53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_3876 on replicon NC_013744
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013744  Htur_3876  Glycoside hydrolase 97  100 
 
 
571 aa  1143    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0907495  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1153  putative alpha-glucosidase  71.95 
 
 
574 aa  841    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0476  alpha-glucosidase, putative, adg97A  36.42 
 
 
643 aa  321  1.9999999999999998e-86  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.620164  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0790  alpha-glucosidase  32.32 
 
 
661 aa  313  5.999999999999999e-84  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0155602  normal  0.344193 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2159  alpha-glucosidase, putative, adg97A  30.83 
 
 
658 aa  277  4e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0591315  hitchhiker  0.000480532 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2298  putative alpha-glucosidase  31.22 
 
 
647 aa  274  4.0000000000000004e-72  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2499  putative alpha-glucosidase  31.14 
 
 
674 aa  266  7e-70  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2469  Glycoside hydrolase 97  31.97 
 
 
641 aa  263  4.999999999999999e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.395097 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1628  putative alpha-glucosidase  30.56 
 
 
678 aa  253  6e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0539219  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0169  putative alpha-glucosidase  32.08 
 
 
656 aa  253  6e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2360  putative alpha-glucosidase  30.87 
 
 
679 aa  246  6e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.103256  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1419  Glycoside hydrolase 97  30.96 
 
 
648 aa  240  5.999999999999999e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.067122  normal  0.614514 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3873  hypothetical protein  27.23 
 
 
647 aa  236  9e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.437353  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2708  hypothetical protein  27.89 
 
 
629 aa  226  6e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0314889  normal  0.739389 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5410  alpha-glucosidase, putative  28.96 
 
 
648 aa  217  4e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0179561  normal  0.0688693 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3217  alpha-glucosidase, putative  30.16 
 
 
682 aa  217  5e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.751285  normal  0.432881 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1420  hypothetical protein  27.99 
 
 
649 aa  206  9e-52  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.828826  normal  0.205294 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5726  Glycoside hydrolase 97  28.19 
 
 
656 aa  205  2e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.035847 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4959  hypothetical protein  25.66 
 
 
659 aa  199  1.0000000000000001e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1312  putative alpha-glucosidase  30.63 
 
 
655 aa  196  7e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3590  hypothetical protein  28.8 
 
 
630 aa  196  9e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.116623  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4326  hypothetical protein  26.73 
 
 
672 aa  185  2.0000000000000003e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0367  putative alpha-glucosidase  27.26 
 
 
677 aa  182  1e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1876  alpha-glucosidase  28.03 
 
 
707 aa  181  2e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.507439 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0058  Glycoside hydrolase 97  26.27 
 
 
693 aa  175  1.9999999999999998e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.52966 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0185  alpha-glucosidase  27.66 
 
 
680 aa  172  1e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51780  alpha-glucosidase  25.74 
 
 
673 aa  168  2.9999999999999998e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.816262  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23190  alpha-glucosidase  28.11 
 
 
701 aa  166  8e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.243429  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0777  hypothetical protein  25.17 
 
 
606 aa  164  5.0000000000000005e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2740  alpha-glucosidase  28.68 
 
 
703 aa  162  2e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2445  alpha-glucosidase  27.55 
 
 
710 aa  161  3e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.607095  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2329  alpha-glucosidase  27.7 
 
 
710 aa  161  3e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.20719  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2329  alpha-glucosidase  27.51 
 
 
710 aa  160  7e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2017  alpha-glucosidase  27.36 
 
 
702 aa  158  2e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.248833  hitchhiker  0.00490164 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2002  alpha-glucosidase  27.07 
 
 
727 aa  158  3e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2102  alpha-glucosidase  26.32 
 
 
703 aa  157  4e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.869354  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1876  alpha-glucosidase  26.6 
 
 
703 aa  155  1e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2450  alpha-glucosidase  26.33 
 
 
699 aa  156  1e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4429  hypothetical protein  25.62 
 
 
707 aa  154  2.9999999999999998e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.857441  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1019  alpha-glucosidase  28.97 
 
 
683 aa  154  4e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1394  hypothetical protein  24.67 
 
 
700 aa  153  7e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.872498  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1931  alpha-glucosidase  26.29 
 
 
703 aa  153  8e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1777  alpha-glucosidase  25.19 
 
 
697 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.441918  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1108  alpha-glucosidase  26.92 
 
 
676 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1400  hypothetical protein  23.36 
 
 
704 aa  147  4.0000000000000006e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1209  hypothetical protein  22.59 
 
 
726 aa  147  7.0000000000000006e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1892  alpha-glucosidase  26.64 
 
 
682 aa  145  2e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0928  hypothetical protein  24.36 
 
 
728 aa  142  1.9999999999999998e-32  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.453447  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0626  alpha-glucosidase  26.41 
 
 
727 aa  137  8e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5767  putative alpha-glucosidase  23.12 
 
 
711 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0590  alpha-glucosidase  24.78 
 
 
684 aa  134  3.9999999999999996e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.225417  normal  0.0221919 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3805  hypothetical protein  22.29 
 
 
615 aa  127  7e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1460  Protein of unknown function DUF2223  25.16 
 
 
1255 aa  83.2  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>