999999999999e-64  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.872498  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1876  alpha-glucosidase  29.61 
 
 
703 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2329  alpha-glucosidase  29.5 
 
 
710 aa  244  3e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.20719  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2329  alpha-glucosidase  29.5 
 
 
710 aa  243  7.999999999999999e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2445  alpha-glucosidase  29.59 
 
 
710 aa  243  1e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.607095  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1153  putative alpha-glucosidase  32.5 
 
 
574 aa  242  2e-62  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1209  hypothetical protein  27.9 
 
 
726 aa  238  2e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2017  alpha-glucosidase  29.44 
 
 
702 aa  238  2e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.248833  hitchhiker  0.00490164 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2102  alpha-glucosidase  29.57 
 
 
703 aa  237  5.0000000000000005e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.869354  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2450  alpha-glucosidase  29.35 
 
 
699 aa  234  5e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1892  alpha-glucosidase  28.86 
 
 
682 aa  227  4e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0777  hypothetical protein  28.95 
 
 
606 aa  227  6e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5767  putative alpha-glucosidase  28.88 
 
 
711 aa  226  1e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1400  hypothetical protein  26.98 
 
 
704 aa  224  4.9999999999999996e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0626  alpha-glucosidase  26.21 
 
 
727 aa  223  9e-57  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4429  hypothetical protein  28.01 
 
 
707 aa  221  1.9999999999999999e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.857441  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2708  hypothetical protein  27.4 
 
 
629 aa  221  3.9999999999999997e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0314889  normal  0.739389 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0185  alpha-glucosidase  29.04 
 
 
680 aa  219  1e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0476  alpha-glucosidase, putative, adg97A  29.1 
 
 
643 aa  204  4e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.620164  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2499  putative alpha-glucosidase  26.73 
 
 
674 aa  204  6e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3590  hypothetical protein  27.82 
 
 
630 aa  202  9.999999999999999e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.116623  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3805  hypothetical protein  26.09 
 
 
615 aa  197  4.0000000000000005e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0928  hypothetical protein  25.87 
 
 
728 aa  192  1e-47  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.453447  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1420  hypothetical protein  25.8 
 
 
649 aa  182  2e-44  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.828826  normal  0.205294 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0790  alpha-glucosidase  25.72 
 
 
661 aa  171  3e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0155602  normal  0.344193 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2469  Glycoside hydrolase 97  24.33 
 
 
641 aa  166  1.0000000000000001e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.395097 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2159  alpha-glucosidase, putative, adg97A  30.81 
 
 
658 aa  162  1e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0591315  hitchhiker  0.000480532 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3873  hypothetical protein  24.08 
 
 
647 aa  144  4e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.437353  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1460  Protein of unknown function DUF2223  28.26 
 
 
1255 aa  143  8e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1419  Glycoside hydrolase 97  23.97 
 
 
648 aa  133  1.0000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.067122  normal  0.614514 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>