53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1892 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009052  Sbal_2329  alpha-glucosidase  49.56 
 
 		 710 aa  664    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2445  alpha-glucosidase  49.85 
 
 		 710 aa  667    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.607095  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2450  alpha-glucosidase  49.41 
 
 		 699 aa  660    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2329  alpha-glucosidase  49.41 
 
 		 710 aa  663    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.20719  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1019  alpha-glucosidase  52.98 
 
 		 683 aa  701    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2017  alpha-glucosidase  49.56 
 
 		 702 aa  664    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.248833  hitchhiker  0.00490164 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1876  alpha-glucosidase  49.05 
 
 		 707 aa  657    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.507439 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1931  alpha-glucosidase  49.56 
 
 		 703 aa  669    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2740  alpha-glucosidase  49.7 
 
 		 703 aa  648    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1777  alpha-glucosidase  47.54 
 
 		 697 aa  637    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.441918  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1876  alpha-glucosidase  49.14 
 
 		 703 aa  669    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1892  alpha-glucosidase  100 
 
 		 682 aa  1405    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0590  alpha-glucosidase  48.76 
 
 		 684 aa  653    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.225417  normal  0.0221919 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0185  alpha-glucosidase  75.88 
 
 		 680 aa  1052    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2102  alpha-glucosidase  48.85 
 
 		 703 aa  662    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.869354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2002  alpha-glucosidase  48.16 
 
 		 727 aa  634  1e-180  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1108  alpha-glucosidase  49.47 
 
 		 676 aa  629  1e-179  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0367  putative alpha-glucosidase  46.71 
 
 		 677 aa  627  1e-178  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4326  hypothetical protein  44.46 
 
 		 672 aa  592  1e-168  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51780  alpha-glucosidase  43.95 
 
 		 673 aa  545  1e-153  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.816262  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23190  alpha-glucosidase  43.2 
 
 		 701 aa  531  1e-149  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.243429  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1394  hypothetical protein  38.85 
 
 		 700 aa  498  1e-139  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.872498  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0777  hypothetical protein  41.42 
 
 		 606 aa  493  9.999999999999999e-139  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4429  hypothetical protein  39.94 
 
 		 707 aa  493  9.999999999999999e-139  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.857441  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0058  Glycoside hydrolase 97  38.77 
 
 		 693 aa  489  1e-137  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.52966 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0626  alpha-glucosidase  38.49 
 
 		 727 aa  482  1e-135  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1209  hypothetical protein  39.22 
 
 		 726 aa  481  1e-134  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1400  hypothetical protein  37.62 
 
 		 704 aa  477  1e-133  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0928  hypothetical protein  38.08 
 
 		 728 aa  473  1e-132  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.453447  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5767  putative alpha-glucosidase  38.79 
 
 		 711 aa  469  1.0000000000000001e-131  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1460  Protein of unknown function DUF2223  35.47 
 
 		 1255 aa  311  4e-83  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3217  alpha-glucosidase, putative  27.86 
 
 		 682 aa  236  1.0000000000000001e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.751285  normal  0.432881 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4959  hypothetical protein  25.83 
 
 		 659 aa  229  1e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1312  putative alpha-glucosidase  27.48 
 
 		 655 aa  228  2e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5726  Glycoside hydrolase 97  27.89 
 
 		 656 aa  228  3e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.035847 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0169  putative alpha-glucosidase  28.86 
 
 		 656 aa  227  5.0000000000000005e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2298  putative alpha-glucosidase  27.33 
 
 		 647 aa  223  9.999999999999999e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1628  putative alpha-glucosidase  26.37 
 
 		 678 aa  207  4e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0539219  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3805  hypothetical protein  25.83 
 
 		 615 aa  200  9e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5410  alpha-glucosidase, putative  26.18 
 
 		 648 aa  192  1e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0179561  normal  0.0688693 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2360  putative alpha-glucosidase  27.81 
 
 		 679 aa  192  2.9999999999999997e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.103256  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0476  alpha-glucosidase, putative, adg97A  27.96 
 
 		 643 aa  179  2e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.620164  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3590  hypothetical protein  26.79 
 
 		 630 aa  161  4e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.116623  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3876  Glycoside hydrolase 97  26.64 
 
 		 571 aa  145  3e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0907495  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2159  alpha-glucosidase, putative, adg97A  25.37 
 
 		 658 aa  144  4e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0591315  hitchhiker  0.000480532 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0790  alpha-glucosidase  24.57 
 
 		 661 aa  140  1e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0155602  normal  0.344193 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2708  hypothetical protein  25.43 
 
 		 629 aa  139  2e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0314889  normal  0.739389 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1153  putative alpha-glucosidase  28.05 
 
 		 574 aa  137  8e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1420  hypothetical protein  25.96 
 
 		 649 aa  133  7.999999999999999e-30  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.828826  normal  0.205294 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2499  putative alpha-glucosidase  22.54 
 
 		 674 aa  127  1e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2469  Glycoside hydrolase 97  23.55 
 
 		 641 aa  113  1.0000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.395097 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1419  Glycoside hydrolase 97  23.37 
 
 		 648 aa  108  3e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.067122  normal  0.614514 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3873  hypothetical protein  22.43 
 
 		 647 aa  101  4e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.437353  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>